Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G342700.6,Sobic.002G342700.1,Sobic.002G342700.4,Sobic.002G342700.3,Sobic.002G342700.5
Synonym Sb02g036675
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XBL3 , A0A1W0W6S2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G31175 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g38010.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK15675
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G452600 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G078900 - -
3 Sobic.003G135900 OsRhmbd3 - Putative Rhomboid homologue, expressed K09651: rhomboid domain-containing protein 1
4 Sobic.006G233200 - -
5 Sobic.004G255550 - -
6 Sobic.003G053750 - -
7 Sobic.008G169500 - -
8 Sobic.002G226200 - -
9 Sobic.002G413800 Spc97 / Spc98 family protein, putative, expressed -
10 Sobic.007G016200 expressed protein -
11 Sobic.004G030850 - -
12 Sobic.003G429600 - -
13 Sobic.003G267600 potassium channel protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G215650 - -
15 Sobic.003G336550 - -
16 Sobic.006G021100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@L-ascorbate peroxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@OsAPx3 - Peroxisomal Ascorbate Peroxidase encoding gene 5,8, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
17 Sobic.007G078700 - -
18 Sobic.001G148800 hsp20/alpha crystallin family protein, putative, expressed -
19 Sobic.007G081400 - -
20 Sobic.001G283400 CSLD1 - cellulose synthase-like family D, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G342700 Sobic002G342700 Sobic001G452600 Sobic001G452600 Sobic002G342700--Sobic001G452600 Sobic007G078900 Sobic007G078900 Sobic002G342700--Sobic007G078900 Sobic003G135900 Sobic003G135900 Sobic002G342700--Sobic003G135900 Sobic006G233200 Sobic006G233200 Sobic002G342700--Sobic006G233200 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic002G342700--Sobic004G255550 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic002G342700--Sobic003G053750 Sobic008G169500 Sobic008G169500 Sobic002G342700--Sobic008G169500 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic002G342700--Sobic002G226200 Sobic002G413800 Sobic002G413800 Sobic002G342700--Sobic002G413800 Sobic001G452600--Sobic002G342700 Sobic001G452600--Sobic007G078900 Sobic001G452600--Sobic002G413800 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic001G452600--Sobic003G241600 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic001G452600--Sobic004G288900 Sobic009G252500 Sobic009G252500 Sobic001G452600--Sobic009G252500 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic001G452600--Sobic008G096300 Sobic003G429600 Sobic003G429600 Sobic001G452600--Sobic003G429600 Sobic001G452600--Sobic003G135900 Sobic007G078900--Sobic003G135900 Sobic003G267600 Sobic003G267600 Sobic007G078900--Sobic003G267600 Sobic007G078900--Sobic004G255550 Sobic007G078900--Sobic002G342700 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic007G078900--Sobic006G041200 Sobic007G078900--Sobic002G226200 Sobic007G016200 Sobic007G016200 Sobic007G078900--Sobic007G016200 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic007G078900--Sobic006G021100 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic007G078900--Sobic004G030850 Sobic003G135900--Sobic007G078900 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic003G135900--Sobic003G336550 Sobic003G135900--Sobic004G255550 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic003G135900--Sobic003G305250 Sobic003G135900--Sobic006G041200 Sobic003G135900--Sobic004G030850 Sobic003G253100 Sobic003G253100 Sobic003G135900--Sobic003G253100 Sobic003G135900--Sobic003G267600 Sobic006G201450 Sobic006G201450 Sobic003G135900--Sobic006G201450 Sobic006G162750 Sobic006G162750 Sobic006G233200--Sobic006G162750 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic006G233200--Sobic001G036400 Sobic006G233200--Sobic007G078900 Sobic006G233200--Sobic004G255550 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic006G233200--Sobic007G078700 Sobic006G052250 Sobic006G052250 Sobic006G233200--Sobic006G052250 Sobic005G019250 Sobic005G019250 Sobic006G233200--Sobic005G019250 Sobic009G011100 Sobic009G011100 Sobic006G233200--Sobic009G011100 Sobic006G279600 Sobic006G279600 Sobic006G233200--Sobic006G279600 Sobic004G255550--Sobic006G041200 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic004G255550--Sobic008G113200 Sobic004G255550--Sobic002G226200 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic004G255550--Sobic006G111000 Sobic004G255550--Sobic003G336550 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic004G255550--Sobic008G083100 Sobic004G255550--Sobic004G030850 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic004G255550--Sobic007G182300 Sobic004G255550--Sobic007G078700 Sobic003G053750--Sobic004G030850 Sobic003G053750--Sobic003G429600 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic003G053750--Sobic009G137401 Sobic003G053750--Sobic006G021100 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic003G053750--Sobic009G176100 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic003G053750--Sobic002G033200 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic003G053750--Sobic003G329300 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic003G053750--Sobic001G191500 Sobic003G053750--Sobic008G113200 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic008G169500--Sobic002G208900 Sobic009G144400 Sobic009G144400 Sobic008G169500--Sobic009G144400 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic008G169500--Sobic007G038200 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic008G169500--Sobic006G215650 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic008G169500--Sobic006G280250 Sobic008G075500 Sobic008G075500 Sobic008G169500--Sobic008G075500 Sobic009G199401 Sobic009G199401 Sobic008G169500--Sobic009G199401 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic008G169500--Sobic002G129900 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic008G169500--Sobic001G150100 Sobic002G226200--Sobic004G255550 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic002G226200--Sobic003G219300 Sobic002G226200--Sobic008G083100 Sobic002G226200--Sobic003G267600 Sobic002G226200--Sobic006G041200 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic002G226200--Sobic008G190600 Sobic002G226200--Sobic001G191500 Sobic002G226200--Sobic007G016200 Sobic002G226200--Sobic006G021100 Sobic002G413800--Sobic003G429600 Sobic004G327200 Sobic004G327200 Sobic002G413800--Sobic004G327200 Sobic005G096201 Sobic005G096201 Sobic002G413800--Sobic005G096201 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic002G413800--Sobic002G209450 Sobic002G013600 Sobic002G013600 Sobic002G413800--Sobic002G013600 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic002G413800--Sobic001G312801 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic002G413800--Sobic004G224100 Sobic002G413800--Sobic008G096300 Sobic009G147600 Sobic009G147600 Sobic002G413800--Sobic009G147600
Octagon: transcription factors


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