Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G192900.1
Synonym Sb06g026570
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
protein kinase domain containing protein, expressed
UniProt C5YEL1
Pfam PF07714 PF00139
Panther DB PTHR27007 PTHR27007:SF56
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology K04730; interleukin-1 receptor-associated kinase 1
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G06740 : Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g49460.1 : protein kinase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010055
Brachypodium KQJ84223 , PNT61711
Barley HORVU2Hr1G104690.1 , HORVU2Hr1G104610.4 , HORVU2Hr1G104610.2 , HORVU2Hr1G104610.3 , HORVU2Hr1G104610.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G241400 expressed protein -
2 Sobic.010G002600 methyltransferase, putative, expressed -
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11 Sobic.003G129700 - -
12 Sobic.004G176550 - -
13 Sobic.010G229025 - -
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17 Sobic.006G193801 - -
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19 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
20 Sobic.001G217850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic010G241400 Sobic010G241400 Sobic006G192900--Sobic010G241400 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic006G192900--Sobic010G002600 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic006G192900--Sobic002G307500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic006G192900--Sobic009G035000 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic006G192900--Sobic006G009200 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic006G192900--Sobic008G041500 Sobic004G181400 Sobic004G181400 Sobic006G192900--Sobic004G181400 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic006G192900--Sobic004G093800 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic006G192900--Sobic002G062400 Sobic010G241400--Sobic006G192900 Sobic010G241400--Sobic006G009200 Sobic010G241400--Sobic002G062400 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic010G241400--Sobic005G168900 Sobic001G217850 Sobic001G217850 Sobic010G241400--Sobic001G217850 Sobic004G176550 Sobic004G176550 Sobic010G241400--Sobic004G176550 Sobic010G241400--Sobic009G035000 Sobic009G170050 Sobic009G170050 Sobic010G241400--Sobic009G170050 Sobic001G134150 Sobic001G134150 Sobic010G241400--Sobic001G134150 Sobic010G002600--Sobic008G041500 Sobic010G002600--Sobic009G035000 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic010G002600--Sobic006G193801 Sobic010G002600--Sobic006G192900 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic010G002600--Sobic003G282400 Sobic010G002600--Sobic004G181400 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic010G002600--Sobic002G319900 Sobic003G185000 Sobic003G185000 Sobic010G002600--Sobic003G185000 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic010G002600--Sobic001G163500 Sobic002G307500--Sobic004G093800 Sobic002G307500--Sobic006G192900 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic002G307500--Sobic001G489400 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic002G307500--Sobic010G229025 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic002G307500--Sobic009G199401 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic002G307500--Sobic006G235801 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic002G307500--Sobic006G221500 Sobic002G307500--Sobic010G002600 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic002G307500--Sobic006G136300 Sobic009G035000--Sobic008G041500 Sobic009G035000--Sobic002G062400 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic009G035000--Sobic007G045750 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic009G035000--Sobic003G129700 Sobic009G035000--Sobic006G009200 Sobic009G035000--Sobic003G282400 Sobic009G035000--Sobic006G193801 Sobic009G035000--Sobic010G002600 Sobic009G035000--Sobic001G163500 Sobic006G009200--Sobic002G062400 Sobic006G009200--Sobic007G045750 Sobic006G009200--Sobic003G282400 Sobic006G009200--Sobic009G035000 Sobic006G009200--Sobic003G129700 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic006G009200--Sobic009G158150 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic006G009200--Sobic009G025750 Sobic006G009200--Sobic008G041500 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic006G009200--Sobic001G050650 Sobic008G041500--Sobic009G035000 Sobic008G041500--Sobic003G282400 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic008G041500--Sobic007G179100 Sobic008G041500--Sobic010G002600 Sobic008G041500--Sobic002G062400 Sobic008G041500--Sobic001G163500 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic008G041500--Sobic010G156300 Sobic008G041500--Sobic003G129700 Sobic008G041500--Sobic007G045750 Sobic004G181400--Sobic010G002600 Sobic004G181400--Sobic006G192900 Sobic004G181400--Sobic008G041500 Sobic004G181400--Sobic002G319900 Sobic004G181400--Sobic009G035000 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic004G181400--Sobic003G267150 Sobic004G149150 Sobic004G149150 Sobic004G181400--Sobic004G149150 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic004G181400--Sobic008G108100 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic004G181400--Sobic004G173300 Sobic004G093800--Sobic002G307500 Sobic004G093800--Sobic001G489400 Sobic004G093800--Sobic009G199401 Sobic004G093800--Sobic004G173300 Sobic004G093800--Sobic010G002600 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic004G093800--Sobic008G142500 Sobic004G093800--Sobic010G229025 Sobic004G093800--Sobic006G192900 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic004G093800--Sobic005G131500 Sobic002G062400--Sobic003G129700 Sobic002G062400--Sobic007G045750 Sobic002G062400--Sobic001G163500 Sobic002G062400--Sobic009G158150 Sobic002G062400--Sobic003G282400 Sobic002G062400--Sobic009G035000 Sobic002G062400--Sobic006G009200 Sobic002G062400--Sobic001G050650 Sobic002G062400--Sobic005G168900
Octagon: transcription factors


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