Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G085601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RCZ7
Pfam PF03061
Panther DB PTHR21660 PTHR21660:SF15
NCBI CDD KOG3328; HGG motif-containing thioesterase
KEGG Orthology K17362; acyl-coenzyme A thioesterase 13
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G04290 : Thioesterase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g35590.1 : thioesterase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056098 , Zm00025a011314
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G131500 - -
2 Sobic.009G216200 - -
3 Sobic.004G267400 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
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12 Sobic.003G067900 - -
13 Sobic.004G267650 - -
14 Sobic.003G443601 - -
15 Sobic.009G253900 - -
16 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -
17 Sobic.003G069601 - -
18 Sobic.010G089350 - -
19 Sobic.001G326500 OsFBX157 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G212500 AP2 domain containing protein, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage


Gene co-expression network
sample Sobic006G085601 Sobic006G085601 Sobic005G131500 Sobic005G131500 Sobic006G085601--Sobic005G131500 Sobic009G216200 Sobic009G216200 Sobic006G085601--Sobic009G216200 Sobic004G267400 Sobic004G267400 Sobic006G085601--Sobic004G267400 Sobic006G089266 Sobic006G089266 Sobic006G085601--Sobic006G089266 Sobic003G068100 Sobic003G068100 Sobic006G085601--Sobic003G068100 Sobic004G093800 Sobic004G093800 Sobic006G085601--Sobic004G093800 Sobic003G433000 Sobic003G433000 Sobic006G085601--Sobic003G433000 Sobic009G204700 Sobic009G204700 Sobic006G085601--Sobic009G204700 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic006G085601--Sobic008G142500 Sobic005G131500--Sobic006G089266 Sobic005G131500--Sobic006G085601 Sobic005G131500--Sobic004G093800 Sobic004G173300 Sobic004G173300 Sobic005G131500--Sobic004G173300 Sobic005G131500--Sobic003G068100 Sobic005G131500--Sobic009G216200 Sobic005G131500--Sobic008G142500 Sobic002G307500 Sobic002G307500 Sobic005G131500--Sobic002G307500 Sobic005G131500--Sobic004G267400 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic009G216200--Sobic003G443601 Sobic009G216200--Sobic005G131500 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic009G216200--Sobic002G377501 Sobic009G216200--Sobic009G204700 Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic009G216200--Sobic002G259900 Sobic009G216200--Sobic006G089266 Sobic009G216200--Sobic006G085601 Sobic009G216200--Sobic004G267400 Sobic009G216200--Sobic003G433000 Sobic004G068600 Sobic004G068600 Sobic004G267400--Sobic004G068600 Sobic001G052700 Sobic001G052700 Sobic004G267400--Sobic001G052700 Sobic006G136300 Sobic006G136300 Sobic004G267400--Sobic006G136300 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic004G267400--Sobic002G374000 Sobic006G221500 Sobic006G221500 Sobic004G267400--Sobic006G221500 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic004G267400--Sobic007G183600 Sobic004G315400 Sobic004G315400 Sobic004G267400--Sobic004G315400 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic004G267400--Sobic003G069601 Sobic005G228650 Sobic005G228650 Sobic004G267400--Sobic005G228650 Sobic009G253900 Sobic009G253900 Sobic006G089266--Sobic009G253900 Sobic006G089266--Sobic005G131500 Sobic006G089266--Sobic004G173300 Sobic006G089266--Sobic004G093800 Sobic007G001700 Sobic007G001700 Sobic006G089266--Sobic007G001700 Sobic005G218300 Sobic005G218300 Sobic006G089266--Sobic005G218300 Sobic006G089266--Sobic002G377501 Sobic006G089266--Sobic009G216200 Sobic006G089266--Sobic002G307500 Sobic003G067900 Sobic003G067900 Sobic003G068100--Sobic003G067900 Sobic006G083050 Sobic006G083050 Sobic003G068100--Sobic006G083050 Sobic001G534132 Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic001G534132 Sobic003G068100--Sobic008G142500 Sobic005G116800 Sobic005G116800 Sobic003G068100--Sobic005G116800 Sobic001G326500 Sobic001G326500 Sobic003G068100--Sobic001G326500 Sobic002G421100 Sobic002G421100 Sobic003G068100--Sobic002G421100 Sobic006G159500 Sobic006G159500 Sobic003G068100--Sobic006G159500 Sobic009G115800 Sobic009G115800 Sobic003G068100--Sobic009G115800 Sobic004G093800--Sobic002G307500 Sobic001G489400 Sobic001G489400 Sobic004G093800--Sobic001G489400 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic004G093800--Sobic009G199401 Sobic004G093800--Sobic004G173300 Sobic010G002600 Sobic010G002600 Sobic004G093800--Sobic010G002600 Sobic004G093800--Sobic008G142500 Sobic010G229025 Sobic010G229025 Sobic004G093800--Sobic010G229025 Sobic006G192900 Sobic006G192900 Sobic004G093800--Sobic006G192900 Sobic004G093800--Sobic005G131500 Sobic004G267650 Sobic004G267650 Sobic003G433000--Sobic004G267650 Sobic003G433000--Sobic003G069601 Sobic008G046700 Sobic008G046700 Sobic003G433000--Sobic008G046700 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic003G433000--Sobic006G280250 Sobic001G174100 Sobic001G174100 Sobic003G433000--Sobic001G174100 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic003G433000--Sobic002G046150 Sobic003G433000--Sobic002G374000 Sobic003G433000--Sobic004G267400 Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic003G433000--Sobic010G105900 Sobic009G204700--Sobic004G267400 Sobic009G204700--Sobic003G069601 Sobic006G045601 Sobic006G045601 Sobic009G204700--Sobic006G045601 Sobic001G100300 Sobic001G100300 Sobic009G204700--Sobic001G100300 Sobic009G204700--Sobic009G216200 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic009G204700--Sobic009G173700 Sobic009G204700--Sobic003G433000 Sobic009G204700--Sobic002G374000 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic009G204700--Sobic009G235400 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic001G014600 Sobic008G142500--Sobic009G173700 Sobic008G142500--Sobic001G326500 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic009G035000 Sobic008G142500--Sobic006G083050 Sobic008G142500--Sobic005G116800 Sobic008G142500--Sobic002G421100 Sobic008G142500--Sobic003G068100 Sobic008G142500--Sobic006G221500
Octagon: transcription factors


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