Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G347000.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQD5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G111200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.010G054700 - -
3 Sobic.001G291701 - -
4 Sobic.009G102250 - -
5 Sobic.005G218300 - -
6 Sobic.008G040201 - K13100: pre-mRNA-splicing factor CWC22
7 Sobic.002G076300 - -
8 Sobic.001G213832 - -
9 Sobic.004G107550 - -
10 Sobic.003G064901 - -
11 Sobic.002G138400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
12 Sobic.009G136950 - -
13 Sobic.004G173300 expressed protein -
14 Sobic.001G494200 PPR repeat containing protein, expressed -
15 Sobic.001G432400 expressed protein -
16 Sobic.004G103450 - -
17 Sobic.002G268600 PCF-like (ClassI) Subclade 7 TCP(PubMedID : 21444336)@"TCP is actually a family of transcription factors named after: teosinte branched 1 (tb1, Zea mays (Maize)), cycloidea (cyc) (Antirrhinum majus) (Garden snapdragon) and PCF in rice (Oryza sativa)."(PubMedID : 27917941)@"plant-specific TCP family of transcription factors, in particular, have been shown to play key roles in evolution of plant form and structure (putative)"(PubMedID : 28383054)@TCP family transcription factor, putative, expressed -
18 Sobic.009G253900 - -
19 Sobic.004G032200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K02201: pantetheine-phosphate adenylyltransferase
20 Sobic.006G193801 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G347000 Sobic004G347000 Sobic004G111200 Sobic004G111200 Sobic004G347000--Sobic004G111200 Sobic010G054700 Sobic010G054700 Sobic004G347000--Sobic010G054700 Sobic001G291701 Sobic001G291701 Sobic004G347000--Sobic001G291701 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic004G347000--Sobic009G102250 Sobic005G218300 Sobic005G218300 Sobic004G347000--Sobic005G218300 Sobic008G040201 Sobic008G040201 Sobic004G347000--Sobic008G040201 Sobic002G076300 Sobic002G076300 Sobic004G347000--Sobic002G076300 Sobic001G213832 Sobic001G213832 Sobic004G347000--Sobic001G213832 Sobic004G107550 Sobic004G107550 Sobic004G347000--Sobic004G107550 Sobic004G111200--Sobic009G102250 Sobic002G138400 Sobic002G138400 Sobic004G111200--Sobic002G138400 Sobic004G111200--Sobic010G054700 Sobic004G111200--Sobic004G347000 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic004G111200--Sobic003G064901 Sobic003G018150 Sobic003G018150 Sobic004G111200--Sobic003G018150 Sobic004G032200 Sobic004G032200 Sobic004G111200--Sobic004G032200 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic004G111200--Sobic006G016950 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic004G111200--Sobic009G143750 Sobic009G136950 Sobic009G136950 Sobic010G054700--Sobic009G136950 Sobic010G054700--Sobic001G213832 Sobic010G054700--Sobic004G111200 Sobic010G054700--Sobic005G218300 Sobic010G054700--Sobic003G018150 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic010G054700--Sobic006G045601 Sobic010G054700--Sobic004G347000 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic010G054700--Sobic006G235801 Sobic010G195000 Sobic010G195000 Sobic010G054700--Sobic010G195000 Sobic001G291701--Sobic008G040201 Sobic004G103450 Sobic004G103450 Sobic001G291701--Sobic004G103450 Sobic001G152150 Sobic001G152150 Sobic001G291701--Sobic001G152150 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic001G291701--Sobic004G073232 Sobic009G217450 Sobic009G217450 Sobic001G291701--Sobic009G217450 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic001G291701--Sobic006G193801 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic001G291701--Sobic003G096750 Sobic009G102550 Sobic009G102550 Sobic001G291701--Sobic009G102550 Sobic001G291701--Sobic004G347000 Sobic009G102250--Sobic003G064901 Sobic009G102250--Sobic002G138400 Sobic009G102250--Sobic004G032200 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic009G102250--Sobic001G167000 Sobic009G102250--Sobic004G111200 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic009G102250--Sobic001G182700 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic009G102250--Sobic010G196466 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic009G102250--Sobic001G270800 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic009G102250--Sobic001G182800 Sobic009G253900 Sobic009G253900 Sobic005G218300--Sobic009G253900 Sobic005G218300--Sobic010G054700 Sobic005G218300--Sobic009G136950 Sobic005G218300--Sobic004G347000 Sobic002G268600 Sobic002G268600 Sobic005G218300--Sobic002G268600 Sobic005G218300--Sobic001G213832 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic005G218300--Sobic002G307500 Sobic001G245650 Sobic001G245650 Sobic005G218300--Sobic001G245650 Sobic006G089266 Sobic006G089266 Sobic005G218300--Sobic006G089266 Sobic008G040201--Sobic001G291701 Sobic008G040201--Sobic004G103450 Sobic008G040201--Sobic001G152150 Sobic008G040201--Sobic006G193801 Sobic008G040201--Sobic009G217450 Sobic008G040201--Sobic004G073232 Sobic008G040201--Sobic009G102550 Sobic008G040201--Sobic003G096750 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic008G040201--Sobic006G210266 Sobic001G498033 Sobic001G498033 Sobic002G076300--Sobic001G498033 Sobic001G329001 Sobic001G329001 Sobic002G076300--Sobic001G329001 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic002G076300--Sobic002G086700 Sobic002G076300--Sobic010G195000 Sobic002G076300--Sobic010G054700 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic002G076300--Sobic002G377501 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic002G076300--Sobic004G242800 Sobic002G076300--Sobic004G347000 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic002G076300--Sobic009G235400 Sobic001G213832--Sobic009G136950 Sobic001G213832--Sobic010G054700 Sobic001G213832--Sobic009G102250 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic001G213832--Sobic002G012100 Sobic001G213832--Sobic004G111200 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic001G213832--Sobic003G023450 Sobic001G494200 Sobic001G494200 Sobic001G213832--Sobic001G494200 Sobic001G213832--Sobic010G196466 Sobic001G213832--Sobic004G242800 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic004G107550--Sobic001G487900 Sobic004G107550--Sobic003G064901 Sobic004G107550--Sobic004G103450 Sobic004G107550--Sobic009G143750 Sobic004G107550--Sobic002G138400 Sobic004G107550--Sobic009G102250 Sobic004G007133 Sobic004G007133 Sobic004G107550--Sobic004G007133 Sobic004G107550--Sobic001G291701 Sobic005G118900 Sobic005G118900 Sobic004G107550--Sobic005G118900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.