Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G519200.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QQR6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g43180.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G118700 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
2 Sobic.009G170301 - -
3 Sobic.004G102301 - -
4 Sobic.009G235100 GTP-binding protein, putative, expressed K03595: era, GTPase
5 Sobic.002G030001 - -
6 Sobic.002G312600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G380150 - -
8 Sobic.002G076932 - -
9 Sobic.002G395900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@nodulation protein-related, putative, expressed -
10 Sobic.010G217001 - -
11 Sobic.001G156401 - -
12 Sobic.001G150100 - -
13 Sobic.001G312801 - -
14 Sobic.006G243000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CCB4, putative, expressed -
15 Sobic.003G298000 - -
16 Sobic.004G310400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K11982: E3 ubiquitin-protein ligase RNF115/126
17 Sobic.008G143901 - -
18 Sobic.010G041500 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
19 Sobic.008G075500 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G094500 senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G519200 Sobic001G519200 Sobic009G118700 Sobic009G118700 Sobic001G519200--Sobic009G118700 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic001G519200--Sobic009G170301 Sobic004G102301 Sobic004G102301 Sobic001G519200--Sobic004G102301 Sobic009G235100 Sobic009G235100 Sobic001G519200--Sobic009G235100 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic001G519200--Sobic002G030001 Sobic002G312600 Sobic002G312600 Sobic001G519200--Sobic002G312600 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic001G519200--Sobic002G380150 Sobic002G076932 Sobic002G076932 Sobic001G519200--Sobic002G076932 Sobic002G395900 Sobic002G395900 Sobic001G519200--Sobic002G395900 Sobic001G156401 Sobic001G156401 Sobic009G118700--Sobic001G156401 Sobic009G118700--Sobic001G519200 Sobic009G118700--Sobic002G030001 Sobic009G118700--Sobic002G395900 Sobic006G243000 Sobic006G243000 Sobic009G118700--Sobic006G243000 Sobic009G118700--Sobic009G170301 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic009G118700--Sobic010G217001 Sobic008G143901 Sobic008G143901 Sobic009G118700--Sobic008G143901 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic009G118700--Sobic001G312801 Sobic009G170301--Sobic002G076932 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic009G170301--Sobic005G094500 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic009G170301--Sobic010G041500 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic009G170301--Sobic001G368000 Sobic003G202900 Sobic003G202900 Sobic009G170301--Sobic003G202900 Sobic009G170301--Sobic002G395900 Sobic001G468200 Sobic001G468200 Sobic009G170301--Sobic001G468200 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic009G170301--Sobic001G490600 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic009G170301--Sobic007G017300 Sobic004G102301--Sobic002G312600 Sobic004G102301--Sobic009G170301 Sobic001G204200 Sobic001G204200 Sobic004G102301--Sobic001G204200 Sobic004G102301--Sobic005G094500 Sobic004G102301--Sobic003G202900 Sobic004G102301--Sobic002G395900 Sobic004G102301--Sobic002G076932 Sobic004G102301--Sobic009G235100 Sobic004G102301--Sobic001G519200 Sobic006G121200 Sobic006G121200 Sobic009G235100--Sobic006G121200 Sobic009G235100--Sobic004G102301 Sobic009G235100--Sobic002G312600 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic009G235100--Sobic009G049100 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic009G235100--Sobic004G310400 Sobic009G235100--Sobic001G519200 Sobic004G026000 Sobic004G026000 Sobic009G235100--Sobic004G026000 Sobic002G123700 Sobic002G123700 Sobic009G235100--Sobic002G123700 Sobic007G213500 Sobic007G213500 Sobic009G235100--Sobic007G213500 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic002G030001--Sobic005G083866 Sobic002G030001--Sobic002G380150 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic002G030001--Sobic004G200000 Sobic002G030001--Sobic010G217001 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic002G030001--Sobic007G016300 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic002G030001--Sobic002G018133 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic002G030001--Sobic003G043650 Sobic002G030001--Sobic009G118700 Sobic002G030001--Sobic002G076932 Sobic002G312600--Sobic004G102301 Sobic002G312600--Sobic009G170301 Sobic002G312600--Sobic001G204200 Sobic002G312600--Sobic005G094500 Sobic002G312600--Sobic002G076932 Sobic002G312600--Sobic009G235100 Sobic001G206800 Sobic001G206800 Sobic002G312600--Sobic001G206800 Sobic006G093400 Sobic006G093400 Sobic002G312600--Sobic006G093400 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic002G312600--Sobic003G155350 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic002G380150--Sobic007G081400 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic002G380150--Sobic006G045301 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic002G380150--Sobic001G150100 Sobic002G380150--Sobic002G030001 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic002G380150--Sobic002G142350 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic002G380150--Sobic007G203850 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic002G380150--Sobic007G038200 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic002G380150--Sobic007G225050 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic002G380150--Sobic006G119100 Sobic002G076932--Sobic009G170301 Sobic002G076932--Sobic005G094500 Sobic002G076932--Sobic001G204200 Sobic008G054400 Sobic008G054400 Sobic002G076932--Sobic008G054400 Sobic002G076932--Sobic010G041500 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic002G076932--Sobic008G166250 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic002G076932--Sobic004G184500 Sobic002G076932--Sobic003G202900 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic002G076932--Sobic001G212701 Sobic009G045100 Sobic009G045100 Sobic002G395900--Sobic009G045100 Sobic002G395900--Sobic005G094500 Sobic002G395900--Sobic003G202900 Sobic002G395900--Sobic007G017300 Sobic002G395900--Sobic001G368000 Sobic002G395900--Sobic009G170301 Sobic002G395900--Sobic001G468200 Sobic002G395900--Sobic003G155350 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic002G395900--Sobic001G176800
Octagon: transcription factors


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