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Transcriptome id Sobic.010G089350.1
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UniProt A0A1W0VS18
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G221500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@acyltransferase, putative, expressed -
2 Sobic.006G235801 - -
3 Sobic.009G173700 expansin precursor, putative, expressed -
4 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
5 Sobic.006G136300 - -
6 Sobic.007G183600 expressed protein -
7 Sobic.001G326500 OsFBX157 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.004G267400 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
9 Sobic.007G042700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20528920)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
10 Sobic.001G014600 - -
11 Sobic.004G267650 - -
12 Sobic.002G046150 - -
13 Sobic.001G100300 - -
14 Sobic.006G045601 - -
15 Sobic.003G069601 - -
16 Sobic.010G100600 expressed protein -
17 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -
18 Sobic.008G046700 nodulation-signaling pathway 2 protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G374000 - -
20 Sobic.001G052700 vacuolar protein sorting-associated protein 35, putative, expressed K18468: vacuolar protein sorting-associated protein 35


Gene co-expression network
sample Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic010G089350--Sobic006G221500 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic010G089350--Sobic006G235801 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic010G089350--Sobic009G173700 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic010G089350--Sobic008G142500 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic010G089350--Sobic006G136300 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic010G089350--Sobic007G183600 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic010G089350--Sobic001G326500 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic010G089350--Sobic004G267400 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic010G089350--Sobic007G042700 Sobic006G221500--Sobic006G136300 Sobic006G221500--Sobic009G173700 Sobic006G221500--Sobic006G235801 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic006G221500--Sobic002G046150 Sobic001G052700 Sobic001G052700 Sobic006G221500--Sobic001G052700 Sobic006G221500--Sobic004G267400 Sobic006G221500--Sobic010G089350 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic006G221500--Sobic003G162600 Sobic006G221500--Sobic008G142500 Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic006G235801--Sobic010G100600 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic006G235801--Sobic001G014600 Sobic006G235801--Sobic007G042700 Sobic003G018150 Sobic003G018150 Sobic006G235801--Sobic003G018150 Sobic006G235801--Sobic009G173700 Sobic006G235801--Sobic006G221500 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic006G235801--Sobic001G100300 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic006G235801--Sobic001G278900 Sobic006G235801--Sobic010G089350 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic009G173700--Sobic005G187700 Sobic009G173700--Sobic001G014600 Sobic009G173700--Sobic006G221500 Sobic009G173700--Sobic008G142500 Sobic009G173700--Sobic001G100300 Sobic009G173700--Sobic006G235801 Sobic003G341900 Sobic003G341900 Sobic009G173700--Sobic003G341900 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic009G173700--Sobic007G149500 Sobic009G173700--Sobic007G042700 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic008G142500--Sobic006G221500 Sobic006G136300--Sobic006G221500 Sobic006G136300--Sobic001G052700 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic006G136300--Sobic004G315400 Sobic006G136300--Sobic004G267400 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic006G136300--Sobic005G031400 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic006G136300--Sobic002G374000 Sobic006G136300--Sobic006G235801 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic006G136300--Sobic006G213350 Sobic006G136300--Sobic009G173700 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic007G183600--Sobic003G069601 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic007G183600--Sobic004G072201 Sobic007G183600--Sobic002G374000 Sobic004G093700 Sobic004G093700 Sobic007G183600--Sobic004G093700 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic007G183600--Sobic004G068600 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic007G183600--Sobic001G383200 Sobic003G063400 Sobic003G063400 Sobic007G183600--Sobic003G063400 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic007G183600--Sobic001G442000 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic007G183600--Sobic009G026600 Sobic001G326500--Sobic008G142500 Sobic001G326500--Sobic009G173700 Sobic001G326500--Sobic006G083050 Sobic001G326500--Sobic003G068100 Sobic001G326500--Sobic005G116800 Sobic001G326500--Sobic002G421100 Sobic001G326500--Sobic010G089350 Sobic001G326500--Sobic001G014600 Sobic001G326500--Sobic006G221500 Sobic004G267400--Sobic004G068600 Sobic004G267400--Sobic001G052700 Sobic004G267400--Sobic006G136300 Sobic004G267400--Sobic002G374000 Sobic004G267400--Sobic006G221500 Sobic004G267400--Sobic007G183600 Sobic004G267400--Sobic004G315400 Sobic004G267400--Sobic003G069601 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic004G267400--Sobic005G228650 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic007G042700--Sobic001G497400 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic007G042700--Sobic002G000350 Sobic007G042700--Sobic001G278900 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic007G042700--Sobic003G085533 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic007G042700--Sobic004G252300 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic007G042700--Sobic004G072300 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic007G042700--Sobic001G471050 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic007G042700--Sobic004G249950 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic007G042700--Sobic006G097600
Octagon: transcription factors


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