Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G479900.1
Synonym
Functional annotation pentatricopeptide repeat protein PPR1106-17, putative, expressed
UniProt C5WUW5
Pfam PF07798 PF01535 PF13041 PF05701
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF797
NCBI CDD KOG0963; Transcription factor/CCAAT displacement protein CDP1
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G13650 : Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g20870.1 : pentatricopeptide repeat protein PPR1106-17, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041733 , Zm00025a000964 , Zm00025a053244
Brachypodium KQK23269
Barley HORVU7Hr1G091170.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
2 Sobic.001G014600 - -
3 Sobic.003G115266 - -
4 Sobic.009G173700 expansin precursor, putative, expressed -
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6 Sobic.006G221500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@acyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.007G217350 - -
8 Sobic.005G116800 - -
9 Sobic.006G235801 - -
10 Sobic.003G056900 expressed protein -
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12 Sobic.009G035000 expressed protein -
13 Sobic.001G439050 - -
14 Sobic.006G083050 - -
15 Sobic.003G162600 expressed protein -
16 Sobic.003G068100 receptor kinase, putative, expressed -
17 Sobic.005G004900 PMR5, putative, expressed -
18 Sobic.006G136300 - -
19 Sobic.001G451150 - -
20 Sobic.002G421100 KIP1, putative, expressed -


Gene co-expression network
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