Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G212500.1
Synonym Sb09g026800, WRI1, WRI, ASML1, ATWRI1
Functional annotation AP2 domain containing protein, expressed
UniProt C5YUI8
Pfam PF00847
Panther DB PTHR32467 PTHR32467:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology K09285; OVM, AP2-like factor, ANT lineage
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity GO:0007275multicellular organism development


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54320 : Integrase-type DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g45954.1 : AP2 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038318 , Zm00025a039019
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G080350.3 , HORVU1Hr1G080350.2 , HORVU1Hr1G080350.1 , HORVU1Hr1G080350.4
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G280250 - -
2 Sobic.003G433000 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
3 Sobic.001G202550 - -
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5 Sobic.004G306700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40, putative, expressed K05864: PPID, peptidyl-prolyl isomerase D
6 Sobic.001G388800 tRNA-specific adenosine deaminase 2, putative, expressed K15441: TAD2, tRNA-specific adenosine deaminase 2
7 Sobic.004G091300 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
8 Sobic.008G075500 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.009G199401 - -
10 Sobic.008G169500 - -
11 Sobic.001G507700 - -
12 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -
13 Sobic.001G424066 - -
14 Sobic.009G064832 - -
15 Sobic.004G008100 OsWAK11 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
16 Sobic.005G116700 receptor kinase, putative, expressed -
17 Sobic.001G489400 3-dehydroquinate synthase, putative, expressed -
18 Sobic.006G082100 dehydration-responsive element-binding protein, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
19 Sobic.004G265066 - -
20 Sobic.007G124800 MLA1, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Sobic005G116700 Sobic009G199401--Sobic005G116700 Sobic004G186950 Sobic004G186950 Sobic009G199401--Sobic004G186950
Octagon: transcription factors


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