Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G494200.1
Synonym Sb01g046200
Functional annotation PPR repeat containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QQC8
Pfam PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF648
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G01110 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g06910.1 : PPR repeat containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000803
Brachypodium PNT78127
Barley HORVU4Hr1G074200.7 , HORVU4Hr1G074200.6 , HORVU4Hr1G074200.5 , HORVU4Hr1G074200.4 , HORVU4Hr1G074200.3 , HORVU4Hr1G074200.2 , HORVU4Hr1G074200.1 , HORVU4Hr1G074200.9 , HORVU4Hr1G074200.8 , HORVU4Hr1G074200.19 , HORVU4Hr1G074200.18 , HORVU4Hr1G074200.17 , HORVU4Hr1G074200.16 , HORVU4Hr1G074200.15 , HORVU4Hr1G074200.14 , HORVU4Hr1G074200.13 , HORVU4Hr1G074200.12 , HORVU4Hr1G074200.11 , HORVU4Hr1G074200.10 , HORVU4Hr1G074200.24 , HORVU4Hr1G074200.25 , HORVU4Hr1G074200.22 , HORVU4Hr1G074200.23 , HORVU4Hr1G074200.20 , HORVU4Hr1G074200.21
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G102250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G494200 Sobic001G494200 Sobic007G137501 Sobic007G137501 Sobic001G494200--Sobic007G137501 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic001G494200--Sobic008G108300 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic001G494200--Sobic003G393600 Sobic001G075500 Sobic001G075500 Sobic001G494200--Sobic001G075500 Sobic001G245650 Sobic001G245650 Sobic001G494200--Sobic001G245650 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic001G494200--Sobic003G064901 Sobic010G254000 Sobic010G254000 Sobic001G494200--Sobic010G254000 Sobic005G002050 Sobic005G002050 Sobic001G494200--Sobic005G002050 Sobic001G487900 Sobic001G487900 Sobic001G494200--Sobic001G487900 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic007G137501--Sobic007G149200 Sobic005G096450 Sobic005G096450 Sobic007G137501--Sobic005G096450 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic007G137501--Sobic003G218950 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic007G137501--Sobic003G369533 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic007G137501--Sobic003G168200 Sobic005G116400 Sobic005G116400 Sobic007G137501--Sobic005G116400 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic007G137501--Sobic003G352000 Sobic002G278100 Sobic002G278100 Sobic007G137501--Sobic002G278100 Sobic003G169000 Sobic003G169000 Sobic007G137501--Sobic003G169000 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic008G108300--Sobic002G165200 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic008G108300--Sobic001G182800 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic008G108300--Sobic006G192600 Sobic008G108300--Sobic003G393600 Sobic010G185250 Sobic010G185250 Sobic008G108300--Sobic010G185250 Sobic008G108300--Sobic010G254000 Sobic008G108300--Sobic003G218950 Sobic008G108300--Sobic003G369533 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic008G108300--Sobic001G182700 Sobic003G393600--Sobic010G254000 Sobic003G393600--Sobic008G108300 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic003G393600--Sobic003G290050 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic003G393600--Sobic002G044500 Sobic002G149966 Sobic002G149966 Sobic003G393600--Sobic002G149966 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic003G393600--Sobic001G266000 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic003G393600--Sobic003G168500 Sobic002G222000 Sobic002G222000 Sobic003G393600--Sobic002G222000 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic003G393600--Sobic003G172900 Sobic006G124800 Sobic006G124800 Sobic001G075500--Sobic006G124800 Sobic001G075500--Sobic001G487900 SobicK032300 SobicK032300 Sobic001G075500--SobicK032300 Sobic004G210400 Sobic004G210400 Sobic001G075500--Sobic004G210400 Sobic010G139200 Sobic010G139200 Sobic001G075500--Sobic010G139200 Sobic001G075500--Sobic001G182700 Sobic002G150200 Sobic002G150200 Sobic001G075500--Sobic002G150200 Sobic003G130200 Sobic003G130200 Sobic001G075500--Sobic003G130200 Sobic004G087050 Sobic004G087050 Sobic001G075500--Sobic004G087050 Sobic009G136950 Sobic009G136950 Sobic001G245650--Sobic009G136950 Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic001G245650--Sobic004G320900 Sobic001G245650--Sobic001G494200 Sobic001G245650--Sobic003G393600 Sobic001G245650--Sobic010G254000 Sobic001G489550 Sobic001G489550 Sobic001G245650--Sobic001G489550 Sobic001G245650--Sobic005G002050 Sobic001G245650--Sobic008G108300 Sobic001G245650--Sobic001G075500 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic003G064901--Sobic009G102250 Sobic002G138400 Sobic002G138400 Sobic003G064901--Sobic002G138400 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic003G064901--Sobic004G091900 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic003G064901--Sobic001G270800 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic003G064901--Sobic001G167000 Sobic003G064901--Sobic001G182700 Sobic004G032200 Sobic004G032200 Sobic003G064901--Sobic004G032200 Sobic003G064901--Sobic007G137501 Sobic003G064901--Sobic001G182800 Sobic010G254000--Sobic002G222000 Sobic002G148166 Sobic002G148166 Sobic010G254000--Sobic002G148166 Sobic010G254000--Sobic005G002050 Sobic010G254000--Sobic003G172900 Sobic003G169300 Sobic003G169300 Sobic010G254000--Sobic003G169300 Sobic005G110493 Sobic005G110493 Sobic010G254000--Sobic005G110493 Sobic003G173266 Sobic003G173266 Sobic010G254000--Sobic003G173266 Sobic010G254000--Sobic003G130200 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic010G254000--Sobic004G251400 Sobic005G002050--Sobic003G130200 Sobic005G002050--Sobic002G150200 Sobic005G002050--Sobic002G148166 Sobic005G002050--Sobic010G254000 Sobic005G002050--Sobic004G210400 Sobic005G002050--Sobic002G222000 Sobic003G168425 Sobic003G168425 Sobic005G002050--Sobic003G168425 Sobic005G002050--Sobic005G110493 Sobic003G166400 Sobic003G166400 Sobic005G002050--Sobic003G166400 Sobic009G143750 Sobic009G143750 Sobic001G487900--Sobic009G143750 Sobic001G487900--Sobic001G075500 Sobic001G487900--Sobic006G124800 Sobic001G487900--Sobic004G210400 Sobic003G172600 Sobic003G172600 Sobic001G487900--Sobic003G172600 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic001G487900--Sobic003G169100 Sobic001G487900--SobicK032300 Sobic007G207100 Sobic007G207100 Sobic001G487900--Sobic007G207100 Sobic001G487900--Sobic010G139200
Octagon: transcription factors


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