Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G093800.1
Synonym Sb04g007720
Functional annotation integral membrane protein, putative, expressed
UniProt C5XY39
Pfam PF04535
Panther DB PTHR11615 PTHR11615:SF143
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G54980 : Uncharacterised protein family (UPF0497)
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g12760.1 : integral membrane protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020186
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G039660.1 , HORVU6Hr1G039660.2 , HORVU6Hr1G039660.3
Wheat TraesCS6A02G185700 , TraesCS6B02G214600 , TraesCS6D02G172700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G093800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.006G089266 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic004G093800--Sobic002G307500 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic004G093800--Sobic001G489400 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic004G093800--Sobic009G199401 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic004G093800--Sobic004G173300 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic004G093800--Sobic010G002600 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic004G093800--Sobic008G142500 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic004G093800--Sobic010G229025 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic004G093800--Sobic006G192900 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic004G093800--Sobic005G131500 Sobic002G307500--Sobic004G093800 Sobic002G307500--Sobic006G192900 Sobic002G307500--Sobic001G489400 Sobic002G307500--Sobic010G229025 Sobic002G307500--Sobic009G199401 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic002G307500--Sobic006G235801 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic002G307500--Sobic006G221500 Sobic002G307500--Sobic010G002600 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic002G307500--Sobic006G136300 Sobic001G489400--Sobic009G199401 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic001G489400--Sobic003G162600 Sobic001G489400--Sobic004G093800 Sobic001G489400--Sobic010G229025 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic001G489400--Sobic002G421100 Sobic001G489400--Sobic002G307500 Sobic001G489400--Sobic006G221500 Sobic002G207601 Sobic002G207601 Sobic001G489400--Sobic002G207601 Sobic005G116700 Sobic005G116700 Sobic001G489400--Sobic005G116700 Sobic009G199401--Sobic002G421100 Sobic009G199401--Sobic001G489400 Sobic009G199401--Sobic010G229025 Sobic009G199401--Sobic003G162600 Sobic009G199401--Sobic006G221500 Sobic009G199401--Sobic004G093800 Sobic009G199401--Sobic008G142500 Sobic009G199401--Sobic005G116700 Sobic004G186950 Sobic004G186950 Sobic009G199401--Sobic004G186950 Sobic004G173300--Sobic004G093800 Sobic004G173300--Sobic010G002600 Sobic004G173300--Sobic005G131500 Sobic004G173300--Sobic002G307500 Sobic006G089266 Sobic006G089266 Sobic004G173300--Sobic006G089266 Sobic004G173300--Sobic006G192900 Sobic004G181400 Sobic004G181400 Sobic004G173300--Sobic004G181400 Sobic009G253900 Sobic009G253900 Sobic004G173300--Sobic009G253900 Sobic004G173300--Sobic008G142500 Sobic008G041500 Sobic008G041500 Sobic010G002600--Sobic008G041500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic010G002600--Sobic009G035000 Sobic006G193801 Sobic006G193801 Sobic010G002600--Sobic006G193801 Sobic010G002600--Sobic006G192900 Sobic003G282400 Sobic003G282400 Sobic010G002600--Sobic003G282400 Sobic010G002600--Sobic004G181400 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic010G002600--Sobic002G319900 Sobic003G185000 Sobic003G185000 Sobic010G002600--Sobic003G185000 Sobic001G163500 Sobic001G163500 Sobic010G002600--Sobic001G163500 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic008G142500--Sobic006G221500 Sobic010G229025--Sobic009G199401 Sobic010G229025--Sobic001G489400 Sobic010G229025--Sobic002G421100 Sobic010G229025--Sobic004G093800 Sobic001G183550 Sobic001G183550 Sobic010G229025--Sobic001G183550 Sobic010G229025--Sobic002G307500 Sobic010G229025--Sobic003G162600 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic010G229025--Sobic009G025750 Sobic010G229025--Sobic006G083050 Sobic010G241400 Sobic010G241400 Sobic006G192900--Sobic010G241400 Sobic006G192900--Sobic010G002600 Sobic006G192900--Sobic002G307500 Sobic006G192900--Sobic009G035000 Sobic006G009200 Sobic006G009200 Sobic006G192900--Sobic006G009200 Sobic006G192900--Sobic008G041500 Sobic006G192900--Sobic004G181400 Sobic006G192900--Sobic004G093800 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic006G192900--Sobic002G062400 Sobic005G131500--Sobic006G089266 Sobic006G085601 Sobic006G085601 Sobic005G131500--Sobic006G085601 Sobic005G131500--Sobic004G093800 Sobic005G131500--Sobic004G173300 Sobic005G131500--Sobic003G068100 Sobic009G216200 Sobic009G216200 Sobic005G131500--Sobic009G216200 Sobic005G131500--Sobic008G142500 Sobic005G131500--Sobic002G307500 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic005G131500--Sobic004G267400
Octagon: transcription factors


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