Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G051800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YNX2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G494950 - -
2 Sobic.010G184201 - -
3 Sobic.001G021800 mRNA-decapping enzyme, putative, expressed K12611: mRNA-decapping enzyme 1B
4 Sobic.005G230600 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G262500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@osFTL4 FT-Like4 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
6 Sobic.002G208301 - K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
7 Sobic.004G237900 no apical meristem protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G312600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G396550 - -
10 Sobic.009G221701 - -
11 Sobic.002G427201 - -
12 Sobic.003G399800 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
13 Sobic.001G183550 - -
14 Sobic.003G315900 - -
15 Sobic.002G429200 expressed protein -
16 Sobic.004G258450 - -
17 Sobic.001G519200 expressed protein -
18 Sobic.010G251800 DUF617 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G227601 - -
20 Sobic.002G285950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G051800 Sobic004G051800 Sobic001G494950 Sobic001G494950 Sobic004G051800--Sobic001G494950 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic004G051800--Sobic010G184201 Sobic001G021800 Sobic001G021800 Sobic004G051800--Sobic001G021800 Sobic005G230600 Sobic005G230600 Sobic004G051800--Sobic005G230600 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic004G051800--Sobic002G262500 Sobic002G208301 Sobic002G208301 Sobic004G051800--Sobic002G208301 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic004G051800--Sobic004G237900 Sobic002G312600 Sobic002G312600 Sobic004G051800--Sobic002G312600 Sobic001G396550 Sobic001G396550 Sobic004G051800--Sobic001G396550 Sobic001G494950--Sobic004G051800 Sobic001G494950--Sobic010G184201 Sobic002G207601 Sobic002G207601 Sobic001G494950--Sobic002G207601 Sobic001G494950--Sobic005G230600 Sobic003G336300 Sobic003G336300 Sobic001G494950--Sobic003G336300 Sobic009G235100 Sobic009G235100 Sobic001G494950--Sobic009G235100 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic001G494950--Sobic003G399800 Sobic001G494950--Sobic004G237900 Sobic001G385132 Sobic001G385132 Sobic001G494950--Sobic001G385132 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic010G184201--Sobic002G107700 Sobic010G184201--Sobic004G237900 Sobic010G184201--Sobic003G399800 Sobic010G184201--Sobic001G385132 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic010G184201--Sobic002G315450 Sobic010G184201--Sobic001G494950 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic010G184201--Sobic004G070150 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic010G184201--Sobic004G258450 Sobic010G184201--Sobic002G208301 Sobic001G128900 Sobic001G128900 Sobic001G021800--Sobic001G128900 Sobic001G206800 Sobic001G206800 Sobic001G021800--Sobic001G206800 Sobic008G127600 Sobic008G127600 Sobic001G021800--Sobic008G127600 Sobic004G098200 Sobic004G098200 Sobic001G021800--Sobic004G098200 Sobic010G096801 Sobic010G096801 Sobic001G021800--Sobic010G096801 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic001G021800--Sobic003G357000 Sobic009G004000 Sobic009G004000 Sobic001G021800--Sobic009G004000 Sobic001G021800--Sobic004G051800 Sobic004G199000 Sobic004G199000 Sobic001G021800--Sobic004G199000 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic005G230600--Sobic002G375600 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic005G230600--Sobic002G429200 Sobic002G189350 Sobic002G189350 Sobic005G230600--Sobic002G189350 Sobic003G292800 Sobic003G292800 Sobic005G230600--Sobic003G292800 Sobic009G005750 Sobic009G005750 Sobic005G230600--Sobic009G005750 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic005G230600--Sobic005G106800 Sobic008G150150 Sobic008G150150 Sobic005G230600--Sobic008G150150 Sobic001G060666 Sobic001G060666 Sobic005G230600--Sobic001G060666 Sobic010G074960 Sobic010G074960 Sobic005G230600--Sobic010G074960 Sobic002G427201 Sobic002G427201 Sobic002G262500--Sobic002G427201 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic002G262500--Sobic007G173901 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic002G262500--Sobic008G086100 Sobic006G242600 Sobic006G242600 Sobic002G262500--Sobic006G242600 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic002G262500--Sobic010G217466 Sobic005G027032 Sobic005G027032 Sobic002G262500--Sobic005G027032 Sobic009G221701 Sobic009G221701 Sobic002G262500--Sobic009G221701 Sobic001G062400 Sobic001G062400 Sobic002G262500--Sobic001G062400 Sobic002G262500--Sobic002G429200 Sobic002G208301--Sobic003G399800 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic002G208301--Sobic009G049100 Sobic001G227601 Sobic001G227601 Sobic002G208301--Sobic001G227601 Sobic002G208301--Sobic002G107700 Sobic003G276400 Sobic003G276400 Sobic002G208301--Sobic003G276400 Sobic006G165501 Sobic006G165501 Sobic002G208301--Sobic006G165501 Sobic002G208301--Sobic001G385132 Sobic002G208301--Sobic004G237900 Sobic002G208301--Sobic010G184201 Sobic004G237900--Sobic003G399800 Sobic004G237900--Sobic004G258450 Sobic001G245100 Sobic001G245100 Sobic004G237900--Sobic001G245100 Sobic004G237900--Sobic002G107700 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic004G237900--Sobic008G132550 Sobic004G237900--Sobic010G184201 Sobic004G237900--Sobic004G070150 Sobic004G237900--Sobic009G049100 Sobic004G237900--Sobic001G385132 Sobic004G102301 Sobic004G102301 Sobic002G312600--Sobic004G102301 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic002G312600--Sobic009G170301 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic002G312600--Sobic001G204200 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic002G312600--Sobic005G094500 Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic002G312600--Sobic002G076932 Sobic002G312600--Sobic009G235100 Sobic002G312600--Sobic001G206800 Sobic006G093400 Sobic006G093400 Sobic002G312600--Sobic006G093400 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic002G312600--Sobic003G155350 Sobic001G396550--Sobic002G427201 Sobic002G271800 Sobic002G271800 Sobic001G396550--Sobic002G271800 Sobic007G044350 Sobic007G044350 Sobic001G396550--Sobic007G044350 Sobic001G396550--Sobic002G107700 Sobic001G396550--Sobic006G242600 Sobic001G396550--Sobic002G262500 Sobic001G229401 Sobic001G229401 Sobic001G396550--Sobic001G229401 Sobic001G396550--Sobic002G208301 Sobic001G396550--Sobic010G184201
Octagon: transcription factors


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