Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G040201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R4N0
Pfam PF02847
Panther DB PTHR18034 PTHR18034:SF3
NCBI CDD KOG2140; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology K13100; pre-mRNA-splicing factor CWC22
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G80930 : MIF4G domain-containing protein / MA3 domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g15420.1 : nucampholin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.004G111200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.003G282400 OsMADS32 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G040201 Sobic008G040201 Sobic001G291701 Sobic001G291701 Sobic008G040201--Sobic001G291701 Sobic004G103450 Sobic004G103450 Sobic008G040201--Sobic004G103450 Sobic001G152150 Sobic001G152150 Sobic008G040201--Sobic001G152150 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic008G040201--Sobic006G193801 Sobic009G217450 Sobic009G217450 Sobic008G040201--Sobic009G217450 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic008G040201--Sobic004G073232 Sobic009G102550 Sobic009G102550 Sobic008G040201--Sobic009G102550 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic008G040201--Sobic003G096750 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic008G040201--Sobic006G210266 Sobic001G291701--Sobic008G040201 Sobic001G291701--Sobic004G103450 Sobic001G291701--Sobic001G152150 Sobic001G291701--Sobic004G073232 Sobic001G291701--Sobic009G217450 Sobic001G291701--Sobic006G193801 Sobic001G291701--Sobic003G096750 Sobic001G291701--Sobic009G102550 Sobic004G347000 Sobic004G347000 Sobic001G291701--Sobic004G347000 Sobic004G103450--Sobic001G291701 Sobic004G103450--Sobic008G040201 Sobic004G103450--Sobic004G073232 Sobic004G103450--Sobic009G217450 Sobic004G103450--Sobic001G152150 Sobic004G103450--Sobic003G096750 Sobic004G103450--Sobic009G102550 Sobic004G107550 Sobic004G107550 Sobic004G103450--Sobic004G107550 Sobic004G103450--Sobic006G193801 Sobic001G152150--Sobic009G102550 Sobic001G152150--Sobic008G040201 Sobic001G152150--Sobic004G073232 Sobic001G152150--Sobic001G291701 Sobic001G152150--Sobic004G103450 Sobic001G152150--Sobic009G217450 Sobic001G152150--Sobic006G210266 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic001G152150--Sobic001G314350 Sobic002G104450 Sobic002G104450 Sobic001G152150--Sobic002G104450 Sobic002G005900 Sobic002G005900 Sobic006G193801--Sobic002G005900 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic006G193801--Sobic009G035000 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic006G193801--Sobic001G163500 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic006G193801--Sobic003G282400 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic006G193801--Sobic010G002600 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic006G193801--Sobic008G041500 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic006G193801--Sobic003G129700 Sobic006G193801--Sobic008G040201 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic006G193801--Sobic002G062400 Sobic009G217450--Sobic004G103450 Sobic009G217450--Sobic008G040201 Sobic009G217450--Sobic001G291701 Sobic009G217450--Sobic001G152150 Sobic009G217450--Sobic009G102550 Sobic009G217450--Sobic004G073232 Sobic004G301250 Sobic004G301250 Sobic009G217450--Sobic004G301250 Sobic009G217450--Sobic006G193801 Sobic009G217450--Sobic001G314350 Sobic004G073232--Sobic004G103450 Sobic004G073232--Sobic001G314350 Sobic004G073232--Sobic009G102550 Sobic004G073232--Sobic001G152150 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic004G073232--Sobic003G192500 Sobic004G073232--Sobic001G291701 Sobic004G073232--Sobic008G040201 Sobic004G073232--Sobic004G301250 Sobic004G073232--Sobic009G217450 Sobic009G102550--Sobic001G152150 Sobic009G102550--Sobic004G073232 Sobic009G102550--Sobic004G301250 Sobic009G102550--Sobic008G040201 Sobic009G102550--Sobic009G217450 Sobic009G102550--Sobic004G103450 Sobic009G102550--Sobic001G314350 Sobic009G102550--Sobic001G291701 Sobic003G123900 Sobic003G123900 Sobic009G102550--Sobic003G123900 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic003G096750--Sobic002G312550 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic003G096750--Sobic010G214150 Sobic003G096750--Sobic004G103450 Sobic003G096750--Sobic001G291701 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic003G096750--Sobic008G040501 Sobic003G096750--Sobic008G040201 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic003G096750--Sobic001G502801 Sobic003G096750--Sobic004G073232 Sobic003G096750--Sobic001G314350 Sobic006G210266--Sobic001G314350 Sobic010G207175 Sobic010G207175 Sobic006G210266--Sobic010G207175 Sobic006G210266--Sobic001G163500 Sobic006G210266--Sobic002G312550 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic006G210266--Sobic006G243300 Sobic006G210266--Sobic001G152150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G210266--Sobic007G179100 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic006G210266--Sobic010G166850 Sobic006G210266--Sobic008G040201
Octagon: transcription factors


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