Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G229025.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A194YKX9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G199401 - -
2 Sobic.001G489400 3-dehydroquinate synthase, putative, expressed -
3 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -
4 Sobic.004G093800 integral membrane protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G183550 - -
6 Sobic.002G307500 MATH domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G162600 expressed protein -
8 Sobic.009G025750 - -
9 Sobic.006G083050 - -
10 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.004G186950 - -
12 Sobic.006G192900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
13 Sobic.009G045400 - K10900: WRN, werner syndrome ATP-dependent helicase
14 Sobic.006G009200 expressed protein -
15 Sobic.009G035000 expressed protein -
16 Sobic.007G020400 OsWAK112d - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
17 Sobic.010G002600 methyltransferase, putative, expressed -
18 Sobic.008G041500 - -
19 Sobic.002G196800 protein kinase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G068100 receptor kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic010G229025--Sobic009G199401 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic010G229025--Sobic001G489400 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic010G229025--Sobic002G421100 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic010G229025--Sobic004G093800 Sobic001G183550 Sobic001G183550 Sobic010G229025--Sobic001G183550 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic010G229025--Sobic002G307500 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic010G229025--Sobic003G162600 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G229025--Sobic009G025750 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic010G229025--Sobic006G083050 Sobic009G199401--Sobic002G421100 Sobic009G199401--Sobic001G489400 Sobic009G199401--Sobic010G229025 Sobic009G199401--Sobic003G162600 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic009G199401--Sobic006G221500 Sobic009G199401--Sobic004G093800 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic009G199401--Sobic008G142500 Sobic005G116700 Sobic005G116700 Sobic009G199401--Sobic005G116700 Sobic004G186950 Sobic004G186950 Sobic009G199401--Sobic004G186950 Sobic001G489400--Sobic009G199401 Sobic001G489400--Sobic003G162600 Sobic001G489400--Sobic004G093800 Sobic001G489400--Sobic010G229025 Sobic001G489400--Sobic002G421100 Sobic001G489400--Sobic002G307500 Sobic001G489400--Sobic006G221500 Sobic002G207601 Sobic002G207601 Sobic001G489400--Sobic002G207601 Sobic001G489400--Sobic005G116700 Sobic002G421100--Sobic009G199401 Sobic002G421100--Sobic008G142500 Sobic002G421100--Sobic006G083050 Sobic002G421100--Sobic010G229025 Sobic002G421100--Sobic001G489400 Sobic002G421100--Sobic003G162600 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic002G421100--Sobic003G068100 Sobic002G421100--Sobic006G221500 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic002G421100--Sobic001G014600 Sobic004G093800--Sobic002G307500 Sobic004G093800--Sobic001G489400 Sobic004G093800--Sobic009G199401 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic004G093800--Sobic004G173300 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic004G093800--Sobic010G002600 Sobic004G093800--Sobic008G142500 Sobic004G093800--Sobic010G229025 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic004G093800--Sobic006G192900 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic004G093800--Sobic005G131500 Sobic008G075500 Sobic008G075500 Sobic001G183550--Sobic008G075500 Sobic001G183550--Sobic010G229025 Sobic001G183550--Sobic009G199401 Sobic001G183550--Sobic003G162600 Sobic001G183550--Sobic001G489400 Sobic008G169500 Sobic008G169500 Sobic001G183550--Sobic008G169500 Sobic001G183550--Sobic002G207601 Sobic006G082100 Sobic006G082100 Sobic001G183550--Sobic006G082100 Sobic001G183550--Sobic002G421100 Sobic002G307500--Sobic004G093800 Sobic002G307500--Sobic006G192900 Sobic002G307500--Sobic001G489400 Sobic002G307500--Sobic010G229025 Sobic002G307500--Sobic009G199401 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic002G307500--Sobic006G235801 Sobic002G307500--Sobic006G221500 Sobic002G307500--Sobic010G002600 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic002G307500--Sobic006G136300 Sobic003G162600--Sobic001G489400 Sobic003G162600--Sobic009G199401 Sobic003G162600--Sobic004G186950 Sobic003G162600--Sobic005G116700 Sobic003G162600--Sobic006G221500 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic003G162600--Sobic001G150100 Sobic003G162600--Sobic002G421100 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic003G162600--Sobic005G187700 Sobic003G162600--Sobic001G014600 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic009G025750--Sobic001G050650 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic009G025750--Sobic007G045750 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic009G025750--Sobic010G166201 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic009G025750--Sobic002G073000 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic009G025750--Sobic003G142500 Sobic009G025750--Sobic006G083050 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic009G025750--Sobic002G094100 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic009G025750--Sobic010G259800 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic009G025750--Sobic002G094000 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic006G083050--Sobic009G115800
Octagon: transcription factors


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