Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G142500.1
Synonym Sb08g019320
Functional annotation Leucine Rich Repeat family protein, expressed
UniProt A0A1B6PDR0
Pfam PF08263 PF00560 PF13855
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF54
NCBI CDD KOG0472; Leucine-rich repeat protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G74360 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g28270.1 : Leucine Rich Repeat family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025168
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G014600 - -
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20 Sobic.010G002600 methyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic008G142500--Sobic006G221500 Sobic001G014600--Sobic009G173700 Sobic001G014600--Sobic008G142500 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic001G014600--Sobic006G235801 Sobic001G014600--Sobic009G035000 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic001G014600--Sobic005G187700 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic001G014600--Sobic005G119400 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic001G014600--Sobic001G401750 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic001G014600--Sobic009G025750 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic001G014600--Sobic007G042700 Sobic009G173700--Sobic005G187700 Sobic009G173700--Sobic001G014600 Sobic009G173700--Sobic006G221500 Sobic009G173700--Sobic008G142500 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic009G173700--Sobic001G100300 Sobic009G173700--Sobic006G235801 Sobic003G341900 Sobic003G341900 Sobic009G173700--Sobic003G341900 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic009G173700--Sobic007G149500 Sobic009G173700--Sobic007G042700 Sobic001G326500--Sobic008G142500 Sobic001G326500--Sobic009G173700 Sobic001G326500--Sobic006G083050 Sobic001G326500--Sobic003G068100 Sobic001G326500--Sobic005G116800 Sobic001G326500--Sobic002G421100 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic001G326500--Sobic010G089350 Sobic001G326500--Sobic001G014600 Sobic001G326500--Sobic006G221500 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic009G035000--Sobic008G041500 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic009G035000--Sobic002G062400 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic009G035000--Sobic007G045750 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic009G035000--Sobic003G129700 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic009G035000--Sobic006G009200 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic009G035000--Sobic003G282400 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic009G035000--Sobic006G193801 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic009G035000--Sobic010G002600 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic009G035000--Sobic001G163500 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic006G083050--Sobic009G115800 Sobic005G116800--Sobic006G083050 Sobic005G116800--Sobic005G041150 Sobic005G116800--Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic003G261766 Sobic005G116800--Sobic008G142500 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G115800 Sobic005G116800--Sobic003G068100 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic002G421100--Sobic009G199401 Sobic002G421100--Sobic008G142500 Sobic002G421100--Sobic006G083050 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic002G421100--Sobic010G229025 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic002G421100--Sobic001G489400 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic002G421100--Sobic003G162600 Sobic002G421100--Sobic003G068100 Sobic002G421100--Sobic006G221500 Sobic002G421100--Sobic001G014600 Sobic003G067900 Sobic003G067900 Sobic003G068100--Sobic003G067900 Sobic003G068100--Sobic006G083050 Sobic001G534132 Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic008G142500 Sobic003G068100--Sobic005G116800 Sobic003G068100--Sobic001G326500 Sobic003G068100--Sobic002G421100 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic003G068100--Sobic006G159500 Sobic003G068100--Sobic009G115800 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic006G221500--Sobic006G136300 Sobic006G221500--Sobic009G173700 Sobic006G221500--Sobic006G235801 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic006G221500--Sobic002G046150 Sobic001G052700 Sobic001G052700 Sobic006G221500--Sobic001G052700 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic006G221500--Sobic004G267400 Sobic006G221500--Sobic010G089350 Sobic006G221500--Sobic003G162600 Sobic006G221500--Sobic008G142500
Octagon: transcription factors


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