Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G513900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QQN8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G487250 - -
2 Sobic.004G190800 galactosyltransferase family protein, putative, expressed K14413: beta-1,3-galactosyltransferase
3 Sobic.008G024700 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G360701 - -
5 Sobic.005G204900 Lipase class 3 family protein (At)(PubMedID : 27208977)@lipase class 3 family protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G191400 zinc finger C3HC4 type family protein, putative, expressed K10695: E3 ubiquitin-protein ligase RNF1/2
7 Sobic.001G060200 - -
8 Sobic.009G049100 - -
9 Sobic.003G106100 expressed protein -
10 Sobic.008G096300 - -
11 Sobic.004G230800 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@cytokinin-O-glucosyltransferase 2, putative, expressed -
12 Sobic.002G142350 - -
13 Sobic.003G030200 phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, putative, expressed K01598: PPCDC, phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
14 Sobic.005G155001 - -
15 Sobic.009G184500 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G527900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, putative, expressed K03626: EGD2, nascent polypeptide-associated complex subunit alpha
17 Sobic.004G314100 GS9(Ortholog in rice:Zhao et al.(2018))(PubMedID : 31659890)@expressed protein -
18 Sobic.004G288900 protein kinase, putative, expressed -
19 Sobic.010G021401 - -
20 Sobic.007G213500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G513900 Sobic001G513900 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic001G513900--Sobic001G487250 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic001G513900--Sobic004G190800 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic001G513900--Sobic008G024700 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic001G513900--Sobic002G360701 Sobic005G204900 Sobic005G204900 Sobic001G513900--Sobic005G204900 Sobic001G191400 Sobic001G191400 Sobic001G513900--Sobic001G191400 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic001G513900--Sobic001G060200 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic001G513900--Sobic009G049100 Sobic003G106100 Sobic003G106100 Sobic001G513900--Sobic003G106100 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic001G487250--Sobic003G155350 Sobic001G487250--Sobic001G513900 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic001G487250--Sobic009G144050 Sobic004G230800 Sobic004G230800 Sobic001G487250--Sobic004G230800 Sobic001G487250--Sobic008G024700 Sobic009G004300 Sobic009G004300 Sobic001G487250--Sobic009G004300 Sobic001G487250--Sobic002G360701 Sobic005G139000 Sobic005G139000 Sobic001G487250--Sobic005G139000 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic001G487250--Sobic004G184500 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic004G190800--Sobic002G013600 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic004G190800--Sobic001G312801 Sobic004G190800--Sobic009G049100 Sobic004G190800--Sobic002G360701 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic004G190800--Sobic007G061500 Sobic001G350800 Sobic001G350800 Sobic004G190800--Sobic001G350800 Sobic004G314100 Sobic004G314100 Sobic004G190800--Sobic004G314100 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic004G190800--Sobic004G288900 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic004G190800--Sobic002G346250 Sobic008G024700--Sobic009G049100 Sobic001G460150 Sobic001G460150 Sobic008G024700--Sobic001G460150 Sobic008G024700--Sobic004G190800 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic008G024700--Sobic006G121200 Sobic008G024700--Sobic002G360701 Sobic003G336300 Sobic003G336300 Sobic008G024700--Sobic003G336300 Sobic008G024700--Sobic001G513900 Sobic008G024700--Sobic001G487250 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic008G024700--Sobic004G223350 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic002G360701--Sobic009G184500 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic002G360701--Sobic001G483200 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic002G360701--Sobic007G017300 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic002G360701--Sobic005G155001 Sobic002G360701--Sobic004G190800 Sobic007G213500 Sobic007G213500 Sobic002G360701--Sobic007G213500 Sobic001G361750 Sobic001G361750 Sobic002G360701--Sobic001G361750 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic002G360701--Sobic001G468200 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic002G360701--Sobic001G368000 Sobic005G204900--Sobic001G191400 Sobic005G204900--Sobic001G513900 Sobic003G030200 Sobic003G030200 Sobic005G204900--Sobic003G030200 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic005G204900--Sobic001G490600 Sobic009G020800 Sobic009G020800 Sobic005G204900--Sobic009G020800 Sobic005G204900--Sobic009G184500 Sobic010G150600 Sobic010G150600 Sobic005G204900--Sobic010G150600 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic005G204900--Sobic008G096300 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic005G204900--Sobic001G400101 Sobic004G337700 Sobic004G337700 Sobic001G191400--Sobic004G337700 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic001G191400--Sobic007G090406 Sobic001G191400--Sobic005G155001 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic001G191400--Sobic009G114900 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic001G191400--Sobic010G021401 Sobic001G191400--Sobic003G030200 Sobic001G191400--Sobic005G204900 Sobic001G341900 Sobic001G341900 Sobic001G191400--Sobic001G341900 Sobic001G191400--Sobic001G490600 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic001G060200--Sobic009G004500 Sobic001G028500 Sobic001G028500 Sobic001G060200--Sobic001G028500 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic001G060200--Sobic003G093500 Sobic001G060200--Sobic007G061500 Sobic001G060200--Sobic005G155001 Sobic001G060200--Sobic003G106100 Sobic001G527900 Sobic001G527900 Sobic001G060200--Sobic001G527900 Sobic001G060200--Sobic007G017300 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic001G060200--Sobic004G224100 Sobic009G049100--Sobic008G024700 Sobic009G049100--Sobic001G460150 Sobic009G049100--Sobic003G336300 Sobic009G049100--Sobic004G190800 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic009G049100--Sobic004G144300 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic009G049100--Sobic009G252500 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic009G049100--Sobic003G298000 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic009G049100--Sobic004G310400 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic009G049100--Sobic007G046600 Sobic003G106100--Sobic004G314100 Sobic003G106100--Sobic001G028500 Sobic004G231501 Sobic004G231501 Sobic003G106100--Sobic004G231501 Sobic003G106100--Sobic007G061500 Sobic001G104100 Sobic001G104100 Sobic003G106100--Sobic001G104100 Sobic003G106100--Sobic007G213500 Sobic009G199900 Sobic009G199900 Sobic003G106100--Sobic009G199900 Sobic003G106100--Sobic001G060200 Sobic004G026000 Sobic004G026000 Sobic003G106100--Sobic004G026000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.