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Transcriptome id Sobic.002G312550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6F1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G214150 - -
2 Sobic.005G123300 rhamnogalacturonate lyase, putative, expressed K18195: RGL4, rhamnogalacturonan endolyase
3 Sobic.001G163500 - -
4 Sobic.003G096750 - -
5 Sobic.004G252300 CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G158150 - -
7 Sobic.009G148400 - -
8 Sobic.003G013300 expressed protein -
9 Sobic.001G314350 - -
10 Sobic.003G129700 - -
11 Sobic.004G249950 - -
12 Sobic.005G065800 - -
13 Sobic.008G040501 - -
14 Sobic.003G116200 expressed protein -
15 Sobic.006G210266 - -
16 Sobic.002G178900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K08506: syntaxin of plants SYP7
17 Sobic.001G502801 - -
18 Sobic.010G246800 - -
19 Sobic.007G042700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20528920)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
20 Sobic.006G243300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic002G312550--Sobic010G214150 Sobic005G123300 Sobic005G123300 Sobic002G312550--Sobic005G123300 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic002G312550--Sobic001G163500 Sobic003G096750 Sobic003G096750 Sobic002G312550--Sobic003G096750 Sobic004G252300 Sobic004G252300 Sobic002G312550--Sobic004G252300 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic002G312550--Sobic009G158150 Sobic009G148400 Sobic009G148400 Sobic002G312550--Sobic009G148400 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic002G312550--Sobic003G013300 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic002G312550--Sobic001G314350 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic010G214150--Sobic008G040501 Sobic010G214150--Sobic002G312550 Sobic001G300301 Sobic001G300301 Sobic010G214150--Sobic001G300301 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic010G214150--Sobic001G502801 Sobic010G214150--Sobic004G252300 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic010G214150--Sobic005G045250 Sobic010G214150--Sobic005G123300 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic010G214150--Sobic009G077000 Sobic010G214150--Sobic003G096750 Sobic005G123300--Sobic002G312550 Sobic005G123300--Sobic004G252300 Sobic005G123300--Sobic010G214150 Sobic005G123300--Sobic009G158150 Sobic005G123300--Sobic003G013300 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic005G123300--Sobic002G178900 Sobic005G123300--Sobic001G163500 Sobic004G249950 Sobic004G249950 Sobic005G123300--Sobic004G249950 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic005G123300--Sobic001G516400 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic001G163500--Sobic003G129700 Sobic001G163500--Sobic009G158150 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic001G163500--Sobic002G062400 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic001G163500--Sobic003G282400 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic001G163500--Sobic007G045750 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic001G163500--Sobic007G179100 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic001G163500--Sobic008G041500 Sobic001G163500--Sobic002G312550 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic001G163500--Sobic006G193801 Sobic003G096750--Sobic002G312550 Sobic003G096750--Sobic010G214150 Sobic004G103450 Sobic004G103450 Sobic003G096750--Sobic004G103450 Sobic001G291701 Sobic001G291701 Sobic003G096750--Sobic001G291701 Sobic003G096750--Sobic008G040501 Sobic008G040201 Sobic008G040201 Sobic003G096750--Sobic008G040201 Sobic003G096750--Sobic001G502801 Sobic004G073232 Sobic004G073232 Sobic003G096750--Sobic004G073232 Sobic003G096750--Sobic001G314350 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic004G252300--Sobic001G497400 Sobic004G252300--Sobic009G077000 Sobic006G053550 Sobic006G053550 Sobic004G252300--Sobic006G053550 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic004G252300--Sobic002G214000 Sobic004G310350 Sobic004G310350 Sobic004G252300--Sobic004G310350 Sobic009G215100 Sobic009G215100 Sobic004G252300--Sobic009G215100 SobicK031900 SobicK031900 Sobic004G252300--SobicK031900 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic004G252300--Sobic007G042700 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic004G252300--Sobic010G219200 Sobic009G158150--Sobic003G129700 Sobic009G158150--Sobic007G045750 Sobic009G158150--Sobic001G163500 Sobic009G158150--Sobic002G062400 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic009G158150--Sobic010G166201 Sobic009G158150--Sobic001G516400 Sobic009G158150--Sobic004G249950 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic009G158150--Sobic005G168900 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic009G158150--Sobic001G050650 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic009G148400--Sobic004G206000 Sobic009G148400--Sobic004G249950 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic009G148400--Sobic010G098800 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic009G148400--Sobic001G081450 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic009G148400--Sobic004G223700 SobicK032600 SobicK032600 Sobic009G148400--SobicK032600 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic009G148400--Sobic007G116150 Sobic007G134300 Sobic007G134300 Sobic009G148400--Sobic007G134300 SobicK032400 SobicK032400 Sobic009G148400--SobicK032400 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic003G013300--Sobic005G192350 Sobic003G013300--Sobic004G252300 Sobic003G013300--Sobic002G312550 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic003G013300--Sobic009G077901 Sobic003G013300--Sobic005G123300 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic003G013300--Sobic003G116200 Sobic003G013300--Sobic010G214150 Sobic002G199300 Sobic002G199300 Sobic003G013300--Sobic002G199300 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic003G013300--Sobic010G246800 Sobic001G314350--Sobic003G116200 Sobic001G314350--Sobic004G073232 Sobic006G210266 Sobic006G210266 Sobic001G314350--Sobic006G210266 Sobic001G314350--Sobic010G246800 Sobic001G314350--Sobic002G312550 Sobic002G104450 Sobic002G104450 Sobic001G314350--Sobic002G104450 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic001G314350--Sobic010G120900 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic001G314350--Sobic006G243300 Sobic001G152150 Sobic001G152150 Sobic001G314350--Sobic001G152150
Octagon: transcription factors


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