Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G067900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q1P8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.003G067900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G534132 - -
2 Sobic.003G068100 receptor kinase, putative, expressed -
3 Sobic.003G272001 - -
4 Sobic.005G116800 - -
5 Sobic.006G083050 - -
6 Sobic.006G159500 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
7 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.004G264900 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K00817: histidinol-phosphate aminotransferase
9 Sobic.009G115800 REX1 DNA Repair family protein, expressed K10845: TTDA, GTF2H5, TFIIH basal transcription factor complex TTD-A subunit
10 Sobic.001G326500 OsFBX157 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G261766 - -
12 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -
13 Sobic.003G267150 - -
14 Sobic.006G099400 - -
15 Sobic.010G156300 rp1, putative, expressed -
16 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
17 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
18 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
19 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
20 Sobic.002G160500 - K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1


Gene co-expression network
sample Sobic003G067900 Sobic003G067900 Sobic001G534132 Sobic001G534132 Sobic003G067900--Sobic001G534132 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic003G067900--Sobic003G068100 Sobic003G272001 Sobic003G272001 Sobic003G067900--Sobic003G272001 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic003G067900--Sobic005G116800 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic003G067900--Sobic006G083050 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic003G067900--Sobic006G159500 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic003G067900--Sobic008G142500 Sobic004G264900 Sobic004G264900 Sobic003G067900--Sobic004G264900 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic003G067900--Sobic009G115800 Sobic001G534132--Sobic003G067900 Sobic001G534132--Sobic003G068100 Sobic001G534132--Sobic003G272001 Sobic001G534132--Sobic006G159500 Sobic005G185000 Sobic005G185000 Sobic001G534132--Sobic005G185000 Sobic003G267150 Sobic003G267150 Sobic001G534132--Sobic003G267150 Sobic002G160500 Sobic002G160500 Sobic001G534132--Sobic002G160500 Sobic003G068100--Sobic003G067900 Sobic003G068100--Sobic006G083050 Sobic003G068100--Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic008G142500 Sobic003G068100--Sobic005G116800 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic003G068100--Sobic001G326500 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic003G068100--Sobic002G421100 Sobic003G068100--Sobic006G159500 Sobic003G068100--Sobic009G115800 Sobic003G272001--Sobic003G067900 Sobic003G272001--Sobic001G534132 Sobic001G496000 Sobic001G496000 Sobic003G272001--Sobic001G496000 Sobic003G272001--Sobic001G326500 Sobic002G099932 Sobic002G099932 Sobic003G272001--Sobic002G099932 Sobic003G272001--Sobic003G068100 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic003G272001--Sobic002G160300 Sobic003G272001--Sobic005G116800 Sobic003G272001--Sobic008G142500 Sobic005G116800--Sobic006G083050 Sobic005G041150 Sobic005G041150 Sobic005G116800--Sobic005G041150 Sobic010G156300 Sobic010G156300 Sobic005G116800--Sobic010G156300 Sobic003G261766 Sobic003G261766 Sobic005G116800--Sobic003G261766 Sobic005G116800--Sobic008G142500 Sobic006G099400 Sobic006G099400 Sobic005G116800--Sobic006G099400 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G025750 Sobic005G116800--Sobic009G115800 Sobic005G116800--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic005G116800 Sobic006G083050--Sobic010G156300 Sobic006G083050--Sobic009G025750 Sobic006G083050--Sobic003G261766 Sobic006G083050--Sobic005G041150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic007G179100 Sobic006G083050--Sobic008G142500 Sobic006G083050--Sobic003G068100 Sobic006G083050--Sobic009G115800 Sobic006G159500--Sobic009G115800 Sobic006G159500--Sobic003G261766 Sobic004G313000 Sobic004G313000 Sobic006G159500--Sobic004G313000 Sobic006G159500--Sobic003G267150 Sobic005G216833 Sobic005G216833 Sobic006G159500--Sobic005G216833 Sobic002G319900 Sobic002G319900 Sobic006G159500--Sobic002G319900 Sobic006G159500--Sobic002G160500 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic008G142500--Sobic006G221500 Sobic004G264900--Sobic006G099400 Sobic004G264900--Sobic009G115800 Sobic004G264900--Sobic006G159500 Sobic004G264900--Sobic003G261766 Sobic004G262550 Sobic004G262550 Sobic004G264900--Sobic004G262550 Sobic004G264900--Sobic005G041150 Sobic004G264900--Sobic002G160500 Sobic009G115800--Sobic003G261766 Sobic009G115800--Sobic006G159500 Sobic009G115800--Sobic005G216833 Sobic008G108100 Sobic008G108100 Sobic009G115800--Sobic008G108100 Sobic009G115800--Sobic005G041150 Sobic009G115800--Sobic004G313000 Sobic009G115800--Sobic003G267150 Sobic009G115800--Sobic002G319900 Sobic009G115800--Sobic002G160500
Octagon: transcription factors


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