Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G143750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R2Q1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G487900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@calcium-binding protein, putative, expressed K08272: CAB39, calcium binding protein 39
2 Sobic.001G502801 - -
3 Sobic.007G183200 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K18486: heart-and neural crest derivatives-expressed protein 2
4 Sobic.003G172600 - -
5 Sobic.002G358450 - -
6 Sobic.006G124800 - -
7 Sobic.007G207100 chloroplast 30S ribosomal protein S3, putative, expressed K02982: RP-S3, small subunit ribosomal protein S3
8 Sobic.006G016950 - -
9 Sobic.007G126150 - -
10 Sobic.007G145801 - K02712: photosystem II PsbK protein
11 Sobic.003G172300 photosystem II P680 chlorophyll A apoprotein, putative, expressed K02704: photosystem II CP47 chlorophyll apoprotein
12 Sobic.003G117850 - -
13 Sobic.005G104900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
14 Sobic.002G138400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
15 Sobic.003G161900 - -
16 Sobic.004G210400 expressed protein -
17 Sobic.010G201332 - -
18 Sobic.001G530201 - -
19 Sobic.001G075500 - -
20 Sobic.001G182700 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic009G143750--Sobic001G487900 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic009G143750--Sobic001G502801 Sobic007G183200 Sobic007G183200 Sobic009G143750--Sobic007G183200 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic009G143750--Sobic003G172600 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic009G143750--Sobic002G358450 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic009G143750--Sobic006G124800 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic009G143750--Sobic007G207100 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic009G143750--Sobic006G016950 Sobic007G126150 Sobic007G126150 Sobic009G143750--Sobic007G126150 Sobic001G487900--Sobic009G143750 Sobic001G075500 Sobic001G075500 Sobic001G487900--Sobic001G075500 Sobic001G487900--Sobic006G124800 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic001G487900--Sobic004G210400 Sobic001G487900--Sobic003G172600 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic001G487900--Sobic003G169100 SobicK032300 SobicK032300 Sobic001G487900--SobicK032300 Sobic001G487900--Sobic007G207100 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic001G487900--Sobic010G139200 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic001G502801--Sobic001G300301 Sobic001G502801--Sobic009G143750 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic001G502801--Sobic008G040501 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic001G502801--Sobic005G045250 Sobic001G502801--Sobic006G016950 Sobic001G502801--Sobic007G183200 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G502801--Sobic003G161900 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic001G502801--Sobic010G214150 Sobic001G502801--Sobic002G358450 Sobic007G183200--Sobic002G358450 Sobic010G201332 Sobic010G201332 Sobic007G183200--Sobic010G201332 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic007G183200--Sobic001G261444 Sobic007G183200--Sobic003G161900 Sobic005G065800 Sobic005G065800 Sobic007G183200--Sobic005G065800 SobicK032200 SobicK032200 Sobic007G183200--SobicK032200 Sobic001G475950 Sobic001G475950 Sobic007G183200--Sobic001G475950 Sobic007G183200--Sobic009G143750 Sobic001G383350 Sobic001G383350 Sobic007G183200--Sobic001G383350 Sobic001G230050 Sobic001G230050 Sobic003G172600--Sobic001G230050 Sobic003G172600--Sobic006G124800 Sobic003G169200 Sobic003G169200 Sobic003G172600--Sobic003G169200 Sobic003G172600--SobicK032300 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic003G172600--Sobic003G173116 Sobic005G139900 Sobic005G139900 Sobic003G172600--Sobic005G139900 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic003G172600--Sobic003G117850 Sobic010G206600 Sobic010G206600 Sobic003G172600--Sobic010G206600 Sobic001G530201 Sobic001G530201 Sobic003G172600--Sobic001G530201 Sobic002G358450--Sobic010G201332 Sobic002G358450--Sobic001G475950 Sobic002G358450--Sobic007G183200 Sobic002G358450--SobicK032200 Sobic002G358450--Sobic005G065800 Sobic004G126050 Sobic004G126050 Sobic002G358450--Sobic004G126050 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic002G358450--Sobic003G056200 Sobic002G358450--Sobic001G261444 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic002G358450--Sobic002G401533 Sobic006G124800--Sobic003G172600 Sobic006G124800--SobicK032300 Sobic006G124800--Sobic001G230050 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic006G124800--Sobic007G145801 Sobic006G183100 Sobic006G183100 Sobic006G124800--Sobic006G183100 Sobic009G123100 Sobic009G123100 Sobic006G124800--Sobic009G123100 Sobic006G124800--Sobic010G206600 Sobic006G124700 Sobic006G124700 Sobic006G124800--Sobic006G124700 Sobic006G124800--Sobic003G169200 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic007G207100--Sobic002G150200 Sobic007G207100--Sobic004G210400 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic007G207100--Sobic003G130200 Sobic007G207100--Sobic003G117850 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic007G207100--Sobic002G148166 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic007G207100--Sobic005G002050 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic007G207100--Sobic002G270733 Sobic007G207100--Sobic003G172600 Sobic007G207100--Sobic001G487900 Sobic006G016950--Sobic002G358450 Sobic006G016950--Sobic001G502801 Sobic007G108600 Sobic007G108600 Sobic006G016950--Sobic007G108600 Sobic006G016950--Sobic007G183200 Sobic001G352633 Sobic001G352633 Sobic006G016950--Sobic001G352633 Sobic006G205300 Sobic006G205300 Sobic006G016950--Sobic006G205300 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic006G016950--Sobic001G182700 Sobic006G016950--Sobic009G143750 Sobic006G016950--Sobic002G401533 Sobic007G126150--Sobic009G143750 Sobic007G126150--Sobic007G108600 Sobic007G126150--Sobic007G183200 Sobic007G126150--Sobic007G207100 Sobic009G092300 Sobic009G092300 Sobic007G126150--Sobic009G092300 Sobic007G126150--Sobic001G487900 Sobic007G126150--Sobic006G016950 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic007G126150--Sobic006G097600 Sobic003G172300 Sobic003G172300 Sobic007G126150--Sobic003G172300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.