Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G076300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q1W0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.003G076300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G418300 - -
2 Sobic.002G185000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -
3 Sobic.010G083100 CXE carboxylesterase, putative, expressed -
4 Sobic.002G235000 expressed protein -
5 Sobic.009G178000 Myb transcription factor, putative, expressed -
6 Sobic.010G028366 - -
7 Sobic.003G177350 - -
8 Sobic.001G258700 - -
9 Sobic.004G055400 - -
10 Sobic.009G184450 - -
11 Sobic.004G026900 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G345300 expressed protein -
13 Sobic.001G472900 - -
14 Sobic.009G030701 - -
15 Sobic.010G133800 - -
16 Sobic.006G107332 - -
17 Sobic.008G167900 - -
18 Sobic.001G120750 - -
19 Sobic.004G169800 ATP synthase gamma chain, putative, expressed -
20 Sobic.003G353050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic003G076300--Sobic001G418300 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic003G076300--Sobic002G185000 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic003G076300--Sobic010G083100 Sobic002G235000 Sobic002G235000 Sobic003G076300--Sobic002G235000 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic003G076300--Sobic009G178000 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic003G076300--Sobic010G028366 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic003G076300--Sobic003G177350 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic003G076300--Sobic001G258700 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic003G076300--Sobic004G055400 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic001G418300--Sobic005G199500 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic001G418300--Sobic006G018500 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic001G418300--Sobic001G267950 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic001G418300--Sobic003G353050 Sobic001G418300--Sobic002G185000 Sobic001G472900 Sobic001G472900 Sobic001G418300--Sobic001G472900 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic001G418300--Sobic009G214700 Sobic002G333200 Sobic002G333200 Sobic001G418300--Sobic002G333200 Sobic001G418300--Sobic003G076300 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic002G185000--Sobic006G107332 Sobic002G185000--Sobic001G418300 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic002G185000--Sobic001G055300 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic002G185000--Sobic001G025201 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic002G185000--Sobic007G059800 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic002G185000--Sobic010G133800 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic002G185000--Sobic003G372950 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic002G185000--Sobic004G026900 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic002G185000--Sobic004G201200 Sobic010G083100--Sobic004G055400 Sobic009G030701 Sobic009G030701 Sobic010G083100--Sobic009G030701 Sobic010G083100--Sobic001G418300 Sobic006G281300 Sobic006G281300 Sobic010G083100--Sobic006G281300 Sobic010G083100--Sobic002G185000 Sobic010G083100--Sobic005G199500 Sobic010G083100--Sobic003G076300 Sobic010G083100--Sobic006G018500 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic010G083100--Sobic002G162900 Sobic002G235000--Sobic001G418300 Sobic006G259501 Sobic006G259501 Sobic002G235000--Sobic006G259501 Sobic002G235000--Sobic006G018500 Sobic002G235000--Sobic003G353050 Sobic002G235000--Sobic002G185000 Sobic002G235000--Sobic003G076300 Sobic002G235000--Sobic001G258700 Sobic004G345300 Sobic004G345300 Sobic002G235000--Sobic004G345300 Sobic002G235000--Sobic009G178000 Sobic009G178000--Sobic004G026900 Sobic004G169800 Sobic004G169800 Sobic009G178000--Sobic004G169800 Sobic009G178000--Sobic001G258700 Sobic009G178000--Sobic002G185000 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic009G178000--Sobic004G061300 Sobic009G178000--Sobic001G025201 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic009G178000--Sobic003G286650 Sobic009G178000--Sobic003G353050 Sobic009G178000--Sobic010G133800 Sobic010G028366--Sobic001G258700 Sobic004G238000 Sobic004G238000 Sobic010G028366--Sobic004G238000 Sobic006G171801 Sobic006G171801 Sobic010G028366--Sobic006G171801 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic010G028366--Sobic009G184450 Sobic010G157600 Sobic010G157600 Sobic010G028366--Sobic010G157600 Sobic010G028366--Sobic003G076300 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic010G028366--Sobic002G147550 Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic010G028366--Sobic003G404050 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic010G028366--Sobic010G123650 Sobic009G026900 Sobic009G026900 Sobic003G177350--Sobic009G026900 Sobic003G177350--Sobic001G258700 Sobic003G177350--Sobic003G076300 Sobic003G177350--Sobic002G235000 Sobic007G155950 Sobic007G155950 Sobic003G177350--Sobic007G155950 Sobic003G177350--Sobic009G178000 Sobic003G177350--Sobic010G028366 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic003G177350--Sobic001G504300 Sobic008G111150 Sobic008G111150 Sobic003G177350--Sobic008G111150 Sobic001G258700--Sobic009G184450 Sobic001G258700--Sobic009G178000 Sobic001G258700--Sobic010G028366 Sobic001G258700--Sobic001G504300 Sobic001G258700--Sobic003G177350 Sobic001G258700--Sobic002G235000 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic001G258700--Sobic006G065000 Sobic006G128233 Sobic006G128233 Sobic001G258700--Sobic006G128233 Sobic001G258700--Sobic010G123650 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic004G055400--Sobic010G129900 Sobic004G055400--Sobic002G162900 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic004G055400--Sobic007G069750 Sobic004G055400--Sobic005G199500 Sobic003G278800 Sobic003G278800 Sobic004G055400--Sobic003G278800 Sobic004G055400--Sobic010G083100 Sobic004G055400--Sobic006G018500 Sobic001G112300 Sobic001G112300 Sobic004G055400--Sobic001G112300 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic004G055400--Sobic002G213050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.