Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G065400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QHL3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G426600 expressed protein -
2 Sobic.002G315450 - -
3 Sobic.001G004901 - -
4 Sobic.010G184201 - -
5 Sobic.002G262500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@osFTL4 FT-Like4 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
6 Sobic.002G427201 - -
7 Sobic.002G189350 - -
8 Sobic.004G045100 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
9 Sobic.001G104050 - -
10 Sobic.006G242600 RIPER9 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
11 Sobic.006G119100 expressed protein -
12 Sobic.002G107700 - -
13 Sobic.009G221701 - -
14 Sobic.001G296600 - -
15 Sobic.007G174701 - -
16 Sobic.004G070400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@metallo-beta-lactamase, putative, expressed -
17 Sobic.010G217466 - -
18 Sobic.007G173901 - -
19 Sobic.004G051800 - -
20 Sobic.006G116600 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G065400 Sobic001G065400 Sobic002G426600 Sobic002G426600 Sobic001G065400--Sobic002G426600 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic001G065400--Sobic002G315450 Sobic001G004901 Sobic001G004901 Sobic001G065400--Sobic001G004901 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic001G065400--Sobic010G184201 Sobic002G262500 Sobic002G262500 Sobic001G065400--Sobic002G262500 Sobic002G427201 Sobic002G427201 Sobic001G065400--Sobic002G427201 Sobic002G189350 Sobic002G189350 Sobic001G065400--Sobic002G189350 Sobic004G045100 Sobic004G045100 Sobic001G065400--Sobic004G045100 Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic001G065400--Sobic001G104050 Sobic006G242600 Sobic006G242600 Sobic002G426600--Sobic006G242600 Sobic002G426600--Sobic001G065400 Sobic009G221701 Sobic009G221701 Sobic002G426600--Sobic009G221701 Sobic003G396400 Sobic003G396400 Sobic002G426600--Sobic003G396400 Sobic002G426600--Sobic002G189350 Sobic002G426600--Sobic002G427201 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic002G426600--Sobic010G217466 Sobic002G426600--Sobic001G004901 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic002G426600--Sobic005G106800 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic002G315450--Sobic006G119100 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic002G315450--Sobic002G202350 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic002G315450--Sobic002G107700 Sobic002G315450--Sobic010G184201 Sobic002G315450--Sobic001G065400 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic002G315450--Sobic003G028700 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic002G315450--Sobic003G068200 Sobic008G165500 Sobic008G165500 Sobic002G315450--Sobic008G165500 Sobic002G315450--Sobic001G104050 Sobic001G004901--Sobic002G427201 Sobic001G004901--Sobic002G262500 Sobic001G004901--Sobic003G396400 Sobic003G292800 Sobic003G292800 Sobic001G004901--Sobic003G292800 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic001G004901--Sobic002G375600 Sobic010G183900 Sobic010G183900 Sobic001G004901--Sobic010G183900 Sobic001G004901--Sobic002G189350 Sobic001G004901--Sobic001G065400 Sobic004G341500 Sobic004G341500 Sobic001G004901--Sobic004G341500 Sobic010G184201--Sobic002G107700 Sobic004G237900 Sobic004G237900 Sobic010G184201--Sobic004G237900 Sobic003G399800 Sobic003G399800 Sobic010G184201--Sobic003G399800 Sobic001G385132 Sobic001G385132 Sobic010G184201--Sobic001G385132 Sobic010G184201--Sobic002G315450 Sobic001G494950 Sobic001G494950 Sobic010G184201--Sobic001G494950 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic010G184201--Sobic004G070150 Sobic004G258450 Sobic004G258450 Sobic010G184201--Sobic004G258450 Sobic002G208301 Sobic002G208301 Sobic010G184201--Sobic002G208301 Sobic002G262500--Sobic002G427201 Sobic007G173901 Sobic007G173901 Sobic002G262500--Sobic007G173901 Sobic008G086100 Sobic008G086100 Sobic002G262500--Sobic008G086100 Sobic002G262500--Sobic006G242600 Sobic002G262500--Sobic010G217466 Sobic005G027032 Sobic005G027032 Sobic002G262500--Sobic005G027032 Sobic002G262500--Sobic009G221701 Sobic001G062400 Sobic001G062400 Sobic002G262500--Sobic001G062400 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic002G262500--Sobic002G429200 Sobic002G427201--Sobic002G262500 Sobic001G396550 Sobic001G396550 Sobic002G427201--Sobic001G396550 Sobic002G427201--Sobic006G242600 Sobic002G427201--Sobic001G004901 Sobic002G427201--Sobic003G396400 Sobic002G427201--Sobic010G217466 Sobic002G427201--Sobic002G375600 Sobic002G427201--Sobic002G429200 Sobic002G427201--Sobic009G221701 Sobic005G230600 Sobic005G230600 Sobic002G189350--Sobic005G230600 Sobic002G189350--Sobic002G429200 Sobic002G189350--Sobic002G375600 Sobic002G189350--Sobic003G292800 Sobic004G071401 Sobic004G071401 Sobic002G189350--Sobic004G071401 Sobic002G189350--Sobic005G106800 Sobic002G189350--Sobic009G221701 Sobic003G299400 Sobic003G299400 Sobic002G189350--Sobic003G299400 Sobic002G189350--Sobic006G242600 Sobic004G070400 Sobic004G070400 Sobic004G045100--Sobic004G070400 Sobic004G139201 Sobic004G139201 Sobic004G045100--Sobic004G139201 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic004G045100--Sobic004G357600 Sobic009G026900 Sobic009G026900 Sobic004G045100--Sobic009G026900 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic004G045100--Sobic007G174000 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic004G045100--Sobic003G177350 Sobic004G045100--Sobic002G315450 Sobic004G045100--Sobic008G165500 Sobic004G045100--Sobic001G104050 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic001G104050--Sobic001G296600 Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic001G104050--Sobic010G265400 Sobic001G104050--Sobic004G357600 Sobic002G411700 Sobic002G411700 Sobic001G104050--Sobic002G411700 Sobic007G044350 Sobic007G044350 Sobic001G104050--Sobic007G044350 Sobic001G104050--Sobic004G070400 Sobic004G249200 Sobic004G249200 Sobic001G104050--Sobic004G249200 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic001G104050--Sobic001G036400 Sobic001G104050--Sobic004G070150
Octagon: transcription factors


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