Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G183550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6B4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G075500 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G229025 - -
3 Sobic.009G199401 - -
4 Sobic.003G162600 expressed protein -
5 Sobic.001G489400 3-dehydroquinate synthase, putative, expressed -
6 Sobic.008G169500 - -
7 Sobic.002G207601 - -
8 Sobic.006G082100 dehydration-responsive element-binding protein, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
9 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -
10 Sobic.002G196800 protein kinase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G519200 expressed protein -
12 Sobic.006G280250 - -
13 Sobic.001G439050 - -
14 Sobic.009G144400 - -
15 Sobic.004G186950 - -
16 Sobic.003G433000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
17 Sobic.001G385132 - -
18 Sobic.001G082700 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.1 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
19 Sobic.006G221500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@acyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.002G046150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G183550 Sobic001G183550 Sobic008G075500 Sobic008G075500 Sobic001G183550--Sobic008G075500 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic001G183550--Sobic010G229025 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic001G183550--Sobic009G199401 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic001G183550--Sobic003G162600 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic001G183550--Sobic001G489400 Sobic008G169500 Sobic008G169500 Sobic001G183550--Sobic008G169500 Sobic002G207601 Sobic002G207601 Sobic001G183550--Sobic002G207601 Sobic006G082100 Sobic006G082100 Sobic001G183550--Sobic006G082100 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic001G183550--Sobic002G421100 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic008G075500--Sobic006G280250 Sobic008G075500--Sobic001G183550 Sobic008G075500--Sobic008G169500 Sobic004G091300 Sobic004G091300 Sobic008G075500--Sobic004G091300 Sobic009G144400 Sobic009G144400 Sobic008G075500--Sobic009G144400 Sobic001G082700 Sobic001G082700 Sobic008G075500--Sobic001G082700 Sobic008G075500--Sobic009G199401 Sobic008G075500--Sobic003G162600 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic008G075500--Sobic002G208900 Sobic010G229025--Sobic009G199401 Sobic010G229025--Sobic001G489400 Sobic010G229025--Sobic002G421100 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic010G229025--Sobic004G093800 Sobic010G229025--Sobic001G183550 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic010G229025--Sobic002G307500 Sobic010G229025--Sobic003G162600 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G229025--Sobic009G025750 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic010G229025--Sobic006G083050 Sobic009G199401--Sobic002G421100 Sobic009G199401--Sobic001G489400 Sobic009G199401--Sobic010G229025 Sobic009G199401--Sobic003G162600 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic009G199401--Sobic006G221500 Sobic009G199401--Sobic004G093800 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic009G199401--Sobic008G142500 Sobic005G116700 Sobic005G116700 Sobic009G199401--Sobic005G116700 Sobic004G186950 Sobic004G186950 Sobic009G199401--Sobic004G186950 Sobic003G162600--Sobic001G489400 Sobic003G162600--Sobic009G199401 Sobic003G162600--Sobic004G186950 Sobic003G162600--Sobic005G116700 Sobic003G162600--Sobic006G221500 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic003G162600--Sobic001G150100 Sobic003G162600--Sobic002G421100 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic003G162600--Sobic005G187700 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic003G162600--Sobic001G014600 Sobic001G489400--Sobic009G199401 Sobic001G489400--Sobic003G162600 Sobic001G489400--Sobic004G093800 Sobic001G489400--Sobic010G229025 Sobic001G489400--Sobic002G421100 Sobic001G489400--Sobic002G307500 Sobic001G489400--Sobic006G221500 Sobic001G489400--Sobic002G207601 Sobic001G489400--Sobic005G116700 Sobic008G169500--Sobic002G208900 Sobic008G169500--Sobic009G144400 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic008G169500--Sobic007G038200 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic008G169500--Sobic006G215650 Sobic008G169500--Sobic006G280250 Sobic008G169500--Sobic008G075500 Sobic008G169500--Sobic009G199401 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic008G169500--Sobic002G129900 Sobic008G169500--Sobic001G150100 Sobic004G257900 Sobic004G257900 Sobic002G207601--Sobic004G257900 Sobic002G207601--Sobic001G489400 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic002G207601--Sobic006G213350 Sobic002G197500 Sobic002G197500 Sobic002G207601--Sobic002G197500 Sobic001G156401 Sobic001G156401 Sobic002G207601--Sobic001G156401 Sobic008G143901 Sobic008G143901 Sobic002G207601--Sobic008G143901 Sobic001G139800 Sobic001G139800 Sobic002G207601--Sobic001G139800 Sobic002G207601--Sobic009G199401 Sobic005G160500 Sobic005G160500 Sobic002G207601--Sobic005G160500 Sobic003G262500 Sobic003G262500 Sobic006G082100--Sobic003G262500 Sobic001G507700 Sobic001G507700 Sobic006G082100--Sobic001G507700 Sobic006G082100--Sobic001G082700 Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic006G082100--Sobic010G105900 Sobic002G387000 Sobic002G387000 Sobic006G082100--Sobic002G387000 Sobic006G082100--Sobic001G183550 Sobic007G189900 Sobic007G189900 Sobic006G082100--Sobic007G189900 Sobic002G382400 Sobic002G382400 Sobic006G082100--Sobic002G382400 Sobic009G055000 Sobic009G055000 Sobic006G082100--Sobic009G055000 Sobic002G421100--Sobic009G199401 Sobic002G421100--Sobic008G142500 Sobic002G421100--Sobic006G083050 Sobic002G421100--Sobic010G229025 Sobic002G421100--Sobic001G489400 Sobic002G421100--Sobic003G162600 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic002G421100--Sobic003G068100 Sobic002G421100--Sobic006G221500 Sobic002G421100--Sobic001G014600
Octagon: transcription factors


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