Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G276700.2,Sobic.003G276700.1
Synonym PIN1, Sb03g032850, ATPIN1, SbPIN3, efflux carriers pin-formed
Functional annotation "domain confirmed by Pfam database, expressed in flower, expression induced by IAA and ABA treatments" (PubMedID : 20528920)
auxin efflux carrier component, putative, expressed
UniProt C5XIA5 , A0A1W0VZ80
Pfam PF03547
Panther DB PTHR31752 PTHR31752:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology K13947; auxin efflux carrier family protein
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G01420 : Auxin efflux carrier family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g12610.1,LOC_Os02g50960.1 : auxin efflux carrier component, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a027787
Brachypodium KQK09468 , PNT72709
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G070150 - -
2 Sobic.009G049100 - -
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16 Sobic.007G046600 - -
17 Sobic.002G107700 - -
18 Sobic.007G038200 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
19 Sobic.007G044350 - -
20 Sobic.002G380150 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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