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Transcriptome id Sobic.004G163350.1
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UniProt A0A1Z5RMY8
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G018150 - -
2 Sobic.009G223400 hypro1, putative, expressed -
3 Sobic.010G054700 - -
4 Sobic.006G235801 - -
5 Sobic.002G268600 PCF-like (ClassI) Subclade 7 TCP(PubMedID : 21444336)@"TCP is actually a family of transcription factors named after: teosinte branched 1 (tb1, Zea mays (Maize)), cycloidea (cyc) (Antirrhinum majus) (Garden snapdragon) and PCF in rice (Oryza sativa)."(PubMedID : 27917941)@"plant-specific TCP family of transcription factors, in particular, have been shown to play key roles in evolution of plant form and structure (putative)"(PubMedID : 28383054)@TCP family transcription factor, putative, expressed -
6 Sobic.009G136950 - -
7 Sobic.001G213832 - -
8 Sobic.009G235400 - -
9 Sobic.006G045601 - -
10 Sobic.001G278900 - -
11 Sobic.005G218300 - -
12 Sobic.010G100600 expressed protein -
13 Sobic.001G100300 - -
14 Sobic.010G195000 guanine nucleotide exchange family protein, putative, expressed K18442: ARFGEF, brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein
15 Sobic.004G150300 - -
16 Sobic.009G204700 light repressible receptor protein kinase, putative, expressed -
17 Sobic.002G076300 - -
18 Sobic.002G307500 MATH domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G014600 - -
20 Sobic.006G192900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1


Gene co-expression network
sample Sobic004G163350 Sobic004G163350 Sobic003G018150 Sobic003G018150 Sobic004G163350--Sobic003G018150 Sobic009G223400 Sobic009G223400 Sobic004G163350--Sobic009G223400 Sobic010G054700 Sobic010G054700 Sobic004G163350--Sobic010G054700 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic004G163350--Sobic006G235801 Sobic002G268600 Sobic002G268600 Sobic004G163350--Sobic002G268600 Sobic009G136950 Sobic009G136950 Sobic004G163350--Sobic009G136950 Sobic001G213832 Sobic001G213832 Sobic004G163350--Sobic001G213832 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic004G163350--Sobic009G235400 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic004G163350--Sobic006G045601 Sobic003G018150--Sobic006G235801 Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic003G018150--Sobic010G100600 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic003G018150--Sobic001G278900 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic003G018150--Sobic001G471050 Sobic003G018150--Sobic010G054700 Sobic004G111200 Sobic004G111200 Sobic003G018150--Sobic004G111200 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic003G018150--Sobic006G097600 Sobic004G150300 Sobic004G150300 Sobic003G018150--Sobic004G150300 Sobic002G204050 Sobic002G204050 Sobic003G018150--Sobic002G204050 Sobic009G223400--Sobic004G163350 Sobic004G169401 Sobic004G169401 Sobic009G223400--Sobic004G169401 Sobic009G223400--Sobic003G018150 Sobic009G223400--Sobic006G235801 Sobic009G223400--Sobic010G100600 Sobic007G167600 Sobic007G167600 Sobic009G223400--Sobic007G167600 Sobic010G036700 Sobic010G036700 Sobic009G223400--Sobic010G036700 Sobic002G172800 Sobic002G172800 Sobic009G223400--Sobic002G172800 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic009G223400--Sobic001G100300 Sobic010G054700--Sobic009G136950 Sobic010G054700--Sobic001G213832 Sobic010G054700--Sobic004G111200 Sobic005G218300 Sobic005G218300 Sobic010G054700--Sobic005G218300 Sobic010G054700--Sobic003G018150 Sobic010G054700--Sobic006G045601 Sobic004G347000 Sobic004G347000 Sobic010G054700--Sobic004G347000 Sobic010G054700--Sobic006G235801 Sobic010G195000 Sobic010G195000 Sobic010G054700--Sobic010G195000 Sobic006G235801--Sobic010G100600 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic006G235801--Sobic001G014600 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic006G235801--Sobic007G042700 Sobic006G235801--Sobic003G018150 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic006G235801--Sobic009G173700 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic006G235801--Sobic006G221500 Sobic006G235801--Sobic001G100300 Sobic006G235801--Sobic001G278900 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic006G235801--Sobic010G089350 Sobic001G134150 Sobic001G134150 Sobic002G268600--Sobic001G134150 Sobic002G268600--Sobic005G218300 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic002G268600--Sobic006G192900 Sobic010G241400 Sobic010G241400 Sobic002G268600--Sobic010G241400 Sobic002G268600--Sobic010G054700 Sobic002G268600--Sobic003G018150 Sobic002G268600--Sobic009G136950 Sobic002G268600--Sobic004G163350 Sobic002G268600--Sobic001G213832 Sobic009G136950--Sobic001G213832 Sobic009G136950--Sobic010G054700 Sobic001G245650 Sobic001G245650 Sobic009G136950--Sobic001G245650 Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic009G136950--Sobic004G320900 Sobic009G136950--Sobic005G218300 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic009G136950--Sobic007G141900 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic009G136950--Sobic002G012100 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic009G136950--Sobic010G196466 Sobic001G494200 Sobic001G494200 Sobic009G136950--Sobic001G494200 Sobic001G213832--Sobic009G136950 Sobic001G213832--Sobic010G054700 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic001G213832--Sobic009G102250 Sobic001G213832--Sobic002G012100 Sobic001G213832--Sobic004G111200 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic001G213832--Sobic003G023450 Sobic001G213832--Sobic001G494200 Sobic001G213832--Sobic010G196466 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic001G213832--Sobic004G242800 Sobic009G235400--Sobic006G045601 Sobic009G235400--Sobic001G100300 Sobic003G174500 Sobic003G174500 Sobic009G235400--Sobic003G174500 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic009G235400--Sobic001G261452 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic009G235400--Sobic009G186300 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic009G235400--Sobic005G118800 Sobic004G093700 Sobic004G093700 Sobic009G235400--Sobic004G093700 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic009G235400--Sobic010G129100 Sobic009G235400--Sobic010G195000 Sobic006G045601--Sobic009G235400 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic006G045601--Sobic002G374000 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic006G045601--Sobic003G069601 Sobic006G045601--Sobic001G100300 Sobic006G045601--Sobic004G093700 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic006G045601--Sobic007G183600 Sobic006G045601--Sobic006G235801 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic006G045601--Sobic004G072201 Sobic006G045601--Sobic010G054700
Octagon: transcription factors


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