Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G116700.1
Synonym
Functional annotation receptor kinase, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RI48
Pfam PF08263 PF13855 PF00069
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF108
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0006468protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47570 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g29790.1 : receptor kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ89244 , KQJ89243 , PNT64091
Barley HORVU3Hr1G066650.5 , HORVU3Hr1G066650.6 , HORVU3Hr1G066650.17 , HORVU3Hr1G066650.14 , HORVU3Hr1G066650.13 , HORVU3Hr1G066650.10 , HORVU3Hr1G066650.11 , HORVU7Hr1G121370.4 , HORVU7Hr1G121370.1 , HORVU7Hr1G121370.3 , HORVU7Hr1G121370.2
Wheat TraesCS7D02G475400 , TraesCS6A02G384700 , TraesCS6B02G051700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.K032500 - K10908: POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial
18 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
19 Sobic.006G165200 amino acid permease family protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G119400 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G116700 Sobic005G116700 Sobic003G162600 Sobic003G162600 Sobic005G116700--Sobic003G162600 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic005G116700--Sobic005G116800 Sobic003G068150 Sobic003G068150 Sobic005G116700--Sobic003G068150 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic005G116700--Sobic005G187700 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic005G116700--Sobic006G083050 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic005G116700--Sobic009G199401 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic005G116700--Sobic001G527550 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic005G116700--Sobic001G489400 Sobic001G180950 Sobic001G180950 Sobic005G116700--Sobic001G180950 Sobic003G162600--Sobic001G489400 Sobic003G162600--Sobic009G199401 Sobic004G186950 Sobic004G186950 Sobic003G162600--Sobic004G186950 Sobic003G162600--Sobic005G116700 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic003G162600--Sobic006G221500 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic003G162600--Sobic001G150100 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic003G162600--Sobic002G421100 Sobic003G162600--Sobic005G187700 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic003G162600--Sobic001G014600 Sobic005G116800--Sobic006G083050 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic005G116800--Sobic005G041150 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic010G156300 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic005G116800--Sobic003G261766 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic005G116800--Sobic008G142500 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic006G099400 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G025750 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic005G116800--Sobic009G115800 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic005G116800--Sobic003G068100 Sobic004G074400 Sobic004G074400 Sobic003G068150--Sobic004G074400 Sobic003G068150--Sobic005G116700 Sobic001G279800 Sobic001G279800 Sobic003G068150--Sobic001G279800 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic003G068150--Sobic003G068200 Sobic004G279400 Sobic004G279400 Sobic003G068150--Sobic004G279400 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic003G068150--Sobic009G037500 Sobic003G068150--Sobic005G187700 Sobic005G150700 Sobic005G150700 Sobic003G068150--Sobic005G150700 Sobic010G055900 Sobic010G055900 Sobic003G068150--Sobic010G055900 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic005G187700--Sobic003G072000 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic005G187700--Sobic009G173700 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic005G187700--Sobic003G142500 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic005G187700--Sobic009G213150 Sobic003G341900 Sobic003G341900 Sobic005G187700--Sobic003G341900 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic005G187700--Sobic007G149500 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic005G187700--Sobic002G202350 Sobic005G187700--Sobic001G527550 Sobic005G187700--Sobic001G014600 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic009G115800 Sobic009G199401--Sobic002G421100 Sobic009G199401--Sobic001G489400 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic009G199401--Sobic010G229025 Sobic009G199401--Sobic003G162600 Sobic009G199401--Sobic006G221500 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic009G199401--Sobic004G093800 Sobic009G199401--Sobic008G142500 Sobic009G199401--Sobic005G116700 Sobic009G199401--Sobic004G186950 SobicK032500 SobicK032500 Sobic001G527550--SobicK032500 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic001G527550--Sobic004G334501 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic001G527550--Sobic007G079901 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic001G527550--Sobic001G050650 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic001G527550--Sobic002G018200 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic001G527550--Sobic002G022500 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic001G527550--Sobic002G094000 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic001G527550--Sobic005G024500 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic001G527550--Sobic002G073000 Sobic001G489400--Sobic009G199401 Sobic001G489400--Sobic003G162600 Sobic001G489400--Sobic004G093800 Sobic001G489400--Sobic010G229025 Sobic001G489400--Sobic002G421100 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic001G489400--Sobic002G307500 Sobic001G489400--Sobic006G221500 Sobic002G207601 Sobic002G207601 Sobic001G489400--Sobic002G207601 Sobic001G489400--Sobic005G116700 Sobic001G180950--Sobic002G022500 Sobic001G180950--SobicK032500 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic001G180950--Sobic010G166850 Sobic001G180950--Sobic001G527550 Sobic001G180950--Sobic009G025750 Sobic001G180950--Sobic010G156300 Sobic001G180950--Sobic007G179100 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic001G180950--Sobic009G258800 Sobic001G180950--Sobic001G050650
Octagon: transcription factors


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