Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G015800.1
Synonym GH9C3, AtGH9C3
Functional annotation endoglucanase precursor, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q0Y5
Pfam PF09478 PF00759
Panther DB PTHR22298 PTHR22298:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005975; carbohydrate metabolic process GO:0004553hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G11050 : glycosyl hydrolase 9C3
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g12070.1 : endoglucanase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037591 , Zm00025a035938
Brachypodium KQK07034
Barley HORVU1Hr1G085830.1 , HORVU1Hr1G085830.3 , HORVU1Hr1G085830.2 , HORVU1Hr1G085830.5 , HORVU1Hr1G085830.4 , HORVU1Hr1G085830.7 , HORVU1Hr1G085830.6 , HORVU3Hr1G029470.1 , HORVU3Hr1G029470.3 , HORVU3Hr1G029470.2 , HORVU3Hr1G029470.5 , HORVU3Hr1G029470.4 , HORVU3Hr1G029470.7 , HORVU3Hr1G029470.6 , HORVU3Hr1G029470.8 , HORVU6Hr1G073570.3 , HORVU6Hr1G073570.1 , HORVU6Hr1G073570.4
Wheat TraesCS1D02G397400 , TraesCS3D02G153400 , TraesCS6D02G275900 , TraesCS4B02G104500 , TraesCS6A02G295300 , TraesCS1A02G389300 , TraesCS3A02G144600 , TraesCS6B02G325400
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G015800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic003G015800 Sobic003G015800 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic003G015800--Sobic006G045301 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic003G015800--Sobic007G225050 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic003G015800--Sobic007G203850 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic003G015800--Sobic002G008701 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic003G015800--Sobic002G380150 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic003G015800--Sobic008G078500 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic003G015800--Sobic007G016300 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic003G015800--Sobic005G083866 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic003G015800--Sobic001G311700 Sobic006G045301--Sobic007G225050 Sobic006G045301--Sobic003G015800 Sobic006G045301--Sobic007G203850 Sobic006G045301--Sobic001G311700 Sobic006G045301--Sobic002G380150 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic006G045301--Sobic008G086300 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic006G045301--Sobic007G081400 Sobic006G045301--Sobic008G078500 Sobic006G045301--Sobic005G083866 Sobic007G225050--Sobic006G045301 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic007G225050--Sobic007G203800 Sobic007G225050--Sobic003G015800 Sobic007G225050--Sobic008G078500 Sobic007G225050--Sobic007G203850 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic007G225050--Sobic004G118300 Sobic007G225050--Sobic007G081400 Sobic007G225050--Sobic002G380150 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic007G225050--Sobic003G305250 Sobic007G203850--Sobic006G045301 Sobic007G203850--Sobic008G078500 Sobic007G203850--Sobic007G225050 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic007G203850--Sobic004G223350 Sobic007G203850--Sobic007G081400 Sobic007G203850--Sobic003G015800 Sobic007G203850--Sobic001G311700 Sobic007G203850--Sobic005G083866 Sobic007G203850--Sobic002G008701 Sobic002G008701--Sobic004G223350 Sobic002G008701--Sobic007G203850 Sobic002G008701--Sobic007G016300 Sobic002G008701--Sobic003G015800 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic002G008701--Sobic008G175600 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic002G008701--Sobic008G112400 Sobic002G008701--Sobic005G083866 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic002G008701--Sobic002G331200 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic002G008701--Sobic001G296600 Sobic002G380150--Sobic007G081400 Sobic002G380150--Sobic006G045301 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic002G380150--Sobic001G150100 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic002G380150--Sobic002G030001 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic002G380150--Sobic002G142350 Sobic002G380150--Sobic007G203850 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic002G380150--Sobic007G038200 Sobic002G380150--Sobic007G225050 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic002G380150--Sobic006G119100 Sobic008G078500--Sobic007G225050 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic008G078500--Sobic007G174000 Sobic008G078500--Sobic007G203850 Sobic008G078500--Sobic006G045301 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic008G078500--Sobic003G241600 Sobic008G078500--Sobic004G223350 Sobic008G078500--Sobic002G380150 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic008G078500--Sobic001G093732 Sobic006G154900 Sobic006G154900 Sobic008G078500--Sobic006G154900 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic007G016300--Sobic004G200000 Sobic007G016300--Sobic002G331200 Sobic007G016300--Sobic005G083866 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic007G016300--Sobic009G082500 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic007G016300--Sobic003G043650 Sobic007G016300--Sobic008G112400 Sobic007G016300--Sobic002G008701 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic007G016300--Sobic004G260700 Sobic001G345366 Sobic001G345366 Sobic007G016300--Sobic001G345366 Sobic005G083866--Sobic003G043650 Sobic005G083866--Sobic004G200000 Sobic005G083866--Sobic007G016300 Sobic005G083866--Sobic002G331200 Sobic005G083866--Sobic001G311700 Sobic005G083866--Sobic002G030001 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic005G083866--Sobic002G018133 Sobic005G083866--Sobic007G081400 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic005G083866--Sobic010G041500 Sobic001G311700--Sobic005G083866 Sobic006G201450 Sobic006G201450 Sobic001G311700--Sobic006G201450 Sobic001G311700--Sobic007G203850 Sobic001G311700--Sobic006G045301 Sobic001G311700--Sobic007G081400 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic001G311700--Sobic002G231400 Sobic001G311700--Sobic003G305250 Sobic001G311700--Sobic004G200000 Sobic001G311700--Sobic002G030001
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