Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G199401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R450
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -
2 Sobic.001G489400 3-dehydroquinate synthase, putative, expressed -
3 Sobic.010G229025 - -
4 Sobic.003G162600 expressed protein -
5 Sobic.006G221500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@acyltransferase, putative, expressed -
6 Sobic.004G093800 integral membrane protein, putative, expressed -
7 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.005G116700 receptor kinase, putative, expressed -
9 Sobic.004G186950 - -
10 Sobic.006G136300 - -
11 Sobic.008G169500 - -
12 Sobic.006G083050 - -
13 Sobic.001G183550 - -
14 Sobic.002G307500 MATH domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G025750 - -
16 Sobic.001G014600 - -
17 Sobic.009G173700 expansin precursor, putative, expressed -
18 Sobic.002G207601 - -
19 Sobic.009G035000 expressed protein -
20 Sobic.009G139100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic009G199401--Sobic002G421100 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic009G199401--Sobic001G489400 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic009G199401--Sobic010G229025 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic009G199401--Sobic003G162600 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic009G199401--Sobic006G221500 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic009G199401--Sobic004G093800 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic009G199401--Sobic008G142500 Sobic005G116700 Sobic005G116700 Sobic009G199401--Sobic005G116700 Sobic004G186950 Sobic004G186950 Sobic009G199401--Sobic004G186950 Sobic002G421100--Sobic009G199401 Sobic002G421100--Sobic008G142500 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic002G421100--Sobic006G083050 Sobic002G421100--Sobic010G229025 Sobic002G421100--Sobic001G489400 Sobic002G421100--Sobic003G162600 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic002G421100--Sobic003G068100 Sobic002G421100--Sobic006G221500 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic002G421100--Sobic001G014600 Sobic001G489400--Sobic009G199401 Sobic001G489400--Sobic003G162600 Sobic001G489400--Sobic004G093800 Sobic001G489400--Sobic010G229025 Sobic001G489400--Sobic002G421100 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic001G489400--Sobic002G307500 Sobic001G489400--Sobic006G221500 Sobic002G207601 Sobic002G207601 Sobic001G489400--Sobic002G207601 Sobic001G489400--Sobic005G116700 Sobic010G229025--Sobic009G199401 Sobic010G229025--Sobic001G489400 Sobic010G229025--Sobic002G421100 Sobic010G229025--Sobic004G093800 Sobic001G183550 Sobic001G183550 Sobic010G229025--Sobic001G183550 Sobic010G229025--Sobic002G307500 Sobic010G229025--Sobic003G162600 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G229025--Sobic009G025750 Sobic010G229025--Sobic006G083050 Sobic003G162600--Sobic001G489400 Sobic003G162600--Sobic009G199401 Sobic003G162600--Sobic004G186950 Sobic003G162600--Sobic005G116700 Sobic003G162600--Sobic006G221500 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic003G162600--Sobic001G150100 Sobic003G162600--Sobic002G421100 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic003G162600--Sobic005G187700 Sobic003G162600--Sobic001G014600 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic006G221500--Sobic006G136300 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic006G221500--Sobic009G173700 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic006G221500--Sobic006G235801 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic006G221500--Sobic002G046150 Sobic001G052700 Sobic001G052700 Sobic006G221500--Sobic001G052700 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic006G221500--Sobic004G267400 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic006G221500--Sobic010G089350 Sobic006G221500--Sobic003G162600 Sobic006G221500--Sobic008G142500 Sobic004G093800--Sobic002G307500 Sobic004G093800--Sobic001G489400 Sobic004G093800--Sobic009G199401 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic004G093800--Sobic004G173300 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic004G093800--Sobic010G002600 Sobic004G093800--Sobic008G142500 Sobic004G093800--Sobic010G229025 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic004G093800--Sobic006G192900 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic004G093800--Sobic005G131500 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic008G142500--Sobic006G221500 Sobic005G116700--Sobic003G162600 Sobic005G116700--Sobic005G116800 Sobic003G068150 Sobic003G068150 Sobic005G116700--Sobic003G068150 Sobic005G116700--Sobic005G187700 Sobic005G116700--Sobic006G083050 Sobic005G116700--Sobic009G199401 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic005G116700--Sobic001G527550 Sobic005G116700--Sobic001G489400 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic005G116700--Sobic001G180950 Sobic004G186950--Sobic003G162600 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic004G186950--Sobic003G028700 Sobic007G167600 Sobic007G167600 Sobic004G186950--Sobic007G167600 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic004G186950--Sobic004G249950 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic004G186950--Sobic007G045750 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic004G186950--Sobic003G129700 Sobic004G186950--Sobic001G489400 Sobic004G186950--Sobic009G199401 Sobic004G186950--Sobic009G035000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.