Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G103450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMT4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G291701 - -
2 Sobic.008G040201 - K13100: pre-mRNA-splicing factor CWC22
3 Sobic.004G073232 - -
4 Sobic.009G217450 - -
5 Sobic.001G152150 - -
6 Sobic.003G096750 - -
7 Sobic.009G102550 - -
8 Sobic.004G107550 - -
9 Sobic.006G193801 - -
10 Sobic.002G312550 - -
11 Sobic.008G040501 - -
12 Sobic.001G314350 - -
13 Sobic.009G143750 - -
14 Sobic.002G138400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
15 Sobic.003G192500 - -
16 Sobic.004G255400 KH domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G163500 - -
18 Sobic.010G214150 - -
19 Sobic.001G487900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@calcium-binding protein, putative, expressed K08272: CAB39, calcium binding protein 39
20 Sobic.004G032200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K02201: pantetheine-phosphate adenylyltransferase


Gene co-expression network
sample Sobic004G103450 Sobic004G103450 Sobic001G291701 Sobic001G291701 Sobic004G103450--Sobic001G291701 Sobic008G040201 Sobic008G040201 Sobic004G103450--Sobic008G040201 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic004G103450--Sobic004G073232 Sobic009G217450 Sobic009G217450 Sobic004G103450--Sobic009G217450 Sobic001G152150 Sobic001G152150 Sobic004G103450--Sobic001G152150 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic004G103450--Sobic003G096750 Sobic009G102550 Sobic009G102550 Sobic004G103450--Sobic009G102550 Sobic004G107550 Sobic004G107550 Sobic004G103450--Sobic004G107550 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic004G103450--Sobic006G193801 Sobic001G291701--Sobic008G040201 Sobic001G291701--Sobic004G103450 Sobic001G291701--Sobic001G152150 Sobic001G291701--Sobic004G073232 Sobic001G291701--Sobic009G217450 Sobic001G291701--Sobic006G193801 Sobic001G291701--Sobic003G096750 Sobic001G291701--Sobic009G102550 Sobic004G347000 Sobic004G347000 Sobic001G291701--Sobic004G347000 Sobic008G040201--Sobic001G291701 Sobic008G040201--Sobic004G103450 Sobic008G040201--Sobic001G152150 Sobic008G040201--Sobic006G193801 Sobic008G040201--Sobic009G217450 Sobic008G040201--Sobic004G073232 Sobic008G040201--Sobic009G102550 Sobic008G040201--Sobic003G096750 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic008G040201--Sobic006G210266 Sobic004G073232--Sobic004G103450 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic004G073232--Sobic001G314350 Sobic004G073232--Sobic009G102550 Sobic004G073232--Sobic001G152150 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic004G073232--Sobic003G192500 Sobic004G073232--Sobic001G291701 Sobic004G073232--Sobic008G040201 Sobic004G301250 Sobic004G301250 Sobic004G073232--Sobic004G301250 Sobic004G073232--Sobic009G217450 Sobic009G217450--Sobic004G103450 Sobic009G217450--Sobic008G040201 Sobic009G217450--Sobic001G291701 Sobic009G217450--Sobic001G152150 Sobic009G217450--Sobic009G102550 Sobic009G217450--Sobic004G073232 Sobic009G217450--Sobic004G301250 Sobic009G217450--Sobic006G193801 Sobic009G217450--Sobic001G314350 Sobic001G152150--Sobic009G102550 Sobic001G152150--Sobic008G040201 Sobic001G152150--Sobic004G073232 Sobic001G152150--Sobic001G291701 Sobic001G152150--Sobic004G103450 Sobic001G152150--Sobic009G217450 Sobic001G152150--Sobic006G210266 Sobic001G152150--Sobic001G314350 Sobic002G104450 Sobic002G104450 Sobic001G152150--Sobic002G104450 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic003G096750--Sobic002G312550 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic003G096750--Sobic010G214150 Sobic003G096750--Sobic004G103450 Sobic003G096750--Sobic001G291701 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic003G096750--Sobic008G040501 Sobic003G096750--Sobic008G040201 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic003G096750--Sobic001G502801 Sobic003G096750--Sobic004G073232 Sobic003G096750--Sobic001G314350 Sobic009G102550--Sobic001G152150 Sobic009G102550--Sobic004G073232 Sobic009G102550--Sobic004G301250 Sobic009G102550--Sobic008G040201 Sobic009G102550--Sobic009G217450 Sobic009G102550--Sobic004G103450 Sobic009G102550--Sobic001G314350 Sobic009G102550--Sobic001G291701 Sobic003G123900 Sobic003G123900 Sobic009G102550--Sobic003G123900 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic004G107550--Sobic001G487900 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic004G107550--Sobic003G064901 Sobic004G107550--Sobic004G103450 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic004G107550--Sobic009G143750 Sobic002G138400 Sobic002G138400 Sobic004G107550--Sobic002G138400 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic004G107550--Sobic009G102250 Sobic004G007133 Sobic004G007133 Sobic004G107550--Sobic004G007133 Sobic004G107550--Sobic001G291701 Sobic005G118900 Sobic005G118900 Sobic004G107550--Sobic005G118900 Sobic002G005900 Sobic002G005900 Sobic006G193801--Sobic002G005900 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic006G193801--Sobic009G035000 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic006G193801--Sobic001G163500 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic006G193801--Sobic003G282400 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic006G193801--Sobic010G002600 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic006G193801--Sobic008G041500 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic006G193801--Sobic003G129700 Sobic006G193801--Sobic008G040201 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic006G193801--Sobic002G062400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.