Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G169800.1
Synonym ATPC1, Sb04g022110
Functional annotation ATP synthase gamma chain, putative, expressed
UniProt C5XU28
Pfam PF00231
Panther DB PTHR11693 PTHR11693:SF21
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0015986; ATP synthesis coupled proton transport


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G04640 : ATPase, F1 complex, gamma subunit protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g32880.1 : ATP synthase gamma chain, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048210
Brachypodium KQK16024
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic004G169800 Sobic004G169800 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic004G169800--Sobic009G178000 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic004G169800--Sobic008G167900 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic004G169800--Sobic004G026900 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic004G169800--Sobic009G184450 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic004G169800--Sobic004G061300 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic004G169800--Sobic010G133800 Sobic001G325500 Sobic001G325500 Sobic004G169800--Sobic001G325500 Sobic006G064900 Sobic006G064900 Sobic004G169800--Sobic006G064900 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic004G169800--Sobic003G288700 Sobic009G178000--Sobic004G026900 Sobic009G178000--Sobic004G169800 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic009G178000--Sobic001G258700 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic009G178000--Sobic002G185000 Sobic009G178000--Sobic004G061300 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic009G178000--Sobic001G025201 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic009G178000--Sobic003G286650 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic009G178000--Sobic003G353050 Sobic009G178000--Sobic010G133800 Sobic008G167900--Sobic003G288700 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic008G167900--Sobic001G440401 Sobic008G167900--Sobic009G184450 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic008G167900--Sobic001G072100 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic008G167900--Sobic002G168750 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic008G167900--Sobic006G065000 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic008G167900--Sobic008G056000 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic008G167900--Sobic002G025900 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic008G167900--Sobic007G083700 Sobic004G026900--Sobic004G061300 Sobic004G026900--Sobic003G286650 Sobic004G026900--Sobic001G025201 Sobic004G026900--Sobic003G353050 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic004G026900--Sobic007G059800 Sobic004G026900--Sobic009G178000 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic004G026900--Sobic002G069601 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic004G026900--Sobic003G318400 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic004G026900--Sobic005G181700 Sobic009G184450--Sobic008G167900 Sobic009G184450--Sobic003G288700 Sobic009G184450--Sobic006G065000 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic009G184450--Sobic004G023800 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic009G184450--Sobic001G087850 Sobic009G184450--Sobic001G258700 Sobic009G184450--Sobic006G064900 Sobic009G184450--Sobic001G440401 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic009G184450--Sobic010G123650 Sobic004G061300--Sobic004G026900 Sobic004G061300--Sobic007G059800 Sobic004G061300--Sobic005G181700 Sobic004G061300--Sobic003G286650 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic004G061300--Sobic004G201200 Sobic004G061300--Sobic001G025201 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic004G061300--Sobic005G057600 Sobic004G061300--Sobic003G318400 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic004G061300--Sobic001G062200 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic010G133800--Sobic008G154200 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic010G133800--Sobic003G064000 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic010G133800--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic010G133800--Sobic004G286450 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic010G133800--Sobic006G223700 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic010G133800--Sobic003G126700 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic010G133800--Sobic006G167850 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic010G133800--Sobic002G269800 Sobic010G133800--Sobic005G057600 Sobic010G252301 Sobic010G252301 Sobic001G325500--Sobic010G252301 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic001G325500--Sobic010G045966 Sobic001G325500--Sobic002G025900 Sobic005G183900 Sobic005G183900 Sobic001G325500--Sobic005G183900 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic001G325500--Sobic010G025600 Sobic001G325500--Sobic004G061300 Sobic010G094750 Sobic010G094750 Sobic001G325500--Sobic010G094750 Sobic001G325500--Sobic004G026900 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic001G325500--Sobic008G053500 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic006G064900--Sobic001G504300 Sobic006G064900--Sobic002G025900 Sobic006G064900--Sobic006G065000 Sobic006G064900--Sobic008G056000 Sobic006G064900--Sobic009G184450 Sobic006G064900--Sobic003G288700 Sobic006G064900--Sobic001G440401 Sobic006G064900--Sobic008G167900 Sobic006G064900--Sobic001G087850 Sobic003G288700--Sobic001G440401 Sobic003G288700--Sobic008G167900 Sobic003G288700--Sobic009G184450 Sobic003G288700--Sobic008G056000 Sobic003G288700--Sobic004G023800 Sobic003G288700--Sobic001G072100 Sobic003G288700--Sobic002G168750 Sobic003G288700--Sobic006G065000 Sobic003G288700--Sobic002G025900
Octagon: transcription factors


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