Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G173901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RBA2
Pfam PF03087
Panther DB PTHR33070 PTHR33070:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17080 : Arabidopsis protein of unknown function (DUF241)
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g43870.1 : carrier, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT68556 , PNT68555 , KQJ86383
Barley HORVU7Hr1G057970.3 , HORVU7Hr1G057970.2 , HORVU7Hr1G057970.4
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G223350 - -
2 Sobic.008G086100 - -
3 Sobic.002G262500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@osFTL4 FT-Like4 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
4 Sobic.001G296600 - -
5 Sobic.008G024700 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G175600 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -
7 Sobic.002G008701 - -
8 Sobic.001G062400 - -
9 Sobic.002G346250 - -
10 Sobic.004G071401 - K03234: elongation factor 2
11 Sobic.008G112400 - -
12 Sobic.005G027032 - -
13 Sobic.007G174701 - -
14 Sobic.002G312600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G460150 - -
16 Sobic.002G360701 - -
17 Sobic.007G119300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@endoglucanase, putative, expressed -
18 Sobic.008G166250 - -
19 Sobic.007G203850 - -
20 Sobic.008G096300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic007G173901--Sobic004G223350 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic007G173901--Sobic008G086100 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic007G173901--Sobic002G262500 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic007G173901--Sobic001G296600 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic007G173901--Sobic008G024700 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic007G173901--Sobic008G175600 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic007G173901--Sobic002G008701 Sobic001G062400 Sobic001G062400 Sobic007G173901--Sobic001G062400 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic007G173901--Sobic002G346250 Sobic004G223350--Sobic007G173901 Sobic004G223350--Sobic008G086100 Sobic004G223350--Sobic002G008701 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic002G346250 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic004G223350--Sobic003G241600 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic004G223350--Sobic002G142350 Sobic004G223350--Sobic001G296600 Sobic008G096300 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Sobic002G346250--Sobic004G288900 Sobic002G346250--Sobic004G223350
Octagon: transcription factors


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