Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G262500.1,Sobic.002G262500.4,Sobic.002G262500.2,Sobic.002G262500.3
Synonym Sb02g029725, FT
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
osFTL4 FT-Like4 homologous to Flowering Locus T gene
contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed
UniProt A0A1W0W5U2 , A0A1B6QDK5 , A0A1W0W5Z2
Pfam PF01161
Panther DB PTHR11362 PTHR11362:SF40
NCBI CDD KOG3346; Phosphatidylethanolamine binding protein
KEGG Orthology K16223; protein FLOWERING LOCUS T
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65480 : PEBP (phosphatidylethanolamine-binding protein) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g33850.1 : osFTL4 FT-Like4 homologous to Flowering Locus T gene; contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014336 , Zm00025a047638
Brachypodium PNT64922
Barley HORVU5Hr1G078310.14 , HORVU5Hr1G078310.15
Wheat TraesCS5D02G304400 , TraesCS5A02G297300 , TraesCS5A02G297300 , TraesCS5A02G297300 , TraesCS5B02G296600
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G427201 - -
2 Sobic.007G173901 - -
3 Sobic.008G086100 - -
4 Sobic.006G242600 RIPER9 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
5 Sobic.010G217466 - -
6 Sobic.005G027032 - -
7 Sobic.009G221701 - -
8 Sobic.001G062400 - -
9 Sobic.002G429200 expressed protein -
10 Sobic.001G004901 - -
11 Sobic.001G296600 - -
12 Sobic.002G312600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G223350 - -
14 Sobic.007G044350 - -
15 Sobic.003G396400 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G174701 - -
17 Sobic.004G071401 - K03234: elongation factor 2
18 Sobic.002G375600 expressed protein -
19 Sobic.007G206600 - -
20 Sobic.002G189350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic002G427201 Sobic002G427201 Sobic002G262500--Sobic002G427201 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic002G262500--Sobic007G173901 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic002G262500--Sobic008G086100 Sobic006G242600 Sobic006G242600 Sobic002G262500--Sobic006G242600 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic002G262500--Sobic010G217466 Sobic005G027032 Sobic005G027032 Sobic002G262500--Sobic005G027032 Sobic009G221701 Sobic009G221701 Sobic002G262500--Sobic009G221701 Sobic001G062400 Sobic001G062400 Sobic002G262500--Sobic001G062400 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic002G262500--Sobic002G429200 Sobic002G427201--Sobic002G262500 Sobic001G396550 Sobic001G396550 Sobic002G427201--Sobic001G396550 Sobic002G427201--Sobic006G242600 Sobic001G004901 Sobic001G004901 Sobic002G427201--Sobic001G004901 Sobic003G396400 Sobic003G396400 Sobic002G427201--Sobic003G396400 Sobic002G427201--Sobic010G217466 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic002G427201--Sobic002G375600 Sobic002G427201--Sobic002G429200 Sobic002G427201--Sobic009G221701 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic007G173901--Sobic004G223350 Sobic007G173901--Sobic008G086100 Sobic007G173901--Sobic002G262500 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic007G173901--Sobic001G296600 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic007G173901--Sobic008G024700 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic007G173901--Sobic008G175600 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic007G173901--Sobic002G008701 Sobic007G173901--Sobic001G062400 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic007G173901--Sobic002G346250 Sobic008G086100--Sobic004G223350 Sobic008G086100--Sobic007G173901 Sobic007G174701 Sobic007G174701 Sobic008G086100--Sobic007G174701 Sobic008G086100--Sobic002G262500 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic008G086100--Sobic008G096300 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic008G086100--Sobic001G400101 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic008G086100--Sobic002G142350 Sobic008G086100--Sobic008G175600 Sobic007G206600 Sobic007G206600 Sobic008G086100--Sobic007G206600 Sobic006G242600--Sobic003G396400 Sobic006G242600--Sobic009G221701 Sobic010G149900 Sobic010G149900 Sobic006G242600--Sobic010G149900 Sobic006G242600--Sobic010G217466 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic006G242600--Sobic006G214101 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic006G242600--Sobic005G106800 Sobic002G410050 Sobic002G410050 Sobic006G242600--Sobic002G410050 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic006G242600--Sobic002G149550 Sobic006G242600--Sobic002G429200 Sobic010G217466--Sobic009G221701 Sobic010G217466--Sobic002G149550 Sobic010G217466--Sobic006G242600 Sobic010G217466--Sobic003G396400 Sobic010G217466--Sobic002G429200 Sobic006G116600 Sobic006G116600 Sobic010G217466--Sobic006G116600 Sobic002G285950 Sobic002G285950 Sobic010G217466--Sobic002G285950 Sobic010G217466--Sobic010G149900 Sobic001G378150 Sobic001G378150 Sobic010G217466--Sobic001G378150 Sobic004G357066 Sobic004G357066 Sobic005G027032--Sobic004G357066 Sobic005G027032--Sobic001G062400 Sobic004G357033 Sobic004G357033 Sobic005G027032--Sobic004G357033 Sobic004G344301 Sobic004G344301 Sobic005G027032--Sobic004G344301 Sobic010G096801 Sobic010G096801 Sobic005G027032--Sobic010G096801 Sobic001G206800 Sobic001G206800 Sobic005G027032--Sobic001G206800 Sobic001G261553 Sobic001G261553 Sobic005G027032--Sobic001G261553 Sobic004G225450 Sobic004G225450 Sobic005G027032--Sobic004G225450 Sobic001G220200 Sobic001G220200 Sobic005G027032--Sobic001G220200 Sobic009G221701--Sobic010G217466 Sobic009G221701--Sobic002G149550 Sobic009G221701--Sobic006G242600 Sobic009G221701--Sobic002G429200 Sobic009G221701--Sobic003G396400 Sobic009G221701--Sobic005G106800 Sobic003G299400 Sobic003G299400 Sobic009G221701--Sobic003G299400 Sobic009G221701--Sobic002G285950 Sobic009G221701--Sobic006G116600 Sobic001G062400--Sobic005G027032 Sobic001G062400--Sobic004G357066 Sobic001G062400--Sobic004G344301 Sobic001G062400--Sobic004G357033 Sobic001G062400--Sobic004G225450 Sobic001G543600 Sobic001G543600 Sobic001G062400--Sobic001G543600 Sobic006G103601 Sobic006G103601 Sobic001G062400--Sobic006G103601 Sobic001G062400--Sobic001G261553 Sobic006G109850 Sobic006G109850 Sobic001G062400--Sobic006G109850 Sobic002G429200--Sobic002G375600 Sobic003G292800 Sobic003G292800 Sobic002G429200--Sobic003G292800 Sobic002G429200--Sobic009G221701 Sobic005G230600 Sobic005G230600 Sobic002G429200--Sobic005G230600 Sobic002G189350 Sobic002G189350 Sobic002G429200--Sobic002G189350 Sobic002G429200--Sobic010G217466 Sobic002G429200--Sobic006G242600 Sobic008G175700 Sobic008G175700 Sobic002G429200--Sobic008G175700 Sobic003G013400 Sobic003G013400 Sobic002G429200--Sobic003G013400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.