Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G271800.1
Synonym Sb02g030560
Functional annotation 4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase, putative, expressed
UniProt C5X649
Pfam PF03328
Panther DB PTHR30502 PTHR30502:SF0
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003824; catalytic activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G10750 : Phosphoenolpyruvate carboxylase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g36030.1 : 4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008230 , Zm00025a014402 , Zm00025a014403
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G080980.4 , HORVU5Hr1G080980.2 , HORVU5Hr1G080980.3 , HORVU5Hr1G080980.1 , HORVU5Hr1G080980.8 , HORVU5Hr1G080980.9 , HORVU5Hr1G080980.20 , HORVU5Hr1G080980.14 , HORVU5Hr1G080980.15 , HORVU5Hr1G080980.10
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G271800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G271800 Sobic002G271800 Sobic001G396550 Sobic001G396550 Sobic002G271800--Sobic001G396550 Sobic010G011001 Sobic010G011001 Sobic002G271800--Sobic010G011001 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic002G271800--Sobic004G237900 Sobic007G044350 Sobic007G044350 Sobic002G271800--Sobic007G044350 Sobic008G169500 Sobic008G169500 Sobic002G271800--Sobic008G169500 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic002G271800--Sobic002G107700 Sobic002G342700 Sobic002G342700 Sobic002G271800--Sobic002G342700 Sobic001G452600 Sobic001G452600 Sobic002G271800--Sobic001G452600 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic002G271800--Sobic010G184201 Sobic002G427201 Sobic002G427201 Sobic001G396550--Sobic002G427201 Sobic001G396550--Sobic002G271800 Sobic001G396550--Sobic007G044350 Sobic001G396550--Sobic002G107700 Sobic006G242600 Sobic006G242600 Sobic001G396550--Sobic006G242600 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic001G396550--Sobic002G262500 Sobic001G229401 Sobic001G229401 Sobic001G396550--Sobic001G229401 Sobic002G208301 Sobic002G208301 Sobic001G396550--Sobic002G208301 Sobic001G396550--Sobic010G184201 Sobic009G188750 Sobic009G188750 Sobic010G011001--Sobic009G188750 Sobic003G239750 Sobic003G239750 Sobic010G011001--Sobic003G239750 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic010G011001--Sobic008G096300 Sobic006G109850 Sobic006G109850 Sobic010G011001--Sobic006G109850 Sobic008G142301 Sobic008G142301 Sobic010G011001--Sobic008G142301 Sobic007G206600 Sobic007G206600 Sobic010G011001--Sobic007G206600 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic010G011001--Sobic008G086100 Sobic003G233300 Sobic003G233300 Sobic010G011001--Sobic003G233300 Sobic009G024133 Sobic009G024133 Sobic010G011001--Sobic009G024133 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic004G237900--Sobic003G399800 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic004G237900--Sobic004G258450 Sobic001G245100 Sobic001G245100 Sobic004G237900--Sobic001G245100 Sobic004G237900--Sobic002G107700 Sobic008G132550 Sobic008G132550 Sobic004G237900--Sobic008G132550 Sobic004G237900--Sobic010G184201 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic004G237900--Sobic004G070150 Sobic009G049100 Sobic009G049100 Sobic004G237900--Sobic009G049100 Sobic001G385132 Sobic001G385132 Sobic004G237900--Sobic001G385132 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic007G044350--Sobic001G296600 Sobic004G060000 Sobic004G060000 Sobic007G044350--Sobic004G060000 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic007G044350--Sobic010G217466 Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic007G044350--Sobic001G104050 Sobic006G108900 Sobic006G108900 Sobic007G044350--Sobic006G108900 Sobic007G044350--Sobic002G262500 Sobic003G276700 Sobic003G276700 Sobic007G044350--Sobic003G276700 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic007G044350--Sobic006G119100 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic007G044350--Sobic004G357600 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic008G169500--Sobic002G208900 Sobic009G144400 Sobic009G144400 Sobic008G169500--Sobic009G144400 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic008G169500--Sobic007G038200 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic008G169500--Sobic006G215650 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic008G169500--Sobic006G280250 Sobic008G075500 Sobic008G075500 Sobic008G169500--Sobic008G075500 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic008G169500--Sobic009G199401 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic008G169500--Sobic002G129900 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic008G169500--Sobic001G150100 Sobic002G107700--Sobic010G184201 Sobic002G107700--Sobic004G237900 Sobic002G107700--Sobic004G070150 Sobic002G107700--Sobic003G399800 Sobic002G107700--Sobic001G385132 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic002G107700--Sobic002G315450 Sobic002G107700--Sobic002G208301 Sobic002G107700--Sobic007G038200 Sobic002G107700--Sobic003G276700 Sobic002G342700--Sobic001G452600 Sobic007G078900 Sobic007G078900 Sobic002G342700--Sobic007G078900 Sobic003G135900 Sobic003G135900 Sobic002G342700--Sobic003G135900 Sobic006G233200 Sobic006G233200 Sobic002G342700--Sobic006G233200 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic002G342700--Sobic004G255550 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic002G342700--Sobic003G053750 Sobic002G342700--Sobic008G169500 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic002G342700--Sobic002G226200 Sobic002G413800 Sobic002G413800 Sobic002G342700--Sobic002G413800 Sobic001G452600--Sobic002G342700 Sobic001G452600--Sobic007G078900 Sobic001G452600--Sobic002G413800 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic001G452600--Sobic003G241600 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic001G452600--Sobic004G288900 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic001G452600--Sobic009G252500 Sobic001G452600--Sobic008G096300 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic001G452600--Sobic003G429600 Sobic001G452600--Sobic003G135900 Sobic010G184201--Sobic002G107700 Sobic010G184201--Sobic004G237900 Sobic010G184201--Sobic003G399800 Sobic010G184201--Sobic001G385132 Sobic010G184201--Sobic002G315450 Sobic001G494950 Sobic001G494950 Sobic010G184201--Sobic001G494950 Sobic010G184201--Sobic004G070150 Sobic010G184201--Sobic004G258450 Sobic010G184201--Sobic002G208301
Octagon: transcription factors


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