Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G084900.1
Synonym Sb10g007340
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
protein kinase family protein, putative, expressed
UniProt C5Z6K0
Pfam PF07714
Panther DB PTHR27001 PTHR27001:SF134
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G57120 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g39860.1 : protein kinase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042526
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G460150 - -
2 Sobic.003G276700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in flower, expression induced by IAA and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@auxin efflux carrier component, putative, expressed K13947: auxin efflux carrier family protein
3 Sobic.009G049100 - -
4 Sobic.001G296600 - -
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8 Sobic.008G024700 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.007G046600 - -
10 Sobic.004G258450 - -
11 Sobic.003G241600 - -
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13 Sobic.003G267600 potassium channel protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G346250 - -
15 Sobic.007G173901 - -
16 Sobic.004G190800 galactosyltransferase family protein, putative, expressed K14413: beta-1,3-galactosyltransferase
17 Sobic.003G399800 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
18 Sobic.008G096300 - -
19 Sobic.003G298000 - -
20 Sobic.010G217466 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G084900 Sobic010G084900 Sobic001G460150 Sobic001G460150 Sobic010G084900--Sobic001G460150 Sobic003G276700 Sobic003G276700 Sobic010G084900--Sobic003G276700 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic010G084900--Sobic009G049100 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic010G084900--Sobic001G296600 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic010G084900--Sobic004G070150 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic010G084900--Sobic004G223350 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic010G084900--Sobic009G252500 Sobic008G024700 Sobic008G024700 Sobic010G084900--Sobic008G024700 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic010G084900--Sobic007G046600 Sobic001G460150--Sobic009G049100 Sobic001G460150--Sobic008G024700 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic001G460150--Sobic004G258450 Sobic003G336300 Sobic003G336300 Sobic001G460150--Sobic003G336300 Sobic001G460150--Sobic010G084900 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic001G460150--Sobic004G190800 Sobic004G144300 Sobic004G144300 Sobic001G460150--Sobic004G144300 Sobic001G460150--Sobic007G046600 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic001G460150--Sobic003G298000 Sobic003G276700--Sobic004G070150 Sobic003G276700--Sobic009G049100 Sobic003G276700--Sobic010G084900 Sobic003G276700--Sobic008G024700 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic003G276700--Sobic002G142350 Sobic003G276700--Sobic001G296600 Sobic003G276700--Sobic004G223350 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic003G276700--Sobic007G016200 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic003G276700--Sobic003G267600 Sobic009G049100--Sobic008G024700 Sobic009G049100--Sobic001G460150 Sobic009G049100--Sobic003G336300 Sobic009G049100--Sobic004G190800 Sobic009G049100--Sobic004G144300 Sobic009G049100--Sobic009G252500 Sobic009G049100--Sobic003G298000 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic009G049100--Sobic004G310400 Sobic009G049100--Sobic007G046600 Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic001G296600--Sobic001G104050 Sobic007G044350 Sobic007G044350 Sobic001G296600--Sobic007G044350 Sobic001G296600--Sobic004G223350 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic001G296600--Sobic004G357600 Sobic001G296600--Sobic003G267600 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic001G296600--Sobic007G173901 Sobic004G205900 Sobic004G205900 Sobic001G296600--Sobic004G205900 Sobic001G296600--Sobic003G276700 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic001G296600--Sobic002G008701 Sobic010G054150 Sobic010G054150 Sobic004G070150--Sobic010G054150 Sobic004G070150--Sobic003G276700 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic004G070150--Sobic002G107700 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic004G070150--Sobic003G399800 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic004G070150--Sobic004G237900 Sobic007G137750 Sobic007G137750 Sobic004G070150--Sobic007G137750 Sobic004G070150--Sobic010G084900 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic004G070150--Sobic007G052000 Sobic004G070150--Sobic001G296600 Sobic004G223350--Sobic007G173901 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic004G223350--Sobic008G086100 Sobic004G223350--Sobic002G008701 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic004G223350--Sobic007G203850 Sobic002G346250 Sobic002G346250 Sobic004G223350--Sobic002G346250 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic004G223350--Sobic003G241600 Sobic004G223350--Sobic002G142350 Sobic004G223350--Sobic001G296600 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic004G223350--Sobic008G096300 Sobic009G252500--Sobic007G046600 Sobic009G252500--Sobic003G298000 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic009G252500--Sobic002G209450 Sobic009G252500--Sobic003G241600 Sobic009G252500--Sobic004G190800 Sobic009G252500--Sobic009G049100 Sobic010G261500 Sobic010G261500 Sobic009G252500--Sobic010G261500 Sobic001G494400 Sobic001G494400 Sobic009G252500--Sobic001G494400 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic009G252500--Sobic008G170800 Sobic008G024700--Sobic009G049100 Sobic008G024700--Sobic001G460150 Sobic008G024700--Sobic004G190800 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic008G024700--Sobic006G121200 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic008G024700--Sobic002G360701 Sobic008G024700--Sobic003G336300 Sobic001G513900 Sobic001G513900 Sobic008G024700--Sobic001G513900 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic008G024700--Sobic001G487250 Sobic008G024700--Sobic004G223350 Sobic007G046600--Sobic009G252500 Sobic007G046600--Sobic003G298000 Sobic007G046600--Sobic002G209450 Sobic007G046600--Sobic003G241600 Sobic007G046600--Sobic008G170800 Sobic004G053600 Sobic004G053600 Sobic007G046600--Sobic004G053600 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic007G046600--Sobic003G155000 Sobic007G046600--Sobic004G190800 Sobic001G010900 Sobic001G010900 Sobic007G046600--Sobic001G010900
Octagon: transcription factors


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