Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G100600.1
Synonym Sb10g008750
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YIA6
Pfam -
Panther DB PTHR36001 PTHR36001:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G28370 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g13580.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042649
Brachypodium PNT76129 , KQK18766 , KQK18764 , KQK04386
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G235801 - -
2 Sobic.010G235100 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G250750 - -
4 Sobic.004G223800 membrane-associated salt-inducible protein like, putative, expressed -
5 Sobic.003G109150 - -
6 Sobic.001G100300 - -
7 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
8 Sobic.004G072300 - -
9 Sobic.002G000350 - -
10 Sobic.003G018150 - -
11 Sobic.002G009000 - -
12 Sobic.004G160750 - -
13 Sobic.007G042700 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA treatment"(PubMedID : 20528920)@ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
14 Sobic.001G278900 - -
15 Sobic.005G118800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G471050 - -
17 Sobic.003G272000 expressed protein -
18 Sobic.009G074800 - -
19 Sobic.003G085533 - -
20 Sobic.003G219300 leaf senescence related protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G100600 Sobic010G100600 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic010G100600--Sobic006G235801 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic010G100600--Sobic010G235100 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic010G100600--Sobic001G250750 Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic010G100600--Sobic004G223800 Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic010G100600--Sobic003G109150 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic010G100600--Sobic001G100300 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic010G100600--Sobic008G132500 Sobic004G072300 Sobic004G072300 Sobic010G100600--Sobic004G072300 Sobic002G000350 Sobic002G000350 Sobic010G100600--Sobic002G000350 Sobic006G235801--Sobic010G100600 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic006G235801--Sobic001G014600 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic006G235801--Sobic007G042700 Sobic003G018150 Sobic003G018150 Sobic006G235801--Sobic003G018150 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic006G235801--Sobic009G173700 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic006G235801--Sobic006G221500 Sobic006G235801--Sobic001G100300 Sobic001G278900 Sobic001G278900 Sobic006G235801--Sobic001G278900 Sobic010G089350 Sobic010G089350 Sobic006G235801--Sobic010G089350 Sobic010G235100--Sobic001G250750 Sobic010G235100--Sobic008G132500 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic010G235100--Sobic003G232600 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic010G235100--Sobic002G009000 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic010G235100--Sobic002G067900 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic010G235100--Sobic005G118800 Sobic010G235100--Sobic004G072300 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic010G235100--Sobic002G074900 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic010G235100--Sobic005G090800 Sobic001G250750--Sobic010G235100 Sobic001G250750--Sobic002G009000 Sobic001G250750--Sobic008G132500 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic001G250750--Sobic007G182300 Sobic001G250750--Sobic003G109150 Sobic001G250750--Sobic003G232600 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic003G219300 Sobic001G250750--Sobic002G067900 Sobic001G250750--Sobic005G090800 Sobic004G223800--Sobic003G109150 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic004G223800--Sobic001G340100 Sobic004G223800--Sobic001G250750 Sobic001G400601 Sobic001G400601 Sobic004G223800--Sobic001G400601 Sobic004G223800--Sobic010G235100 Sobic004G223800--Sobic002G009000 Sobic004G223800--Sobic002G074900 Sobic004G223800--Sobic010G100600 Sobic004G223800--Sobic002G067900 Sobic003G109150--Sobic004G223800 Sobic003G109150--Sobic001G250750 Sobic003G109150--Sobic010G235100 Sobic003G109150--Sobic002G009000 Sobic003G109150--Sobic008G132500 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic003G109150--Sobic010G169950 Sobic003G109150--Sobic002G074900 Sobic003G109150--Sobic001G340100 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic003G109150--Sobic006G111000 Sobic001G100300--Sobic009G173700 Sobic001G100300--Sobic010G100600 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic001G100300--Sobic009G235400 Sobic001G100300--Sobic010G235100 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic001G100300--Sobic007G149500 Sobic001G100300--Sobic006G235801 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic001G100300--Sobic006G045601 Sobic001G100300--Sobic005G118800 Sobic006G121950 Sobic006G121950 Sobic001G100300--Sobic006G121950 Sobic008G132500--Sobic002G009000 Sobic008G132500--Sobic001G250750 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic008G132500--Sobic004G209100 Sobic008G132500--Sobic010G235100 Sobic008G132500--Sobic005G118800 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic008G132500--Sobic003G312900 Sobic008G132500--Sobic003G219300 Sobic008G132500--Sobic003G109150 Sobic008G132500--Sobic003G232600 Sobic003G085533 Sobic003G085533 Sobic004G072300--Sobic003G085533 Sobic004G072300--Sobic002G000350 Sobic010G219200 Sobic010G219200 Sobic004G072300--Sobic010G219200 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic004G072300--Sobic008G129500 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic004G072300--Sobic002G112500 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic004G072300--Sobic002G200400 Sobic002G134800 Sobic002G134800 Sobic004G072300--Sobic002G134800 Sobic004G183701 Sobic004G183701 Sobic004G072300--Sobic004G183701 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic004G072300--Sobic001G373850 Sobic002G000350--Sobic004G072300 Sobic002G000350--Sobic002G112500 Sobic002G000350--Sobic003G085533 Sobic002G000350--Sobic008G129500 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic002G000350--Sobic001G471050 Sobic002G000350--Sobic007G042700 Sobic001G497400 Sobic001G497400 Sobic002G000350--Sobic001G497400 Sobic002G000350--Sobic010G219200 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic002G000350--Sobic001G081450
Octagon: transcription factors


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