Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G253900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PB70
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G089266 - -
2 Sobic.005G218300 - -
3 Sobic.010G054700 - -
4 Sobic.004G173300 expressed protein -
5 Sobic.002G377501 - -
6 Sobic.002G307500 MATH domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G131500 - -
8 Sobic.004G347000 - -
9 Sobic.004G093800 integral membrane protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G076300 - -
11 Sobic.007G001700 ATOFP18/OFP18, putative, expressed -
12 Sobic.001G498033 - -
13 Sobic.002G268600 PCF-like (ClassI) Subclade 7 TCP(PubMedID : 21444336)@"TCP is actually a family of transcription factors named after: teosinte branched 1 (tb1, Zea mays (Maize)), cycloidea (cyc) (Antirrhinum majus) (Garden snapdragon) and PCF in rice (Oryza sativa)."(PubMedID : 27917941)@"plant-specific TCP family of transcription factors, in particular, have been shown to play key roles in evolution of plant form and structure (putative)"(PubMedID : 28383054)@TCP family transcription factor, putative, expressed -
14 Sobic.006G045601 - -
15 Sobic.009G136950 - -
16 Sobic.001G213832 - -
17 Sobic.009G204700 light repressible receptor protein kinase, putative, expressed -
18 Sobic.010G195000 guanine nucleotide exchange family protein, putative, expressed K18442: ARFGEF, brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein
19 Sobic.004G163350 - -
20 Sobic.001G182400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G253900 Sobic009G253900 Sobic006G089266 Sobic006G089266 Sobic009G253900--Sobic006G089266 Sobic005G218300 Sobic005G218300 Sobic009G253900--Sobic005G218300 Sobic010G054700 Sobic010G054700 Sobic009G253900--Sobic010G054700 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic009G253900--Sobic004G173300 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic009G253900--Sobic002G377501 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic009G253900--Sobic002G307500 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic009G253900--Sobic005G131500 Sobic004G347000 Sobic004G347000 Sobic009G253900--Sobic004G347000 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic009G253900--Sobic004G093800 Sobic006G089266--Sobic009G253900 Sobic006G089266--Sobic005G131500 Sobic006G089266--Sobic004G173300 Sobic006G089266--Sobic004G093800 Sobic007G001700 Sobic007G001700 Sobic006G089266--Sobic007G001700 Sobic006G089266--Sobic005G218300 Sobic006G089266--Sobic002G377501 Sobic009G216200 Sobic009G216200 Sobic006G089266--Sobic009G216200 Sobic006G089266--Sobic002G307500 Sobic005G218300--Sobic009G253900 Sobic005G218300--Sobic010G054700 Sobic009G136950 Sobic009G136950 Sobic005G218300--Sobic009G136950 Sobic005G218300--Sobic004G347000 Sobic002G268600 Sobic002G268600 Sobic005G218300--Sobic002G268600 Sobic001G213832 Sobic001G213832 Sobic005G218300--Sobic001G213832 Sobic005G218300--Sobic002G307500 Sobic001G245650 Sobic001G245650 Sobic005G218300--Sobic001G245650 Sobic005G218300--Sobic006G089266 Sobic010G054700--Sobic009G136950 Sobic010G054700--Sobic001G213832 Sobic004G111200 Sobic004G111200 Sobic010G054700--Sobic004G111200 Sobic010G054700--Sobic005G218300 Sobic003G018150 Sobic003G018150 Sobic010G054700--Sobic003G018150 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic010G054700--Sobic006G045601 Sobic010G054700--Sobic004G347000 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic010G054700--Sobic006G235801 Sobic010G195000 Sobic010G195000 Sobic010G054700--Sobic010G195000 Sobic004G173300--Sobic004G093800 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic004G173300--Sobic010G002600 Sobic004G173300--Sobic005G131500 Sobic004G173300--Sobic002G307500 Sobic004G173300--Sobic006G089266 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic004G173300--Sobic006G192900 Sobic004G181400 Sobic004G181400 Sobic004G173300--Sobic004G181400 Sobic004G173300--Sobic009G253900 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic004G173300--Sobic008G142500 Sobic001G498033 Sobic001G498033 Sobic002G377501--Sobic001G498033 Sobic002G076300 Sobic002G076300 Sobic002G377501--Sobic002G076300 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic002G377501--Sobic004G358150 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic002G377501--Sobic003G443601 Sobic008G141700 Sobic008G141700 Sobic002G377501--Sobic008G141700 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic002G377501--Sobic003G069601 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic002G377501--Sobic002G086700 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic002G377501--Sobic002G244901 Sobic002G377501--Sobic009G216200 Sobic002G307500--Sobic004G093800 Sobic002G307500--Sobic006G192900 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic002G307500--Sobic001G489400 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic002G307500--Sobic010G229025 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic002G307500--Sobic009G199401 Sobic002G307500--Sobic006G235801 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic002G307500--Sobic006G221500 Sobic002G307500--Sobic010G002600 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic002G307500--Sobic006G136300 Sobic005G131500--Sobic006G089266 Sobic006G085601 Sobic006G085601 Sobic005G131500--Sobic006G085601 Sobic005G131500--Sobic004G093800 Sobic005G131500--Sobic004G173300 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic005G131500--Sobic003G068100 Sobic005G131500--Sobic009G216200 Sobic005G131500--Sobic008G142500 Sobic005G131500--Sobic002G307500 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic005G131500--Sobic004G267400 Sobic004G347000--Sobic004G111200 Sobic004G347000--Sobic010G054700 Sobic001G291701 Sobic001G291701 Sobic004G347000--Sobic001G291701 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic004G347000--Sobic009G102250 Sobic004G347000--Sobic005G218300 Sobic008G040201 Sobic008G040201 Sobic004G347000--Sobic008G040201 Sobic004G347000--Sobic002G076300 Sobic004G347000--Sobic001G213832 Sobic004G107550 Sobic004G107550 Sobic004G347000--Sobic004G107550 Sobic004G093800--Sobic002G307500 Sobic004G093800--Sobic001G489400 Sobic004G093800--Sobic009G199401 Sobic004G093800--Sobic004G173300 Sobic004G093800--Sobic010G002600 Sobic004G093800--Sobic008G142500 Sobic004G093800--Sobic010G229025 Sobic004G093800--Sobic006G192900 Sobic004G093800--Sobic005G131500
Octagon: transcription factors


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