Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G068100.1
Synonym Sb03g005780
Functional annotation receptor kinase, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q1R2
Pfam PF00560 PF13855 PF00069
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF187
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0006468protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47570 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g05870.1 : receptor kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023418
Brachypodium KQK02274
Barley -
Wheat TraesCS6B02G089100 , TraesCS3B02G588300 , TraesCS1B02G004700 , TraesCS7A02G432300 , TraesCS4B02G360600 , TraesCSU02G118000 , TraesCS4A02G379800 , TraesCS3A02G043500 , TraesCS6A02G004100 , TraesCS4B02G360600 , TraesCS6D02G000900
Populus PNT09441


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G067900 - -
2 Sobic.006G083050 - -
3 Sobic.001G534132 - -
4 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
5 Sobic.005G116800 - -
6 Sobic.001G326500 OsFBX157 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -
8 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
9 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
10 Sobic.003G261766 - -
11 Sobic.005G041150 - -
12 Sobic.009G134700 - -
13 Sobic.008G108100 - -
14 Sobic.009G199401 - -
15 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
16 Sobic.005G216833 - -
17 Sobic.005G131500 - -
18 Sobic.010G229025 - -
19 Sobic.009G035000 expressed protein -
20 Sobic.003G267150 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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