Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G061300.1
Synonym Sb04g005125
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YP27
Pfam -
Panther DB PTHR35162 PTHR35162:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g44930.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019150
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G026900 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G059800 expressed protein -
3 Sobic.005G181700 NB-ARC domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G286650 - -
5 Sobic.004G201200 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G025201 - -
7 Sobic.005G057600 expressed protein -
8 Sobic.003G318400 - -
9 Sobic.001G062200 AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G372950 - -
11 Sobic.004G149433 - -
12 Sobic.004G286450 - -
13 Sobic.002G069601 - -
14 Sobic.003G064000 expressed protein -
15 Sobic.008G166000 - -
16 Sobic.010G133800 - -
17 Sobic.008G154200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G353050 - -
19 Sobic.009G030701 - -
20 Sobic.006G167850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic004G061300--Sobic004G026900 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic004G061300--Sobic007G059800 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic004G061300--Sobic005G181700 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic004G061300--Sobic003G286650 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic004G061300--Sobic004G201200 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic004G061300--Sobic001G025201 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic004G061300--Sobic005G057600 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic004G061300--Sobic003G318400 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic004G061300--Sobic001G062200 Sobic004G026900--Sobic004G061300 Sobic004G026900--Sobic003G286650 Sobic004G026900--Sobic001G025201 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic004G026900--Sobic003G353050 Sobic004G026900--Sobic007G059800 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic004G026900--Sobic009G178000 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic004G026900--Sobic002G069601 Sobic004G026900--Sobic003G318400 Sobic004G026900--Sobic005G181700 Sobic007G059800--Sobic005G181700 Sobic007G059800--Sobic004G201200 Sobic007G059800--Sobic003G318400 Sobic007G059800--Sobic005G057600 Sobic007G059800--Sobic002G069601 Sobic007G059800--Sobic001G062200 Sobic007G059800--Sobic001G025201 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic007G059800--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic007G059800--Sobic004G286450 Sobic005G181700--Sobic007G059800 Sobic005G181700--Sobic003G318400 Sobic005G181700--Sobic004G201200 Sobic005G181700--Sobic002G069601 Sobic005G181700--Sobic005G057600 Sobic005G181700--Sobic001G062200 Sobic005G181700--Sobic001G025201 Sobic005G181700--Sobic003G372950 Sobic005G181700--Sobic004G286450 Sobic003G286650--Sobic003G353050 Sobic003G286650--Sobic001G025201 Sobic003G286650--Sobic002G069601 Sobic002G333200 Sobic002G333200 Sobic003G286650--Sobic002G333200 Sobic003G286650--Sobic004G026900 Sobic003G286650--Sobic003G318400 Sobic003G286650--Sobic007G059800 Sobic003G286650--Sobic005G181700 Sobic010G262650 Sobic010G262650 Sobic003G286650--Sobic010G262650 Sobic004G201200--Sobic007G059800 Sobic004G201200--Sobic005G181700 Sobic004G201200--Sobic005G057600 Sobic004G201200--Sobic003G318400 Sobic004G201200--Sobic001G062200 Sobic004G201200--Sobic002G069601 Sobic004G201200--Sobic003G372950 Sobic004G201200--Sobic004G286450 Sobic004G201200--Sobic001G025201 Sobic001G025201--Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic003G353050 Sobic001G025201--Sobic007G059800 Sobic001G025201--Sobic003G318400 Sobic001G025201--Sobic003G286650 Sobic001G025201--Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic004G201200 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G026900 Sobic005G057600--Sobic003G372950 Sobic005G057600--Sobic004G286450 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic005G057600--Sobic003G064000 Sobic005G057600--Sobic007G059800 Sobic005G057600--Sobic001G062200 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic005G057600--Sobic008G154200 Sobic005G057600--Sobic004G201200 Sobic005G057600--Sobic005G181700 Sobic008G166000 Sobic008G166000 Sobic005G057600--Sobic008G166000 Sobic003G318400--Sobic002G069601 Sobic003G318400--Sobic005G181700 Sobic003G318400--Sobic007G059800 Sobic003G318400--Sobic004G201200 Sobic003G318400--Sobic001G025201 Sobic003G318400--Sobic003G353050 Sobic003G318400--Sobic003G286650 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic003G318400--Sobic001G267950 Sobic003G318400--Sobic005G057600 Sobic001G062200--Sobic005G057600 Sobic001G062200--Sobic003G372950 Sobic001G062200--Sobic007G059800 Sobic001G062200--Sobic004G286450 Sobic001G062200--Sobic003G064000 Sobic001G062200--Sobic008G166000 Sobic001G062200--Sobic005G181700 Sobic001G062200--Sobic004G201200 Sobic001G062200--Sobic008G154200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.