Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G307500.1
Synonym Sb02g033755
Functional annotation MATH domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QEA5
Pfam PF00917
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G17380 : TRAF-like family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g33830.1 : MATH domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048096
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G307500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.002G207601 - -
20 Sobic.009G035000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic002G307500--Sobic004G093800 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic002G307500--Sobic006G192900 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic002G307500--Sobic001G489400 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic002G307500--Sobic010G229025 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic002G307500--Sobic009G199401 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic002G307500--Sobic006G235801 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic002G307500--Sobic006G221500 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic002G307500--Sobic010G002600 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic002G307500--Sobic006G136300 Sobic004G093800--Sobic002G307500 Sobic004G093800--Sobic001G489400 Sobic004G093800--Sobic009G199401 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic004G093800--Sobic004G173300 Sobic004G093800--Sobic010G002600 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic004G093800--Sobic008G142500 Sobic004G093800--Sobic010G229025 Sobic004G093800--Sobic006G192900 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic004G093800--Sobic005G131500 Sobic010G241400 Sobic010G241400 Sobic006G192900--Sobic010G241400 Sobic006G192900--Sobic010G002600 Sobic006G192900--Sobic002G307500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic006G192900--Sobic009G035000 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic006G192900--Sobic006G009200 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic006G192900--Sobic008G041500 Sobic004G181400 Sobic004G181400 Sobic006G192900--Sobic004G181400 Sobic006G192900--Sobic004G093800 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic006G192900--Sobic002G062400 Sobic001G489400--Sobic009G199401 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic001G489400--Sobic003G162600 Sobic001G489400--Sobic004G093800 Sobic001G489400--Sobic010G229025 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic001G489400--Sobic002G421100 Sobic001G489400--Sobic002G307500 Sobic001G489400--Sobic006G221500 Sobic002G207601 Sobic002G207601 Sobic001G489400--Sobic002G207601 Sobic005G116700 Sobic005G116700 Sobic001G489400--Sobic005G116700 Sobic010G229025--Sobic009G199401 Sobic010G229025--Sobic001G489400 Sobic010G229025--Sobic002G421100 Sobic010G229025--Sobic004G093800 Sobic001G183550 Sobic001G183550 Sobic010G229025--Sobic001G183550 Sobic010G229025--Sobic002G307500 Sobic010G229025--Sobic003G162600 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G229025--Sobic009G025750 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic010G229025--Sobic006G083050 Sobic009G199401--Sobic002G421100 Sobic009G199401--Sobic001G489400 Sobic009G199401--Sobic010G229025 Sobic009G199401--Sobic003G162600 Sobic009G199401--Sobic006G221500 Sobic009G199401--Sobic004G093800 Sobic009G199401--Sobic008G142500 Sobic009G199401--Sobic005G116700 Sobic004G186950 Sobic004G186950 Sobic009G199401--Sobic004G186950 Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic006G235801--Sobic010G100600 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic006G235801--Sobic001G014600 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic006G235801--Sobic007G042700 Sobic003G018150 Sobic003G018150 Sobic006G235801--Sobic003G018150 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic006G235801--Sobic009G173700 Sobic006G235801--Sobic006G221500 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic006G235801--Sobic001G100300 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic006G235801--Sobic001G278900 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic006G235801--Sobic010G089350 Sobic006G221500--Sobic006G136300 Sobic006G221500--Sobic009G173700 Sobic006G221500--Sobic006G235801 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic006G221500--Sobic002G046150 Sobic001G052700 Sobic001G052700 Sobic006G221500--Sobic001G052700 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic006G221500--Sobic004G267400 Sobic006G221500--Sobic010G089350 Sobic006G221500--Sobic003G162600 Sobic006G221500--Sobic008G142500 Sobic010G002600--Sobic008G041500 Sobic010G002600--Sobic009G035000 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic010G002600--Sobic006G193801 Sobic010G002600--Sobic006G192900 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic010G002600--Sobic003G282400 Sobic010G002600--Sobic004G181400 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic010G002600--Sobic002G319900 Sobic003G185000 Sobic003G185000 Sobic010G002600--Sobic003G185000 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic010G002600--Sobic001G163500 Sobic006G136300--Sobic006G221500 Sobic006G136300--Sobic001G052700 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic006G136300--Sobic004G315400 Sobic006G136300--Sobic004G267400 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic006G136300--Sobic005G031400 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic006G136300--Sobic002G374000 Sobic006G136300--Sobic006G235801 Sobic006G213350 Sobic006G213350 Sobic006G136300--Sobic006G213350 Sobic006G136300--Sobic009G173700
Octagon: transcription factors


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