Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G054700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YHG7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
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cDNA sequences
Sobic.010G054700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G136950 - -
2 Sobic.001G213832 - -
3 Sobic.004G111200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.005G218300 - -
5 Sobic.003G018150 - -
6 Sobic.006G045601 - -
7 Sobic.004G347000 - -
8 Sobic.006G235801 - -
9 Sobic.010G195000 guanine nucleotide exchange family protein, putative, expressed K18442: ARFGEF, brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein
10 Sobic.010G100700 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G076300 - -
12 Sobic.004G093700 tetraspanin family protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G102250 - -
14 Sobic.001G278900 - -
15 Sobic.002G307500 MATH domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G235400 - -
17 Sobic.009G253900 - -
18 Sobic.007G141900 resistance protein SlVe1 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.003G023450 - -
20 Sobic.002G268600 PCF-like (ClassI) Subclade 7 TCP(PubMedID : 21444336)@"TCP is actually a family of transcription factors named after: teosinte branched 1 (tb1, Zea mays (Maize)), cycloidea (cyc) (Antirrhinum majus) (Garden snapdragon) and PCF in rice (Oryza sativa)."(PubMedID : 27917941)@"plant-specific TCP family of transcription factors, in particular, have been shown to play key roles in evolution of plant form and structure (putative)"(PubMedID : 28383054)@TCP family transcription factor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G054700 Sobic010G054700 Sobic009G136950 Sobic009G136950 Sobic010G054700--Sobic009G136950 Sobic001G213832 Sobic001G213832 Sobic010G054700--Sobic001G213832 Sobic004G111200 Sobic004G111200 Sobic010G054700--Sobic004G111200 Sobic005G218300 Sobic005G218300 Sobic010G054700--Sobic005G218300 Sobic003G018150 Sobic003G018150 Sobic010G054700--Sobic003G018150 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic010G054700--Sobic006G045601 Sobic004G347000 Sobic004G347000 Sobic010G054700--Sobic004G347000 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic010G054700--Sobic006G235801 Sobic010G195000 Sobic010G195000 Sobic010G054700--Sobic010G195000 Sobic009G136950--Sobic001G213832 Sobic009G136950--Sobic010G054700 Sobic001G245650 Sobic001G245650 Sobic009G136950--Sobic001G245650 Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic009G136950--Sobic004G320900 Sobic009G136950--Sobic005G218300 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic009G136950--Sobic007G141900 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic009G136950--Sobic002G012100 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic009G136950--Sobic010G196466 Sobic001G494200 Sobic001G494200 Sobic009G136950--Sobic001G494200 Sobic001G213832--Sobic009G136950 Sobic001G213832--Sobic010G054700 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic001G213832--Sobic009G102250 Sobic001G213832--Sobic002G012100 Sobic001G213832--Sobic004G111200 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic001G213832--Sobic003G023450 Sobic001G213832--Sobic001G494200 Sobic001G213832--Sobic010G196466 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic001G213832--Sobic004G242800 Sobic004G111200--Sobic009G102250 Sobic002G138400 Sobic002G138400 Sobic004G111200--Sobic002G138400 Sobic004G111200--Sobic010G054700 Sobic004G111200--Sobic004G347000 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic004G111200--Sobic003G064901 Sobic004G111200--Sobic003G018150 Sobic004G032200 Sobic004G032200 Sobic004G111200--Sobic004G032200 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic004G111200--Sobic006G016950 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic004G111200--Sobic009G143750 Sobic009G253900 Sobic009G253900 Sobic005G218300--Sobic009G253900 Sobic005G218300--Sobic010G054700 Sobic005G218300--Sobic009G136950 Sobic005G218300--Sobic004G347000 Sobic002G268600 Sobic002G268600 Sobic005G218300--Sobic002G268600 Sobic005G218300--Sobic001G213832 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic005G218300--Sobic002G307500 Sobic005G218300--Sobic001G245650 Sobic006G089266 Sobic006G089266 Sobic005G218300--Sobic006G089266 Sobic003G018150--Sobic006G235801 Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic003G018150--Sobic010G100600 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic003G018150--Sobic001G278900 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic003G018150--Sobic001G471050 Sobic003G018150--Sobic010G054700 Sobic003G018150--Sobic004G111200 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic003G018150--Sobic006G097600 Sobic004G150300 Sobic004G150300 Sobic003G018150--Sobic004G150300 Sobic002G204050 Sobic002G204050 Sobic003G018150--Sobic002G204050 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic006G045601--Sobic009G235400 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic006G045601--Sobic002G374000 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic006G045601--Sobic003G069601 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic006G045601--Sobic001G100300 Sobic004G093700 Sobic004G093700 Sobic006G045601--Sobic004G093700 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic006G045601--Sobic007G183600 Sobic006G045601--Sobic006G235801 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic006G045601--Sobic004G072201 Sobic006G045601--Sobic010G054700 Sobic004G347000--Sobic004G111200 Sobic004G347000--Sobic010G054700 Sobic001G291701 Sobic001G291701 Sobic004G347000--Sobic001G291701 Sobic004G347000--Sobic009G102250 Sobic004G347000--Sobic005G218300 Sobic008G040201 Sobic008G040201 Sobic004G347000--Sobic008G040201 Sobic002G076300 Sobic002G076300 Sobic004G347000--Sobic002G076300 Sobic004G347000--Sobic001G213832 Sobic004G107550 Sobic004G107550 Sobic004G347000--Sobic004G107550 Sobic006G235801--Sobic010G100600 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic006G235801--Sobic001G014600 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic006G235801--Sobic007G042700 Sobic006G235801--Sobic003G018150 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic006G235801--Sobic009G173700 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic006G235801--Sobic006G221500 Sobic006G235801--Sobic001G100300 Sobic006G235801--Sobic001G278900 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic006G235801--Sobic010G089350 Sobic010G195000--Sobic004G093700 Sobic010G195000--Sobic009G235400 Sobic010G195000--Sobic006G045601 Sobic010G195000--Sobic002G076300 Sobic010G195000--Sobic010G054700 Sobic008G177100 Sobic008G177100 Sobic010G195000--Sobic008G177100 Sobic010G195000--Sobic007G183600 Sobic001G329001 Sobic001G329001 Sobic010G195000--Sobic001G329001 Sobic010G100700 Sobic010G100700 Sobic010G195000--Sobic010G100700
Octagon: transcription factors


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