Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G026900.1
Synonym UBC23, PFU2
Functional annotation ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RKL8
Pfam PF00179
Panther DB PTHR24067 PTHR24067:SF105
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G16920 : ubiquitin-conjugating enzyme 23
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g03520.1 : ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic004G026900--Sobic004G061300 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic004G026900--Sobic003G286650 Sobic001G025201 Sobic001G025201 Sobic004G026900--Sobic001G025201 Sobic003G353050 Sobic003G353050 Sobic004G026900--Sobic003G353050 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic004G026900--Sobic007G059800 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic004G026900--Sobic009G178000 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic004G026900--Sobic002G069601 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic004G026900--Sobic003G318400 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic004G026900--Sobic005G181700 Sobic004G061300--Sobic004G026900 Sobic004G061300--Sobic007G059800 Sobic004G061300--Sobic005G181700 Sobic004G061300--Sobic003G286650 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic004G061300--Sobic004G201200 Sobic004G061300--Sobic001G025201 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic004G061300--Sobic005G057600 Sobic004G061300--Sobic003G318400 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic004G061300--Sobic001G062200 Sobic003G286650--Sobic003G353050 Sobic003G286650--Sobic001G025201 Sobic003G286650--Sobic002G069601 Sobic002G333200 Sobic002G333200 Sobic003G286650--Sobic002G333200 Sobic003G286650--Sobic004G026900 Sobic003G286650--Sobic003G318400 Sobic003G286650--Sobic007G059800 Sobic003G286650--Sobic005G181700 Sobic010G262650 Sobic010G262650 Sobic003G286650--Sobic010G262650 Sobic001G025201--Sobic002G069601 Sobic001G025201--Sobic003G353050 Sobic001G025201--Sobic007G059800 Sobic001G025201--Sobic003G318400 Sobic001G025201--Sobic003G286650 Sobic001G025201--Sobic005G181700 Sobic001G025201--Sobic004G201200 Sobic004G295200 Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G295200 Sobic001G025201--Sobic004G026900 Sobic003G353050--Sobic001G025201 Sobic003G353050--Sobic002G069601 Sobic003G353050--Sobic003G286650 Sobic003G353050--Sobic002G333200 Sobic006G259501 Sobic006G259501 Sobic003G353050--Sobic006G259501 Sobic008G192200 Sobic008G192200 Sobic003G353050--Sobic008G192200 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic003G353050--Sobic001G272300 Sobic007G059800--Sobic005G181700 Sobic007G059800--Sobic004G201200 Sobic007G059800--Sobic003G318400 Sobic007G059800--Sobic005G057600 Sobic007G059800--Sobic002G069601 Sobic007G059800--Sobic001G062200 Sobic007G059800--Sobic001G025201 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic007G059800--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic007G059800--Sobic004G286450 Sobic009G178000--Sobic004G026900 Sobic004G169800 Sobic004G169800 Sobic009G178000--Sobic004G169800 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic009G178000--Sobic001G258700 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic009G178000--Sobic002G185000 Sobic009G178000--Sobic004G061300 Sobic009G178000--Sobic001G025201 Sobic009G178000--Sobic003G286650 Sobic009G178000--Sobic003G353050 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic009G178000--Sobic010G133800 Sobic002G069601--Sobic003G318400 Sobic002G069601--Sobic005G181700 Sobic002G069601--Sobic007G059800 Sobic002G069601--Sobic001G025201 Sobic002G069601--Sobic003G353050 Sobic002G069601--Sobic008G192200 Sobic002G069601--Sobic001G272300 Sobic003G318400--Sobic002G069601 Sobic003G318400--Sobic005G181700 Sobic003G318400--Sobic007G059800 Sobic003G318400--Sobic004G201200 Sobic003G318400--Sobic001G025201 Sobic003G318400--Sobic003G353050 Sobic003G318400--Sobic003G286650 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic003G318400--Sobic001G267950 Sobic003G318400--Sobic005G057600 Sobic005G181700--Sobic007G059800 Sobic005G181700--Sobic003G318400 Sobic005G181700--Sobic004G201200 Sobic005G181700--Sobic002G069601 Sobic005G181700--Sobic005G057600 Sobic005G181700--Sobic001G062200 Sobic005G181700--Sobic001G025201 Sobic005G181700--Sobic003G372950 Sobic005G181700--Sobic004G286450
Octagon: transcription factors


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