Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G326500.2
Synonym
Functional annotation OsFBX157 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5S8Q6
Pfam PF00646
Panther DB PTHR10706 PTHR10706:SF131
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G07610 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g35060.1 : OsFBX238 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G016030.1 , HORVU1Hr1G002290.1 , HORVU1Hr1G002290.2 , HORVU1Hr1G002290.3
Wheat TraesCS1B02G093000 , TraesCS1B02G093100 , TraesCS3B02G491600 , TraesCS1B02G093100 , TraesCS4B02G367100 , TraesCS7D02G467700
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.001G326500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
2 Sobic.009G173700 expansin precursor, putative, expressed -
3 Sobic.006G083050 - -
4 Sobic.003G068100 receptor kinase, putative, expressed -
5 Sobic.005G116800 - -
6 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -
7 Sobic.010G089350 - -
8 Sobic.001G014600 - -
9 Sobic.006G221500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@acyltransferase, putative, expressed -
10 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
11 Sobic.003G142500 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
12 Sobic.009G025750 - -
13 Sobic.009G035000 expressed protein -
14 Sobic.001G180950 - -
15 Sobic.009G199401 - -
16 Sobic.003G067900 - -
17 Sobic.005G187700 receptor kinase, putative, expressed -
18 Sobic.008G041500 - -
19 Sobic.005G004900 PMR5, putative, expressed -
20 Sobic.004G267650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic001G326500--Sobic008G142500 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic001G326500--Sobic009G173700 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic001G326500--Sobic006G083050 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic001G326500--Sobic003G068100 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic001G326500--Sobic005G116800 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic001G326500--Sobic002G421100 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic001G326500--Sobic010G089350 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic001G326500--Sobic001G014600 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic001G326500--Sobic006G221500 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic008G142500--Sobic006G221500 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic009G173700--Sobic005G187700 Sobic009G173700--Sobic001G014600 Sobic009G173700--Sobic006G221500 Sobic009G173700--Sobic008G142500 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic009G173700--Sobic001G100300 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic009G173700--Sobic006G235801 Sobic003G341900 Sobic003G341900 Sobic009G173700--Sobic003G341900 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic009G173700--Sobic007G149500 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic009G173700--Sobic007G042700 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic006G083050--Sobic009G115800 Sobic003G067900 Sobic003G067900 Sobic003G068100--Sobic003G067900 Sobic003G068100--Sobic006G083050 Sobic001G534132 Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic008G142500 Sobic003G068100--Sobic005G116800 Sobic003G068100--Sobic001G326500 Sobic003G068100--Sobic002G421100 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic003G068100--Sobic006G159500 Sobic003G068100--Sobic009G115800 Sobic005G116800--Sobic006G083050 Sobic005G116800--Sobic005G041150 Sobic005G116800--Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic003G261766 Sobic005G116800--Sobic008G142500 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G115800 Sobic005G116800--Sobic003G068100 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic002G421100--Sobic009G199401 Sobic002G421100--Sobic008G142500 Sobic002G421100--Sobic006G083050 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic002G421100--Sobic010G229025 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic002G421100--Sobic001G489400 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic002G421100--Sobic003G162600 Sobic002G421100--Sobic003G068100 Sobic002G421100--Sobic006G221500 Sobic002G421100--Sobic001G014600 Sobic010G089350--Sobic006G221500 Sobic010G089350--Sobic006G235801 Sobic010G089350--Sobic009G173700 Sobic010G089350--Sobic008G142500 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic010G089350--Sobic006G136300 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic010G089350--Sobic007G183600 Sobic010G089350--Sobic001G326500 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic010G089350--Sobic004G267400 Sobic010G089350--Sobic007G042700 Sobic001G014600--Sobic009G173700 Sobic001G014600--Sobic008G142500 Sobic001G014600--Sobic006G235801 Sobic001G014600--Sobic009G035000 Sobic001G014600--Sobic005G187700 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic001G014600--Sobic005G119400 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic001G014600--Sobic001G401750 Sobic001G014600--Sobic009G025750 Sobic001G014600--Sobic007G042700 Sobic006G221500--Sobic006G136300 Sobic006G221500--Sobic009G173700 Sobic006G221500--Sobic006G235801 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic006G221500--Sobic002G046150 Sobic001G052700 Sobic001G052700 Sobic006G221500--Sobic001G052700 Sobic006G221500--Sobic004G267400 Sobic006G221500--Sobic010G089350 Sobic006G221500--Sobic003G162600 Sobic006G221500--Sobic008G142500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.