Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G185000.1
Synonym SAP12, PMZ, Sb02g023300
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed
UniProt C5XBB7
Pfam PF01428
Panther DB PTHR14677 PTHR14677:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G28210 : zinc finger (AN1-like) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g21710.1 : AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G059890.1 , HORVU5Hr1G059900.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.004G295200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic002G185000--Sobic006G107332 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic002G185000--Sobic001G418300 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic002G185000--Sobic001G055300 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic002G185000--Sobic001G025201 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic002G185000--Sobic007G059800 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic002G185000--Sobic010G133800 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic002G185000--Sobic003G372950 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic002G185000--Sobic004G026900 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic002G185000--Sobic004G201200 Sobic006G107332--Sobic001G055300 Sobic006G107332--Sobic002G185000 Sobic006G107332--Sobic003G372950 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic006G107332--Sobic005G057600 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic006G107332--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic006G107332--Sobic003G064000 Sobic006G107332--Sobic007G059800 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic006G107332--Sobic008G154200 Sobic006G107332--Sobic004G201200 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic001G418300--Sobic005G199500 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic001G418300--Sobic006G018500 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic001G418300--Sobic001G267950 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic001G418300--Sobic003G353050 Sobic001G418300--Sobic002G185000 Sobic001G472900 Sobic001G472900 Sobic001G418300--Sobic001G472900 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic001G418300--Sobic009G214700 Sobic002G333200 Sobic002G333200 Sobic001G418300--Sobic002G333200 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic001G418300--Sobic003G076300 Sobic001G055300--Sobic006G107332 Sobic001G055300--Sobic005G057600 Sobic001G055300--Sobic003G372950 Sobic001G055300--Sobic007G059800 Sobic001G055300--Sobic004G286450 Sobic001G055300--Sobic003G064000 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic001G055300--Sobic001G062200 Sobic001G055300--Sobic004G201200 Sobic001G055300--Sobic008G154200 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic003G353050 Sobic001G025201--Sobic007G059800 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic001G025201--Sobic003G318400 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic001G025201--Sobic003G286650 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic004G201200 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G026900 Sobic007G059800--Sobic005G181700 Sobic007G059800--Sobic004G201200 Sobic007G059800--Sobic003G318400 Sobic007G059800--Sobic005G057600 Sobic007G059800--Sobic002G069601 Sobic007G059800--Sobic001G062200 Sobic007G059800--Sobic001G025201 Sobic007G059800--Sobic003G372950 Sobic007G059800--Sobic004G286450 Sobic010G133800--Sobic008G154200 Sobic010G133800--Sobic003G064000 Sobic010G133800--Sobic003G372950 Sobic010G133800--Sobic004G286450 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic010G133800--Sobic006G223700 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic010G133800--Sobic003G126700 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic010G133800--Sobic006G167850 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic010G133800--Sobic002G269800 Sobic010G133800--Sobic005G057600 Sobic003G372950--Sobic003G064000 Sobic003G372950--Sobic008G154200 Sobic003G372950--Sobic004G286450 Sobic003G372950--Sobic005G057600 Sobic003G372950--Sobic006G167850 Sobic003G372950--Sobic001G062200 Sobic001G443850 Sobic001G443850 Sobic003G372950--Sobic001G443850 Sobic003G372950--Sobic006G223700 Sobic007G154001 Sobic007G154001 Sobic003G372950--Sobic007G154001 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic004G026900--Sobic004G061300 Sobic004G026900--Sobic003G286650 Sobic004G026900--Sobic001G025201 Sobic004G026900--Sobic003G353050 Sobic004G026900--Sobic007G059800 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic004G026900--Sobic009G178000 Sobic004G026900--Sobic002G069601 Sobic004G026900--Sobic003G318400 Sobic004G026900--Sobic005G181700 Sobic004G201200--Sobic007G059800 Sobic004G201200--Sobic005G181700 Sobic004G201200--Sobic005G057600 Sobic004G201200--Sobic003G318400 Sobic004G201200--Sobic001G062200 Sobic004G201200--Sobic002G069601 Sobic004G201200--Sobic003G372950 Sobic004G201200--Sobic004G286450 Sobic004G201200--Sobic001G025201
Octagon: transcription factors


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