Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G045100.1
Synonym Sb04g003870, AtRLP2, RLP2
Functional annotation phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed
UniProt C5XVB1
Pfam PF08263 PF00560 PF13855
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF209
NCBI CDD KOG0472; Leucine-rich repeat protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G17240 : receptor like protein 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g06070.1 : phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034859
Brachypodium KQJ93382 , KQJ93400
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G070400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@metallo-beta-lactamase, putative, expressed -
2 Sobic.004G139201 - -
3 Sobic.004G357600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Sucrose synthase genes(PubMedID : 24456189)@sucrose synthase(PubMedID : 26616172)@Sugar synthesis(PubMedID : 27330561)@sucrose synthase, putative, expressed K00695: sucrose synthase
4 Sobic.009G026900 protein kinase, putative, expressed -
5 Sobic.007G174000 carrier, putative, expressed -
6 Sobic.003G177350 - -
7 Sobic.002G315450 - -
8 Sobic.008G165500 - -
9 Sobic.001G104050 - -
10 Sobic.006G065000 - -
11 Sobic.001G296600 - -
12 Sobic.005G150700 resistance protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G203633 - -
14 Sobic.007G137100 - -
15 Sobic.003G399200 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
16 Sobic.001G065400 - -
17 Sobic.004G279400 ZR1 protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G025600 OsWAK112d - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
19 Sobic.010G175100 S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed -
20 Sobic.004G073700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G045100 Sobic004G045100 Sobic004G070400 Sobic004G070400 Sobic004G045100--Sobic004G070400 Sobic004G139201 Sobic004G139201 Sobic004G045100--Sobic004G139201 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic004G045100--Sobic004G357600 Sobic009G026900 Sobic009G026900 Sobic004G045100--Sobic009G026900 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic004G045100--Sobic007G174000 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic004G045100--Sobic003G177350 Sobic002G315450 Sobic002G315450 Sobic004G045100--Sobic002G315450 Sobic008G165500 Sobic008G165500 Sobic004G045100--Sobic008G165500 Sobic001G104050 Sobic001G104050 Sobic004G045100--Sobic001G104050 Sobic004G070400--Sobic001G104050 Sobic004G070400--Sobic004G045100 Sobic004G070150 Sobic004G070150 Sobic004G070400--Sobic004G070150 Sobic001G296600 Sobic001G296600 Sobic004G070400--Sobic001G296600 Sobic004G070400--Sobic004G357600 Sobic004G070400--Sobic004G139201 Sobic003G276700 Sobic003G276700 Sobic004G070400--Sobic003G276700 Sobic004G084800 Sobic004G084800 Sobic004G070400--Sobic004G084800 Sobic010G265400 Sobic010G265400 Sobic004G070400--Sobic010G265400 Sobic007G218550 Sobic007G218550 Sobic004G139201--Sobic007G218550 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic004G139201--Sobic002G185000 Sobic004G139201--Sobic009G026900 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic004G139201--Sobic001G418300 Sobic004G139201--Sobic004G084800 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic004G139201--Sobic006G107332 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic004G139201--Sobic001G025201 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic004G139201--Sobic003G076300 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic004G139201--Sobic004G026900 Sobic004G249200 Sobic004G249200 Sobic004G357600--Sobic004G249200 Sobic004G357600--Sobic001G296600 Sobic004G357600--Sobic001G104050 Sobic005G222000 Sobic005G222000 Sobic004G357600--Sobic005G222000 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic004G357600--Sobic007G174500 Sobic004G357600--Sobic007G174000 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic004G357600--Sobic004G138100 Sobic004G357600--Sobic010G265400 Sobic009G011100 Sobic009G011100 Sobic004G357600--Sobic009G011100 Sobic009G026900--Sobic003G177350 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic009G026900--Sobic009G178000 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic009G026900--Sobic001G258700 Sobic009G026900--Sobic004G026900 Sobic009G026900--Sobic004G139201 Sobic002G235000 Sobic002G235000 Sobic009G026900--Sobic002G235000 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic009G026900--Sobic001G504300 Sobic006G064900 Sobic006G064900 Sobic009G026900--Sobic006G064900 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic009G026900--Sobic006G065000 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic007G174000--Sobic008G078500 Sobic004G203633 Sobic004G203633 Sobic007G174000--Sobic004G203633 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic007G174000--Sobic003G399200 Sobic007G155950 Sobic007G155950 Sobic007G174000--Sobic007G155950 Sobic007G174000--Sobic004G357600 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic007G174000--Sobic005G182100 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic007G174000--Sobic007G225050 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic007G174000--Sobic007G137100 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic007G174000--Sobic001G093732 Sobic003G177350--Sobic009G026900 Sobic003G177350--Sobic001G258700 Sobic003G177350--Sobic003G076300 Sobic003G177350--Sobic002G235000 Sobic003G177350--Sobic007G155950 Sobic003G177350--Sobic009G178000 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic003G177350--Sobic010G028366 Sobic003G177350--Sobic001G504300 Sobic008G111150 Sobic008G111150 Sobic003G177350--Sobic008G111150 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic002G315450--Sobic006G119100 Sobic002G202350 Sobic002G202350 Sobic002G315450--Sobic002G202350 Sobic002G107700 Sobic002G107700 Sobic002G315450--Sobic002G107700 Sobic010G184201 Sobic010G184201 Sobic002G315450--Sobic010G184201 Sobic001G065400 Sobic001G065400 Sobic002G315450--Sobic001G065400 Sobic003G028700 Sobic003G028700 Sobic002G315450--Sobic003G028700 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic002G315450--Sobic003G068200 Sobic002G315450--Sobic008G165500 Sobic002G315450--Sobic001G104050 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic008G165500--Sobic004G072600 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic008G165500--Sobic004G159866 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic008G165500--Sobic007G206400 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic008G165500--Sobic005G231000 Sobic008G165500--Sobic002G202350 Sobic008G165500--Sobic007G174500 Sobic010G254401 Sobic010G254401 Sobic008G165500--Sobic010G254401 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic008G165500--Sobic002G163400 Sobic002G176700 Sobic002G176700 Sobic008G165500--Sobic002G176700 Sobic001G104050--Sobic001G296600 Sobic001G104050--Sobic010G265400 Sobic001G104050--Sobic004G357600 Sobic002G411700 Sobic002G411700 Sobic001G104050--Sobic002G411700 Sobic007G044350 Sobic007G044350 Sobic001G104050--Sobic007G044350 Sobic001G104050--Sobic004G070400 Sobic001G104050--Sobic004G249200 Sobic001G036400 Sobic001G036400 Sobic001G104050--Sobic001G036400 Sobic001G104050--Sobic004G070150
Octagon: transcription factors


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