Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G093732.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S4Z4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G252600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@mitochondrial chaperone BCS1, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
2 Sobic.010G201444 - -
3 Sobic.003G251900 expressed protein -
4 Sobic.005G014400 esterase, putative, expressed -
5 Sobic.008G007200 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
6 Sobic.001G483001 - -
7 Sobic.007G046600 - -
8 Sobic.006G154900 mitochondrial carrier protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G279100 Positive regulator of ABA(PubMedID : 30367619)@CAMK_CAMK_like.28 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K14498: serine/threonine-protein kinase SRK2
10 Sobic.002G206900 GEX2, putative, expressed -
11 Sobic.008G078500 - -
12 Sobic.004G181000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
13 Sobic.010G261500 acyltransferase, putative, expressed K13510: lysophosphatidylcholine acyltransferase / lyso-PAF acetyltransferase
14 Sobic.009G252500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@mitochondrial chaperone BCS1, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
15 Sobic.003G241600 - -
16 Sobic.004G273500 oligopeptide transporter, putative, expressed -
17 Sobic.003G053750 - -
18 Sobic.005G182100 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
19 Sobic.004G091300 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
20 Sobic.001G350800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic001G093732--Sobic009G252600 Sobic010G201444 Sobic010G201444 Sobic001G093732--Sobic010G201444 Sobic003G251900 Sobic003G251900 Sobic001G093732--Sobic003G251900 Sobic005G014400 Sobic005G014400 Sobic001G093732--Sobic005G014400 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic001G093732--Sobic008G007200 Sobic001G483001 Sobic001G483001 Sobic001G093732--Sobic001G483001 Sobic007G046600 Sobic007G046600 Sobic001G093732--Sobic007G046600 Sobic006G154900 Sobic006G154900 Sobic001G093732--Sobic006G154900 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic001G093732--Sobic006G279100 Sobic009G252600--Sobic003G251900 Sobic003G155800 Sobic003G155800 Sobic009G252600--Sobic003G155800 Sobic009G252600--Sobic001G093732 Sobic002G206900 Sobic002G206900 Sobic009G252600--Sobic002G206900 Sobic001G520000 Sobic001G520000 Sobic009G252600--Sobic001G520000 Sobic009G252600--Sobic001G483001 Sobic003G253700 Sobic003G253700 Sobic009G252600--Sobic003G253700 Sobic010G261500 Sobic010G261500 Sobic009G252600--Sobic010G261500 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic009G252600--Sobic006G157450 Sobic010G201444--Sobic001G093732 Sobic006G103800 Sobic006G103800 Sobic010G201444--Sobic006G103800 Sobic010G201444--Sobic003G251900 Sobic010G201444--Sobic008G007200 Sobic010G201444--Sobic009G252600 Sobic010G201444--Sobic005G014400 Sobic006G024400 Sobic006G024400 Sobic010G201444--Sobic006G024400 Sobic004G181000 Sobic004G181000 Sobic010G201444--Sobic004G181000 Sobic010G201444--Sobic006G154900 Sobic003G251900--Sobic009G252600 Sobic003G251900--Sobic004G181000 Sobic003G251900--Sobic003G155800 Sobic003G251900--Sobic005G014400 Sobic003G251900--Sobic010G201444 Sobic003G251900--Sobic001G093732 Sobic003G251900--Sobic002G206900 Sobic009G199900 Sobic009G199900 Sobic003G251900--Sobic009G199900 Sobic003G362800 Sobic003G362800 Sobic003G251900--Sobic003G362800 Sobic005G014400--Sobic003G251900 Sobic005G014400--Sobic001G093732 Sobic005G014400--Sobic004G181000 Sobic001G350800 Sobic001G350800 Sobic005G014400--Sobic001G350800 Sobic006G165501 Sobic006G165501 Sobic005G014400--Sobic006G165501 Sobic009G112500 Sobic009G112500 Sobic005G014400--Sobic009G112500 Sobic005G025400 Sobic005G025400 Sobic005G014400--Sobic005G025400 Sobic008G016800 Sobic008G016800 Sobic005G014400--Sobic008G016800 Sobic001G113400 Sobic001G113400 Sobic005G014400--Sobic001G113400 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic008G007200--Sobic008G007100 Sobic008G007200--Sobic006G154900 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic008G007200--Sobic003G304900 Sobic008G007200--Sobic001G093732 Sobic008G007200--Sobic010G201444 Sobic005G126401 Sobic005G126401 Sobic008G007200--Sobic005G126401 Sobic008G007200--Sobic009G252600 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic008G007200--Sobic007G124800 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic008G007200--Sobic001G316500 Sobic001G483001--Sobic001G520000 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic001G483001--Sobic006G213350 Sobic008G143901 Sobic008G143901 Sobic001G483001--Sobic008G143901 Sobic008G160100 Sobic008G160100 Sobic001G483001--Sobic008G160100 Sobic001G483001--Sobic006G157450 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic001G483001--Sobic005G031400 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic001G483001--Sobic008G170800 Sobic010G012200 Sobic010G012200 Sobic001G483001--Sobic010G012200 Sobic001G483001--Sobic003G253700 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic007G046600--Sobic009G252500 Sobic003G298000 Sobic003G298000 Sobic007G046600--Sobic003G298000 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic007G046600--Sobic002G209450 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic007G046600--Sobic003G241600 Sobic007G046600--Sobic008G170800 Sobic004G053600 Sobic004G053600 Sobic007G046600--Sobic004G053600 Sobic003G155000 Sobic003G155000 Sobic007G046600--Sobic003G155000 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic007G046600--Sobic004G190800 Sobic001G010900 Sobic001G010900 Sobic007G046600--Sobic001G010900 Sobic006G154900--Sobic008G007200 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic006G154900--Sobic002G018133 Sobic006G154900--Sobic001G093732 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic006G154900--Sobic010G217001 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic006G154900--Sobic008G078500 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic006G154900--Sobic009G184500 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic006G154900--Sobic002G360701 Sobic004G273500 Sobic004G273500 Sobic006G154900--Sobic004G273500 Sobic006G154900--Sobic010G201444 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic006G279100--Sobic010G042300 Sobic005G070951 Sobic005G070951 Sobic006G279100--Sobic005G070951 Sobic006G279100--Sobic001G483001 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic006G279100--Sobic001G090700 Sobic006G279100--Sobic008G170800 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic006G279100--Sobic002G208700 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic006G279100--Sobic001G460900 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic006G279100--Sobic005G228650 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic006G279100--Sobic001G150100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.