Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G451150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SB26
Pfam PF02214
Panther DB PTHR14499 PTHR14499:SF70
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G30940 : BTB/POZ domain with WD40/YVTN repeat-like protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g42310.1 : B4-BTB3 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with B4 subfamily conserved sequence, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056413
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G086690.2 , HORVU2Hr1G086690.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G112200 - -
2 Sobic.001G527550 - -
3 Sobic.003G301050 - -
4 Sobic.001G014600 - -
5 Sobic.010G124100 - -
6 Sobic.005G187700 receptor kinase, putative, expressed -
7 Sobic.005G119400 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
8 Sobic.001G401750 - -
9 Sobic.K043600 - -
10 Sobic.K031300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed -
11 Sobic.009G035000 expressed protein -
12 Sobic.001G050650 - -
13 Sobic.003G072000 receptor kinase, putative, expressed -
14 Sobic.003G168600 cytochrome b6-f complex subunit 4, putative, expressed K02637: cytochrome b6-f complex subunit 4
15 Sobic.009G095720 - -
16 Sobic.009G148400 - -
17 Sobic.007G045750 - -
18 Sobic.008G142500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
19 Sobic.006G264400 co-chaperone GrpE protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G173700 expansin precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G451150 Sobic001G451150 Sobic002G112200 Sobic002G112200 Sobic001G451150--Sobic002G112200 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic001G451150--Sobic001G527550 Sobic003G301050 Sobic003G301050 Sobic001G451150--Sobic003G301050 Sobic001G014600 Sobic001G014600 Sobic001G451150--Sobic001G014600 Sobic010G124100 Sobic010G124100 Sobic001G451150--Sobic010G124100 Sobic005G187700 Sobic005G187700 Sobic001G451150--Sobic005G187700 Sobic005G119400 Sobic005G119400 Sobic001G451150--Sobic005G119400 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic001G451150--Sobic001G401750 SobicK043600 SobicK043600 Sobic001G451150--SobicK043600 Sobic002G112200--Sobic001G401750 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic002G112200--Sobic004G223700 Sobic001G050650 Sobic001G050650 Sobic002G112200--Sobic001G050650 SobicK031300 SobicK031300 Sobic002G112200--SobicK031300 Sobic009G095720 Sobic009G095720 Sobic002G112200--Sobic009G095720 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic002G112200--Sobic003G168600 Sobic002G112200--SobicK043600 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic002G112200--Sobic001G081450 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic002G112200--Sobic006G264400 SobicK032500 SobicK032500 Sobic001G527550--SobicK032500 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic001G527550--Sobic004G334501 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic001G527550--Sobic007G079901 Sobic001G527550--Sobic001G050650 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic001G527550--Sobic002G018200 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic001G527550--Sobic002G022500 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic001G527550--Sobic002G094000 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic001G527550--Sobic005G024500 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic001G527550--Sobic002G073000 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic003G301050--Sobic010G167700 Sobic003G301050--SobicK043600 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic003G301050--Sobic003G072000 Sobic003G301050--Sobic001G527550 Sobic003G301050--Sobic005G187700 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic003G301050--Sobic004G140900 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic003G301050--Sobic002G074700 Sobic001G251750 Sobic001G251750 Sobic003G301050--Sobic001G251750 Sobic003G301050--Sobic007G079901 Sobic009G173700 Sobic009G173700 Sobic001G014600--Sobic009G173700 Sobic008G142500 Sobic008G142500 Sobic001G014600--Sobic008G142500 Sobic006G235801 Sobic006G235801 Sobic001G014600--Sobic006G235801 Sobic009G035000 Sobic009G035000 Sobic001G014600--Sobic009G035000 Sobic001G014600--Sobic005G187700 Sobic001G014600--Sobic005G119400 Sobic001G014600--Sobic001G401750 Sobic009G025750 Sobic009G025750 Sobic001G014600--Sobic009G025750 Sobic007G042700 Sobic007G042700 Sobic001G014600--Sobic007G042700 Sobic010G124100--Sobic002G112200 Sobic010G124100--Sobic001G401750 Sobic010G124100--Sobic005G119400 Sobic010G124100--SobicK043600 Sobic010G061400 Sobic010G061400 Sobic010G124100--Sobic010G061400 Sobic010G124100--Sobic001G050650 Sobic010G124100--Sobic010G167700 Sobic010G124100--Sobic003G301050 Sobic010G124100--Sobic003G168600 Sobic005G187700--Sobic003G072000 Sobic005G187700--Sobic009G173700 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic005G187700--Sobic003G142500 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic005G187700--Sobic009G213150 Sobic003G341900 Sobic003G341900 Sobic005G187700--Sobic003G341900 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic005G187700--Sobic007G149500 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic005G187700--Sobic002G202350 Sobic005G187700--Sobic001G527550 Sobic005G187700--Sobic001G014600 Sobic005G119400--Sobic001G050650 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic005G119400--Sobic007G045750 Sobic005G119400--Sobic002G112200 Sobic005G119400--Sobic009G025750 Sobic005G119400--Sobic001G401750 Sobic005G119400--Sobic009G035000 Sobic005G119400--Sobic001G014600 Sobic002G062400 Sobic002G062400 Sobic005G119400--Sobic002G062400 Sobic005G119400--Sobic010G124100 Sobic001G401750--Sobic002G112200 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic001G401750--Sobic004G272950 Sobic001G401750--Sobic004G223700 Sobic001G401750--Sobic009G095720 Sobic001G401750--Sobic003G168600 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic001G401750--Sobic007G098050 Sobic001G401750--Sobic001G081450 Sobic001G401750--Sobic006G264400 Sobic001G401750--SobicK031300 SobicK043600--Sobic003G168600 SobicK043600--SobicK031300 SobicK043600--Sobic004G272950 Sobic003G172000 Sobic003G172000 SobicK043600--Sobic003G172000 Sobic002G121050 Sobic002G121050 SobicK043600--Sobic002G121050 SobicK043600--Sobic002G112200 SobicK043600--Sobic009G095720 Sobic009G209650 Sobic009G209650 SobicK043600--Sobic009G209650 SobicK043600--Sobic001G401750
Octagon: transcription factors


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