Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G024700.2
Synonym Sb08g002150
Functional annotation DUF567 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5YR58 , Q84YD7
Pfam PF04525
Panther DB PTHR31087 PTHR31087:SF23
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G41590 : Protein of unknown function (DUF567)
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g02760.1 : DUF567 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053772 , Zm00025a053778 , Zm00025a033327 , Zm00025a029003
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G046160.4 , HORVU5Hr1G046160.2 , HORVU5Hr1G046160.3 , HORVU5Hr1G046160.1 , HORVU5Hr1G046140.1 , HORVU5Hr1G046140.2
Wheat TraesCS5A02G144800 , TraesCS5A02G145000 , TraesCS5D02G147500 , TraesCS5D02G147400 , TraesCS5B02G143700 , TraesCS5B02G143600
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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13 Sobic.004G071401 - K03234: elongation factor 2
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15 Sobic.002G346250 - -
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17 Sobic.003G155350 - -
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19 Sobic.001G350800 - -
20 Sobic.009G235100 GTP-binding protein, putative, expressed K03595: era, GTPase


Gene co-expression network
sample Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic008G024700--Sobic009G049100 Sobic001G460150 Sobic001G460150 Sobic008G024700--Sobic001G460150 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic008G024700--Sobic004G190800 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic008G024700--Sobic006G121200 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic008G024700--Sobic002G360701 Sobic003G336300 Sobic003G336300 Sobic008G024700--Sobic003G336300 Sobic001G513900 Sobic001G513900 Sobic008G024700--Sobic001G513900 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic008G024700--Sobic001G487250 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic008G024700--Sobic004G223350 Sobic009G049100--Sobic008G024700 Sobic009G049100--Sobic001G460150 Sobic009G049100--Sobic003G336300 Sobic009G049100--Sobic004G190800 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic009G049100--Sobic004G144300 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic009G049100--Sobic009G252500 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic009G049100--Sobic003G298000 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic009G049100--Sobic004G310400 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic009G049100--Sobic007G046600 Sobic001G460150--Sobic009G049100 Sobic001G460150--Sobic008G024700 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic001G460150--Sobic004G258450 Sobic001G460150--Sobic003G336300 Sobic010G084900 Sobic010G084900 Sobic001G460150--Sobic010G084900 Sobic001G460150--Sobic004G190800 Sobic001G460150--Sobic004G144300 Sobic001G460150--Sobic007G046600 Sobic001G460150--Sobic003G298000 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic004G190800--Sobic002G013600 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic004G190800--Sobic001G312801 Sobic004G190800--Sobic009G049100 Sobic004G190800--Sobic002G360701 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic004G190800--Sobic007G061500 Sobic001G350800 Sobic001G350800 Sobic004G190800--Sobic001G350800 Sobic004G314100 Sobic004G314100 Sobic004G190800--Sobic004G314100 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic004G190800--Sobic004G288900 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic004G190800--Sobic002G346250 Sobic007G213500 Sobic007G213500 Sobic006G121200--Sobic007G213500 Sobic004G026000 Sobic004G026000 Sobic006G121200--Sobic004G026000 Sobic006G121200--Sobic004G314100 Sobic006G121200--Sobic004G310400 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic006G121200--Sobic001G468200 Sobic001G071700 Sobic001G071700 Sobic006G121200--Sobic001G071700 Sobic009G235100 Sobic009G235100 Sobic006G121200--Sobic009G235100 Sobic002G123700 Sobic002G123700 Sobic006G121200--Sobic002G123700 Sobic006G121200--Sobic007G061500 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic002G360701--Sobic009G184500 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic002G360701--Sobic001G483200 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic002G360701--Sobic007G017300 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic002G360701--Sobic005G155001 Sobic002G360701--Sobic004G190800 Sobic002G360701--Sobic007G213500 Sobic001G361750 Sobic001G361750 Sobic002G360701--Sobic001G361750 Sobic002G360701--Sobic001G468200 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic002G360701--Sobic001G368000 Sobic003G336300--Sobic009G049100 Sobic003G336300--Sobic004G258450 Sobic003G336300--Sobic001G460150 Sobic003G336300--Sobic004G310400 Sobic003G336300--Sobic004G144300 Sobic003G336300--Sobic008G024700 Sobic003G336300--Sobic006G121200 Sobic003G336300--Sobic003G298000 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic003G336300--Sobic003G399800 Sobic001G513900--Sobic001G487250 Sobic001G513900--Sobic004G190800 Sobic001G513900--Sobic008G024700 Sobic001G513900--Sobic002G360701 Sobic005G204900 Sobic005G204900 Sobic001G513900--Sobic005G204900 Sobic001G191400 Sobic001G191400 Sobic001G513900--Sobic001G191400 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic001G513900--Sobic001G060200 Sobic001G513900--Sobic009G049100 Sobic003G106100 Sobic003G106100 Sobic001G513900--Sobic003G106100 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic001G487250--Sobic003G155350 Sobic001G487250--Sobic001G513900 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic001G487250--Sobic009G144050 Sobic004G230800 Sobic004G230800 Sobic001G487250--Sobic004G230800 Sobic001G487250--Sobic008G024700 Sobic009G004300 Sobic009G004300 Sobic001G487250--Sobic009G004300 Sobic001G487250--Sobic002G360701 Sobic005G139000 Sobic005G139000 Sobic001G487250--Sobic005G139000 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic001G487250--Sobic004G184500 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic004G223350--Sobic007G173901 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic004G223350--Sobic008G086100 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic004G223350--Sobic002G008701 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic002G346250 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic004G223350--Sobic003G241600 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic004G223350--Sobic002G142350 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic004G223350--Sobic001G296600 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic004G223350--Sobic008G096300
Octagon: transcription factors


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