Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G139201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMC5
Pfam -
Panther DB PTHR33068 PTHR33068:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g10550.1 : transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G218550 - -
2 Sobic.002G185000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G026900 protein kinase, putative, expressed -
4 Sobic.001G418300 - -
5 Sobic.004G084800 - -
6 Sobic.006G107332 - -
7 Sobic.001G025201 - -
8 Sobic.003G076300 - -
9 Sobic.004G026900 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed -
10 Sobic.004G073700 - -
11 Sobic.003G389500 mTERF family protein, expressed K15032: mTERF domain-containing protein, mitochondrial
12 Sobic.003G353050 - -
13 Sobic.007G059800 expressed protein -
14 Sobic.009G178000 Myb transcription factor, putative, expressed -
15 Sobic.001G267950 - -
16 Sobic.002G235000 expressed protein -
17 Sobic.010G083100 CXE carboxylesterase, putative, expressed -
18 Sobic.004G201200 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G057600 expressed protein -
20 Sobic.010G133800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G139201 Sobic004G139201 Sobic007G218550 Sobic007G218550 Sobic004G139201--Sobic007G218550 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic004G139201--Sobic002G185000 Sobic009G026900 Sobic009G026900 Sobic004G139201--Sobic009G026900 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic004G139201--Sobic001G418300 Sobic004G084800 Sobic004G084800 Sobic004G139201--Sobic004G084800 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic004G139201--Sobic006G107332 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic004G139201--Sobic001G025201 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic004G139201--Sobic003G076300 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic004G139201--Sobic004G026900 Sobic002G269700 Sobic002G269700 Sobic007G218550--Sobic002G269700 Sobic006G196700 Sobic006G196700 Sobic007G218550--Sobic006G196700 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic007G218550--Sobic002G213050 Sobic003G389500 Sobic003G389500 Sobic007G218550--Sobic003G389500 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic007G218550--Sobic006G018500 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic007G218550--Sobic005G199500 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic007G218550--Sobic006G261000 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic007G218550--Sobic007G075200 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic007G218550--Sobic007G069750 Sobic002G185000--Sobic006G107332 Sobic002G185000--Sobic001G418300 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic002G185000--Sobic001G055300 Sobic002G185000--Sobic001G025201 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic002G185000--Sobic007G059800 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic002G185000--Sobic010G133800 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic002G185000--Sobic003G372950 Sobic002G185000--Sobic004G026900 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic002G185000--Sobic004G201200 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic009G026900--Sobic003G177350 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic009G026900--Sobic009G178000 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic009G026900--Sobic001G258700 Sobic009G026900--Sobic004G026900 Sobic009G026900--Sobic004G139201 Sobic002G235000 Sobic002G235000 Sobic009G026900--Sobic002G235000 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic009G026900--Sobic001G504300 Sobic006G064900 Sobic006G064900 Sobic009G026900--Sobic006G064900 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic009G026900--Sobic006G065000 Sobic001G418300--Sobic005G199500 Sobic001G418300--Sobic006G018500 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic001G418300--Sobic001G267950 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic001G418300--Sobic003G353050 Sobic001G418300--Sobic002G185000 Sobic001G472900 Sobic001G472900 Sobic001G418300--Sobic001G472900 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic001G418300--Sobic009G214700 Sobic002G333200 Sobic002G333200 Sobic001G418300--Sobic002G333200 Sobic001G418300--Sobic003G076300 Sobic004G084800--Sobic004G139201 Sobic004G084800--Sobic007G218550 Sobic010G083200 Sobic010G083200 Sobic004G084800--Sobic010G083200 Sobic004G341500 Sobic004G341500 Sobic004G084800--Sobic004G341500 Sobic004G084800--Sobic002G269700 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic004G084800--Sobic001G005100 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic004G084800--Sobic002G162900 Sobic003G390600 Sobic003G390600 Sobic004G084800--Sobic003G390600 Sobic002G268250 Sobic002G268250 Sobic004G084800--Sobic002G268250 Sobic006G107332--Sobic001G055300 Sobic006G107332--Sobic002G185000 Sobic006G107332--Sobic003G372950 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic006G107332--Sobic005G057600 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic006G107332--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic006G107332--Sobic003G064000 Sobic006G107332--Sobic007G059800 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic006G107332--Sobic008G154200 Sobic006G107332--Sobic004G201200 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic003G353050 Sobic001G025201--Sobic007G059800 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic001G025201--Sobic003G318400 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic001G025201--Sobic003G286650 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic004G201200 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G026900 Sobic003G076300--Sobic001G418300 Sobic003G076300--Sobic002G185000 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic003G076300--Sobic010G083100 Sobic003G076300--Sobic002G235000 Sobic003G076300--Sobic009G178000 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic003G076300--Sobic010G028366 Sobic003G076300--Sobic003G177350 Sobic003G076300--Sobic001G258700 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic003G076300--Sobic004G055400 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic004G026900--Sobic004G061300 Sobic004G026900--Sobic003G286650 Sobic004G026900--Sobic001G025201 Sobic004G026900--Sobic003G353050 Sobic004G026900--Sobic007G059800 Sobic004G026900--Sobic009G178000 Sobic004G026900--Sobic002G069601 Sobic004G026900--Sobic003G318400 Sobic004G026900--Sobic005G181700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.