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Transcriptome id Sobic.001G396550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S9V1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G427201 - -
2 Sobic.002G271800 4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase, putative, expressed -
3 Sobic.007G044350 - -
4 Sobic.002G107700 - -
5 Sobic.006G242600 RIPER9 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
6 Sobic.002G262500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@osFTL4 FT-Like4 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
7 Sobic.001G229401 - -
8 Sobic.002G208301 - K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
9 Sobic.010G184201 - -
10 Sobic.007G031000 X8 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.006G153550 - -
12 Sobic.004G237900 no apical meristem protein, putative, expressed -
13 Sobic.007G206600 - -
14 Sobic.001G227601 - -
15 Sobic.010G217466 - -
16 Sobic.010G011001 - -
17 Sobic.003G239750 - -
18 Sobic.004G258450 - -
19 Sobic.004G070150 - -
20 Sobic.004G051800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G396550 Sobic001G396550 Sobic002G427201 Sobic002G427201 Sobic001G396550--Sobic002G427201 Sobic002G271800 Sobic002G271800 Sobic001G396550--Sobic002G271800 Sobic007G044350 Sobic007G044350 Sobic001G396550--Sobic007G044350 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic001G396550--Sobic002G107700 Sobic006G242600 Sobic006G242600 Sobic001G396550--Sobic006G242600 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic001G396550--Sobic002G262500 Sobic001G229401 Sobic001G229401 Sobic001G396550--Sobic001G229401 Sobic002G208301 Sobic002G208301 Sobic001G396550--Sobic002G208301 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic001G396550--Sobic010G184201 Sobic002G427201--Sobic002G262500 Sobic002G427201--Sobic001G396550 Sobic002G427201--Sobic006G242600 Sobic001G004901 Sobic001G004901 Sobic002G427201--Sobic001G004901 Sobic003G396400 Sobic003G396400 Sobic002G427201--Sobic003G396400 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic002G427201--Sobic010G217466 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic002G427201--Sobic002G375600 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic002G427201--Sobic002G429200 Sobic009G221701 Sobic009G221701 Sobic002G427201--Sobic009G221701 Sobic002G271800--Sobic001G396550 Sobic010G011001 Sobic010G011001 Sobic002G271800--Sobic010G011001 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic002G271800--Sobic004G237900 Sobic002G271800--Sobic007G044350 Sobic008G169500 Sobic008G169500 Sobic002G271800--Sobic008G169500 Sobic002G271800--Sobic002G107700 Sobic002G342700 Sobic002G342700 Sobic002G271800--Sobic002G342700 Sobic001G452600 Sobic001G452600 Sobic002G271800--Sobic001G452600 Sobic002G271800--Sobic010G184201 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic007G044350--Sobic001G296600 Sobic004G060000 Sobic004G060000 Sobic007G044350--Sobic004G060000 Sobic007G044350--Sobic010G217466 Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic007G044350--Sobic001G104050 Sobic006G108900 Sobic006G108900 Sobic007G044350--Sobic006G108900 Sobic007G044350--Sobic002G262500 Sobic003G276700 Sobic003G276700 Sobic007G044350--Sobic003G276700 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic007G044350--Sobic006G119100 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic007G044350--Sobic004G357600 Sobic002G107700--Sobic010G184201 Sobic002G107700--Sobic004G237900 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic002G107700--Sobic004G070150 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic002G107700--Sobic003G399800 Sobic001G385132 Sobic001G385132 Sobic002G107700--Sobic001G385132 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic002G107700--Sobic002G315450 Sobic002G107700--Sobic002G208301 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic002G107700--Sobic007G038200 Sobic002G107700--Sobic003G276700 Sobic006G242600--Sobic003G396400 Sobic006G242600--Sobic009G221701 Sobic010G149900 Sobic010G149900 Sobic006G242600--Sobic010G149900 Sobic006G242600--Sobic010G217466 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic006G242600--Sobic006G214101 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic006G242600--Sobic005G106800 Sobic002G410050 Sobic002G410050 Sobic006G242600--Sobic002G410050 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic006G242600--Sobic002G149550 Sobic006G242600--Sobic002G429200 Sobic002G262500--Sobic002G427201 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic002G262500--Sobic007G173901 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic002G262500--Sobic008G086100 Sobic002G262500--Sobic006G242600 Sobic002G262500--Sobic010G217466 Sobic005G027032 Sobic005G027032 Sobic002G262500--Sobic005G027032 Sobic002G262500--Sobic009G221701 Sobic001G062400 Sobic001G062400 Sobic002G262500--Sobic001G062400 Sobic002G262500--Sobic002G429200 Sobic006G153550 Sobic006G153550 Sobic001G229401--Sobic006G153550 Sobic001G229401--Sobic010G149900 Sobic003G232200 Sobic003G232200 Sobic001G229401--Sobic003G232200 Sobic001G229401--Sobic006G214101 Sobic003G192801 Sobic003G192801 Sobic001G229401--Sobic003G192801 Sobic001G229401--Sobic002G429200 Sobic001G229401--Sobic006G242600 Sobic004G072950 Sobic004G072950 Sobic001G229401--Sobic004G072950 Sobic001G229401--Sobic003G396400 Sobic002G208301--Sobic003G399800 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic002G208301--Sobic009G049100 Sobic001G227601 Sobic001G227601 Sobic002G208301--Sobic001G227601 Sobic002G208301--Sobic002G107700 Sobic003G276400 Sobic003G276400 Sobic002G208301--Sobic003G276400 Sobic006G165501 Sobic006G165501 Sobic002G208301--Sobic006G165501 Sobic002G208301--Sobic001G385132 Sobic002G208301--Sobic004G237900 Sobic002G208301--Sobic010G184201 Sobic010G184201--Sobic002G107700 Sobic010G184201--Sobic004G237900 Sobic010G184201--Sobic003G399800 Sobic010G184201--Sobic001G385132 Sobic010G184201--Sobic002G315450 Sobic001G494950 Sobic001G494950 Sobic010G184201--Sobic001G494950 Sobic010G184201--Sobic004G070150 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic010G184201--Sobic004G258450 Sobic010G184201--Sobic002G208301
Octagon: transcription factors


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