Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G206600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PJ03
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G174701 - -
2 Sobic.008G086100 - -
3 Sobic.006G119100 expressed protein -
4 Sobic.002G142350 - -
5 Sobic.001G487250 - -
6 Sobic.003G276700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in flower, expression induced by IAA and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@auxin efflux carrier component, putative, expressed K13947: auxin efflux carrier family protein
7 Sobic.003G096400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein kinase domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G011001 - -
9 Sobic.004G223350 - -
10 Sobic.002G380150 - -
11 Sobic.002G262500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@osFTL4 FT-Like4 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
12 Sobic.007G044350 - -
13 Sobic.007G038200 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
14 Sobic.009G144050 - -
15 Sobic.006G109850 - -
16 Sobic.007G081400 - -
17 Sobic.008G024700 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.007G173901 - -
19 Sobic.002G427201 - -
20 Sobic.008G175600 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G206600 Sobic007G206600 Sobic007G174701 Sobic007G174701 Sobic007G206600--Sobic007G174701 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic007G206600--Sobic008G086100 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic007G206600--Sobic006G119100 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic007G206600--Sobic002G142350 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic007G206600--Sobic001G487250 Sobic003G276700 Sobic003G276700 Sobic007G206600--Sobic003G276700 Sobic003G096400 Sobic003G096400 Sobic007G206600--Sobic003G096400 Sobic010G011001 Sobic010G011001 Sobic007G206600--Sobic010G011001 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic007G206600--Sobic004G223350 Sobic007G174701--Sobic007G206600 Sobic007G174701--Sobic008G086100 Sobic007G174701--Sobic006G119100 Sobic007G174701--Sobic004G223350 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic007G174701--Sobic007G173901 Sobic007G174701--Sobic002G142350 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic007G174701--Sobic002G262500 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic007G174701--Sobic004G357600 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic007G174701--Sobic007G038200 Sobic008G086100--Sobic004G223350 Sobic008G086100--Sobic007G173901 Sobic008G086100--Sobic007G174701 Sobic008G086100--Sobic002G262500 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic008G086100--Sobic008G096300 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic008G086100--Sobic001G400101 Sobic008G086100--Sobic002G142350 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic008G086100--Sobic008G175600 Sobic008G086100--Sobic007G206600 Sobic006G119100--Sobic007G038200 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic006G119100--Sobic002G380150 Sobic006G119100--Sobic007G174701 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic006G119100--Sobic002G315450 Sobic006G119100--Sobic007G206600 Sobic007G044350 Sobic007G044350 Sobic006G119100--Sobic007G044350 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic006G119100--Sobic001G296600 Sobic006G119100--Sobic008G086100 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic006G119100--Sobic006G045301 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic002G142350--Sobic007G081400 Sobic002G142350--Sobic002G380150 Sobic002G142350--Sobic004G223350 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic002G142350--Sobic004G288900 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic002G142350--Sobic003G241600 Sobic002G142350--Sobic008G096300 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic002G142350--Sobic007G203850 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic002G142350--Sobic009G049100 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic002G142350--Sobic008G024700 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic001G487250--Sobic003G155350 Sobic001G513900 Sobic001G513900 Sobic001G487250--Sobic001G513900 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic001G487250--Sobic009G144050 Sobic004G230800 Sobic004G230800 Sobic001G487250--Sobic004G230800 Sobic001G487250--Sobic008G024700 Sobic009G004300 Sobic009G004300 Sobic001G487250--Sobic009G004300 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic001G487250--Sobic002G360701 Sobic005G139000 Sobic005G139000 Sobic001G487250--Sobic005G139000 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic001G487250--Sobic004G184500 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic003G276700--Sobic004G070150 Sobic003G276700--Sobic009G049100 Sobic010G084900 Sobic010G084900 Sobic003G276700--Sobic010G084900 Sobic003G276700--Sobic008G024700 Sobic003G276700--Sobic002G142350 Sobic003G276700--Sobic001G296600 Sobic003G276700--Sobic004G223350 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic003G276700--Sobic007G016200 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic003G276700--Sobic003G267600 Sobic003G096400--Sobic002G142350 Sobic003G096400--Sobic003G155350 Sobic002G312600 Sobic002G312600 Sobic003G096400--Sobic002G312600 Sobic003G096400--Sobic002G380150 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic003G096400--Sobic009G170301 Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic003G096400--Sobic002G076932 Sobic003G096400--Sobic002G360701 Sobic003G096400--Sobic008G024700 Sobic003G096400--Sobic004G288900 Sobic009G188750 Sobic009G188750 Sobic010G011001--Sobic009G188750 Sobic003G239750 Sobic003G239750 Sobic010G011001--Sobic003G239750 Sobic010G011001--Sobic008G096300 Sobic006G109850 Sobic006G109850 Sobic010G011001--Sobic006G109850 Sobic008G142301 Sobic008G142301 Sobic010G011001--Sobic008G142301 Sobic010G011001--Sobic007G206600 Sobic010G011001--Sobic008G086100 Sobic003G233300 Sobic003G233300 Sobic010G011001--Sobic003G233300 Sobic009G024133 Sobic009G024133 Sobic010G011001--Sobic009G024133 Sobic004G223350--Sobic007G173901 Sobic004G223350--Sobic008G086100 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic004G223350--Sobic002G008701 Sobic004G223350--Sobic007G203850 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic004G223350--Sobic002G346250 Sobic004G223350--Sobic003G241600 Sobic004G223350--Sobic002G142350 Sobic004G223350--Sobic001G296600 Sobic004G223350--Sobic008G096300
Octagon: transcription factors


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