Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G131500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PS65
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056485
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G089266 - -
2 Sobic.006G085601 - K17362: acyl-coenzyme A thioesterase 13
3 Sobic.004G093800 integral membrane protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G173300 expressed protein -
5 Sobic.003G068100 receptor kinase, putative, expressed -
6 Sobic.009G216200 - -
7 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.002G307500 MATH domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G267400 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
10 Sobic.009G253900 - -
11 Sobic.009G204700 light repressible receptor protein kinase, putative, expressed -
12 Sobic.003G433000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
13 Sobic.001G326500 OsFBX157 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.010G229025 - -
15 Sobic.007G001700 ATOFP18/OFP18, putative, expressed -
16 Sobic.010G089350 - -
17 Sobic.001G489400 3-dehydroquinate synthase, putative, expressed -
18 Sobic.003G067900 - -
19 Sobic.002G377501 - -
20 Sobic.006G221500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@acyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic006G089266 Sobic006G089266 Sobic005G131500--Sobic006G089266 Sobic006G085601 Sobic006G085601 Sobic005G131500--Sobic006G085601 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic005G131500--Sobic004G093800 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic005G131500--Sobic004G173300 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic005G131500--Sobic003G068100 Sobic009G216200 Sobic009G216200 Sobic005G131500--Sobic009G216200 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic005G131500--Sobic008G142500 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic005G131500--Sobic002G307500 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic005G131500--Sobic004G267400 Sobic009G253900 Sobic009G253900 Sobic006G089266--Sobic009G253900 Sobic006G089266--Sobic005G131500 Sobic006G089266--Sobic004G173300 Sobic006G089266--Sobic004G093800 Sobic007G001700 Sobic007G001700 Sobic006G089266--Sobic007G001700 Sobic005G218300 Sobic005G218300 Sobic006G089266--Sobic005G218300 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic006G089266--Sobic002G377501 Sobic006G089266--Sobic009G216200 Sobic006G089266--Sobic002G307500 Sobic006G085601--Sobic005G131500 Sobic006G085601--Sobic009G216200 Sobic006G085601--Sobic004G267400 Sobic006G085601--Sobic006G089266 Sobic006G085601--Sobic003G068100 Sobic006G085601--Sobic004G093800 Sobic003G433000 Sobic003G433000 Sobic006G085601--Sobic003G433000 Sobic009G204700 Sobic009G204700 Sobic006G085601--Sobic009G204700 Sobic006G085601--Sobic008G142500 Sobic004G093800--Sobic002G307500 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic004G093800--Sobic001G489400 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic004G093800--Sobic009G199401 Sobic004G093800--Sobic004G173300 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic004G093800--Sobic010G002600 Sobic004G093800--Sobic008G142500 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic004G093800--Sobic010G229025 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic004G093800--Sobic006G192900 Sobic004G093800--Sobic005G131500 Sobic004G173300--Sobic004G093800 Sobic004G173300--Sobic010G002600 Sobic004G173300--Sobic005G131500 Sobic004G173300--Sobic002G307500 Sobic004G173300--Sobic006G089266 Sobic004G173300--Sobic006G192900 Sobic004G181400 Sobic004G181400 Sobic004G173300--Sobic004G181400 Sobic004G173300--Sobic009G253900 Sobic004G173300--Sobic008G142500 Sobic003G067900 Sobic003G067900 Sobic003G068100--Sobic003G067900 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic003G068100--Sobic006G083050 Sobic001G534132 Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic008G142500 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic003G068100--Sobic005G116800 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic003G068100--Sobic001G326500 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic003G068100--Sobic002G421100 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic003G068100--Sobic006G159500 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic003G068100--Sobic009G115800 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic009G216200--Sobic003G443601 Sobic009G216200--Sobic005G131500 Sobic009G216200--Sobic002G377501 Sobic009G216200--Sobic009G204700 Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic009G216200--Sobic002G259900 Sobic009G216200--Sobic006G089266 Sobic009G216200--Sobic006G085601 Sobic009G216200--Sobic004G267400 Sobic009G216200--Sobic003G433000 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic008G142500--Sobic006G221500 Sobic002G307500--Sobic004G093800 Sobic002G307500--Sobic006G192900 Sobic002G307500--Sobic001G489400 Sobic002G307500--Sobic010G229025 Sobic002G307500--Sobic009G199401 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic002G307500--Sobic006G235801 Sobic002G307500--Sobic006G221500 Sobic002G307500--Sobic010G002600 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic002G307500--Sobic006G136300 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic004G267400--Sobic004G068600 Sobic001G052700 Sobic001G052700 Sobic004G267400--Sobic001G052700 Sobic004G267400--Sobic006G136300 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic004G267400--Sobic002G374000 Sobic004G267400--Sobic006G221500 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic004G267400--Sobic007G183600 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic004G267400--Sobic004G315400 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic004G267400--Sobic003G069601 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic004G267400--Sobic005G228650
Octagon: transcription factors


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