Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G030701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R1D2
Pfam PF03140
Panther DB PTHR31549 PTHR31549:SF30
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G50120 : Plant protein of unknown function (DUF247)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g04060.1 : plant protein of unknown function domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055291
Brachypodium PNT72015
Barley -
Wheat TraesCS5D02G337600
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G353050 - -
2 Sobic.001G025201 - -
3 Sobic.005G181700 NB-ARC domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G026900 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G069601 - -
6 Sobic.004G061300 expressed protein -
7 Sobic.003G286650 - -
8 Sobic.003G318400 - -
9 Sobic.001G267950 - -
10 Sobic.002G185000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@AN1-like zinc finger domain containing protein, expressed -
11 Sobic.007G059800 expressed protein -
12 Sobic.001G418300 - -
13 Sobic.006G107332 - -
14 Sobic.010G083100 CXE carboxylesterase, putative, expressed -
15 Sobic.002G333200 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G201200 BRCA1 C Terminus domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G055300 expressed protein -
18 Sobic.006G018500 - -
19 Sobic.005G199500 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
20 Sobic.001G452400 OsFBX81 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G030701 Sobic009G030701 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic009G030701--Sobic003G353050 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic009G030701--Sobic001G025201 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic009G030701--Sobic005G181700 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic009G030701--Sobic004G026900 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic009G030701--Sobic002G069601 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic009G030701--Sobic004G061300 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic009G030701--Sobic003G286650 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic009G030701--Sobic003G318400 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic009G030701--Sobic001G267950 Sobic003G353050--Sobic001G025201 Sobic003G353050--Sobic002G069601 Sobic003G353050--Sobic003G286650 Sobic002G333200 Sobic002G333200 Sobic003G353050--Sobic002G333200 Sobic006G259501 Sobic006G259501 Sobic003G353050--Sobic006G259501 Sobic008G192200 Sobic008G192200 Sobic003G353050--Sobic008G192200 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic003G353050--Sobic001G272300 Sobic001G025201--Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic003G353050 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic001G025201--Sobic007G059800 Sobic001G025201--Sobic003G318400 Sobic001G025201--Sobic003G286650 Sobic001G025201--Sobic005G181700 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic001G025201--Sobic004G201200 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G026900 Sobic005G181700--Sobic007G059800 Sobic005G181700--Sobic003G318400 Sobic005G181700--Sobic004G201200 Sobic005G181700--Sobic002G069601 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic005G181700--Sobic005G057600 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic005G181700--Sobic001G062200 Sobic005G181700--Sobic001G025201 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic005G181700--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic005G181700--Sobic004G286450 Sobic004G026900--Sobic004G061300 Sobic004G026900--Sobic003G286650 Sobic004G026900--Sobic001G025201 Sobic004G026900--Sobic003G353050 Sobic004G026900--Sobic007G059800 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic004G026900--Sobic009G178000 Sobic004G026900--Sobic002G069601 Sobic004G026900--Sobic003G318400 Sobic004G026900--Sobic005G181700 Sobic002G069601--Sobic003G318400 Sobic002G069601--Sobic005G181700 Sobic002G069601--Sobic007G059800 Sobic002G069601--Sobic001G025201 Sobic002G069601--Sobic003G353050 Sobic002G069601--Sobic008G192200 Sobic002G069601--Sobic001G272300 Sobic004G061300--Sobic004G026900 Sobic004G061300--Sobic007G059800 Sobic004G061300--Sobic005G181700 Sobic004G061300--Sobic003G286650 Sobic004G061300--Sobic004G201200 Sobic004G061300--Sobic001G025201 Sobic004G061300--Sobic005G057600 Sobic004G061300--Sobic003G318400 Sobic004G061300--Sobic001G062200 Sobic003G286650--Sobic003G353050 Sobic003G286650--Sobic001G025201 Sobic003G286650--Sobic002G069601 Sobic003G286650--Sobic002G333200 Sobic003G286650--Sobic004G026900 Sobic003G286650--Sobic003G318400 Sobic003G286650--Sobic007G059800 Sobic003G286650--Sobic005G181700 Sobic010G262650 Sobic010G262650 Sobic003G286650--Sobic010G262650 Sobic003G318400--Sobic002G069601 Sobic003G318400--Sobic005G181700 Sobic003G318400--Sobic007G059800 Sobic003G318400--Sobic004G201200 Sobic003G318400--Sobic001G025201 Sobic003G318400--Sobic003G353050 Sobic003G318400--Sobic003G286650 Sobic003G318400--Sobic001G267950 Sobic003G318400--Sobic005G057600 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic001G267950--Sobic005G199500 Sobic001G267950--Sobic002G069601 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic001G267950--Sobic006G018500 Sobic001G267950--Sobic003G353050 Sobic007G075200 Sobic007G075200 Sobic001G267950--Sobic007G075200 Sobic001G267950--Sobic003G318400 Sobic009G214700 Sobic009G214700 Sobic001G267950--Sobic009G214700 Sobic001G267950--Sobic008G192200 Sobic003G049100 Sobic003G049100 Sobic001G267950--Sobic003G049100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.